| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,651,293 | Δ2,422 bp | [yhiS]–yhiS | [yhiS], insH‑11, yhiS | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3651293 | 3653714 | 2422 | 119 [0] | [0] 119 | [yhiS]–yhiS | [yhiS],insH‑11,yhiS |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3651292 | 0 (0.000) | 111 (1.590) | 62/94 | 0.0 | 100% | pseudogene (2/746 nt) | yhiS | putative uncharacterized protein YhiS |
| ? | NC_000913 | 3653715 = | 0 (0.000) | intergenic (+2/‑246) | yhiS/slp | putative uncharacterized protein YhiS/starvation lipoprotein | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TAAAAGAATTCGCTTATCAAATCATTACCAGAATATAATACCATAATATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATGTAC > NC_000913/3653668‑3653764 | aatttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatAtt > 1:5317025‑M2/48‑50 (MQ=255)aatttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatAtt < 1:4451741‑M2/3‑1 (MQ=255) atttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatAtt > 1:1438553‑M2/47‑49 (MQ=255) atttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTg < 1:783189‑M2/4‑1 (MQ=255) tttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGa > 1:4506175‑M2/46‑50 (MQ=255) tttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGa > 1:5201850‑M2/46‑50 (MQ=255) ttaaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGat > 1:5556140‑M2/45‑50 (MQ=255) aaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGatta > 1:5439155‑M2/43‑50 (MQ=255) aaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGatt < 1:4141670‑M2/7‑1 (MQ=255) aaacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGatt < 1:920395‑M2/7‑1 (MQ=255) aacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGatta < 1:4840104‑M2/8‑1 (MQ=255) aacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGatta < 1:86639‑M2/8‑1 (MQ=255) aacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGatta < 1:3128890‑M2/8‑1 (MQ=255) aacatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGatta < 1:3827151‑M2/8‑1 (MQ=255) acatcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGattatt < 1:2167092‑M2/10‑1 (MQ=255) catcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGAttatta < 1:3859809‑M2/11‑1 (MQ=255) catcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGAttatta < 1:3885525‑M2/11‑1 (MQ=255) atcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAg > 1:1289550‑M2/39‑50 (MQ=255) atcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAg > 1:4719658‑M2/39‑50 (MQ=255) tcttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAg > 1:3120177‑M2/38‑49 (MQ=255) cttagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCa > 1:2213556‑M2/37‑50 (MQ=255) tagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACt > 1:900313‑M2/35‑50 (MQ=255) tagcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACt > 1:1086925‑M2/35‑50 (MQ=255) agcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGc < 1:1101977‑M2/13‑1 (MQ=255) agcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACt < 1:4306548‑M2/16‑1 (MQ=255) gcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACttt < 1:4326475‑M2/18‑1 (MQ=255) gcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACttt < 1:22281‑M2/18‑1 (MQ=255) gcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACtt > 1:5157750‑M2/33‑49 (MQ=255) gcataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACtt > 1:914044‑M2/33‑49 (MQ=255) cataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTta < 1:2828750‑M2/19‑1 (MQ=255) cataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTta < 1:5312919‑M2/19‑1 (MQ=255) cataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTta < 1:1097353‑M2/19‑1 (MQ=255) cataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTta < 1:1749247‑M2/19‑1 (MQ=255) ataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTta > 1:1393159‑M2/31‑49 (MQ=255) taaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTtat > 1:5321226‑M2/30‑49 (MQ=255) aaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATaa > 1:3859254‑M2/29‑50 (MQ=255) aaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATaa > 1:3242266‑M2/29‑50 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATaa < 1:2883008‑M2/22‑1 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAAt > 1:48419‑M2/28‑50 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAAt < 1:4470279‑M2/23‑1 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAAt < 1:2034611‑M2/23‑1 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAAt < 1:1871449‑M2/23‑1 (MQ=255) aacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATc < 1:4844654‑M2/24‑1 (MQ=255) aacaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATc < 1:913518‑M2/24‑1 (MQ=255) acaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCa > 1:586864‑M2/26‑50 (MQ=255) acaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCa < 1:5132808‑M2/25‑1 (MQ=255) acaaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCa < 1:2912059‑M2/25‑1 (MQ=255) caaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAt < 1:664031‑M2/26‑1 (MQ=255) aaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt < 1:3213876‑M2/27‑1 (MQ=255) aaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt > 1:5206424‑M2/24‑50 (MQ=255) aaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt > 1:2314906‑M2/24‑50 (MQ=255) aaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt < 1:1494520‑M2/27‑1 (MQ=255) atgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGa < 1:1341356‑M2/29‑1 (MQ=255) atgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGa < 1:4402377‑M2/29‑1 (MQ=255) atgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGa < 1:3448978‑M2/29‑1 (MQ=255) atgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGa < 1:1083556‑M2/29‑1 (MQ=255) tgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGaa < 1:5571437‑M2/30‑1 (MQ=255) tgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGaa < 1:5229536‑M2/30‑1 (MQ=255) tgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGaa < 1:1914737‑M2/30‑1 (MQ=255) atgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAAt < 1:966808‑M2/31‑1 (MQ=255) atgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAAt < 1:5383036‑M2/31‑1 (MQ=255) atgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAAt < 1:2443744‑M2/31‑1 (MQ=255) atgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAAt < 1:3693078‑M2/31‑1 (MQ=255) tgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaa < 1:2629492‑M2/33‑1 (MQ=255) tgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaa < 1:1417725‑M2/33‑1 (MQ=255) tgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaa < 1:2627113‑M2/33‑1 (MQ=255) tgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaa < 1:4125615‑M2/33‑1 (MQ=255) tgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATa > 1:2375862‑M2/18‑49 (MQ=255) tgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATa > 1:1227786‑M2/18‑49 (MQ=255) gaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaa > 1:1515044‑M2/17‑49 (MQ=255) gaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaa > 1:914408‑M2/17‑49 (MQ=255) aataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaaaa < 1:4310536‑M2/35‑1 (MQ=255) ataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaaaaa > 1:2961949‑M2/15‑50 (MQ=255) ataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaaaaa < 1:2697166‑M2/36‑1 (MQ=255) ataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaaaaa > 1:3569046‑M2/15‑50 (MQ=255) taaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaaaaa > 1:4896120‑M2/14‑49 (MQ=255) aggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaaaaa > 1:380039‑M2/12‑47 (MQ=255) aggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATa < 1:2613287‑M2/38‑1 (MQ=255) aggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAg < 1:3697176‑M2/39‑1 (MQ=255) ggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGa < 1:590542‑M2/40‑1 (MQ=255) gaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAt > 1:3701883‑M2/10‑50 (MQ=255) attttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAttt > 1:5532617‑M2/8‑50 (MQ=255) attttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAttt < 1:2695877‑M2/43‑1 (MQ=255) ttttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAtttt < 1:4088153‑M2/44‑1 (MQ=255) ttttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAtttt < 1:2099054‑M2/44‑1 (MQ=255) ttttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAttt > 1:3153547‑M2/7‑49 (MQ=255) ttttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAttt > 1:2853593‑M2/7‑49 (MQ=255) ttttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGAttt > 1:2729416‑M2/7‑49 (MQ=255) tttatATTTATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTa > 1:757400‑M2/6‑50 (MQ=255) tatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTAt < 1:1060460‑M2/46‑1 (MQ=255) tatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTAt < 1:1271827‑M2/46‑1 (MQ=255) tatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATg > 1:4977056‑M2/4‑50 (MQ=255) atATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATg > 1:2847796‑M2/3‑49 (MQ=255) atATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATg > 1:1210151‑M2/3‑49 (MQ=255) tATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATGt < 1:4737940‑M2/48‑1 (MQ=255) tATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATGTa < 1:244253‑M2/49‑1 (MQ=255) tATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATGTa > 1:1042358‑M2/2‑50 (MQ=255) tATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATGTa > 1:1989502‑M2/2‑50 (MQ=255) tATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATGTa < 1:3719292‑M2/49‑1 (MQ=255) atTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATGTAc > 1:4111969/1‑50 (MQ=255) | TAAAAGAATTCGCTTATCAAATCATTACCAGAATATAATACCATAATATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAAATAGATTTTATGTAC > NC_000913/3653668‑3653764 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |