| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 603,467 | Δ5,885 bp | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG], nfsB, ybdF, ybdJ, ybdK, sokE, hokE, insL‑2 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 603467 | 609351 | 5885 | 76 [0] | [0] 76 | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG],nfsB,ybdF,ybdJ,ybdK,sokE,hokE,insL‑2 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 603466 | 0 (0.000) | 73 (1.320) | 49/94 | 0.0 | 100% | coding (1198/1248 nt) | ybdG | miniconductance mechanosensitive channel YbdG |
| ? | NC_000913 | 609352 = | 0 (0.000) | intergenic (+175/+107) | insL‑2/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyl transferase EntD | |||||
ACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/603418‑603466‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCT > NC_000913/609352‑609400 ACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAG > 1:2565148/1‑50 CTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGT < 1:901861/50‑1 CTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAG > 1:1712475/1‑49 TGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGT > 1:3533541/1‑49 TGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGT > 1:3802406/1‑49 CTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAAT > 1:2527162/1‑50 CTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAAT > 1:1989770/1‑50 CTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTA < 1:2830141/48‑1 CTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTA < 1:2906459/48‑1 CTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTA < 1:3245027/48‑1 TTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATC > 1:708474/1‑50 TAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCC > 1:3219014/1‑50 TAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCC > 1:3607459/1‑50 AAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCC > 1:1648529/1‑50 AAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCC > 1:1432265/1‑50 AATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCC < 1:3571427/50‑1 ATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCG > 1:1774801/1‑50 ATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCG > 1:4180554/1‑50 TGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCG > 1:3066970/1‑49 GCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCA > 1:4189275/1‑50 GCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCA > 1:443568/1‑50 CACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCAT < 1:880619/50‑1 CACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCA < 1:2455891/49‑1 ACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATA > 1:3320355/1‑50 ACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATA > 1:2687572/1‑50 ACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATA < 1:2660865/50‑1 ACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATA > 1:721897/1‑50 CCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATAT < 1:4080652/50‑1 CCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATAT < 1:3659605/50‑1 CCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATC > 1:351070/1‑50 CCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATC > 1:748792/1‑50 CGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCC < 1:4300869/50‑1 CGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCC > 1:104792/1‑50 CGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCC < 1:3458613/50‑1 GCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCG < 1:3371232/50‑1 GCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCG > 1:2930916/1‑50 GCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCG < 1:1032596/50‑1 CCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGG < 1:2565488/50‑1 CCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGG > 1:1307800/1‑50 CCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGG < 1:2047110/50‑1 CAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGT < 1:3774037/50‑1 AGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTT > 1:3097054/1‑50 AGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTT > 1:1958088/1‑50 AGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT > 1:302927/1‑50 GAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTC < 1:2942720/50‑1 GAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT > 1:2823800/1‑49 AGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCA < 1:2560189/50‑1 GCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAG < 1:680159/50‑1 CGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGG < 1:1934948/50‑1 GAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:1009141/1‑50 ATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCA < 1:1347749/50‑1 ATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:3085964/1‑48 ATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:1345702/1‑48 TATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAG > 1:2427633/1‑50 TATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAG > 1:2702661/1‑50 ATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAG > 1:3125384/1‑49 CATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAT > 1:695847/1‑50 CATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAT > 1:2621846/1‑50 ATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATG > 1:160438/1‑50 TTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGG < 1:4044483/50‑1 GCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGT < 1:1476068/49‑1 GCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGT < 1:4240230/49‑1 CCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAA < 1:87908/50‑1 CCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAA < 1:3907458/50‑1 CCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTA < 1:3812158/49‑1 GTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGC < 1:679559/50‑1 GTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGG > 1:2674957/1‑49 GTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGG > 1:1849562/1‑49 TGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAC > 1:3249286/1‑50 GGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACC > 1:2616086/1‑50 GGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACC > 1:3119636/1‑50 GCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCT < 1:3360122/50‑1 GCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCT < 1:3409698/50‑1 GAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGC > 1:2992168/1‑50 AGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCT < 1:890077/50‑1 AGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCT < 1:1028115/50‑1 ACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/603418‑603466‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCT > NC_000913/609352‑609400 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |