| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,388,889 | Δ9,734 bp | ycjG–[uspE] | ycjG, mpaA, ymjC, ymjD, ycjY, pgrR, mppA, ynaI, insH‑4, ynaJ, [uspE] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1388889 | 1398622 | 9734 | 110 [0] | [0] 109 | ycjG–[uspE] | ycjG,mpaA,ymjC,ymjD,ycjY,pgrR,mppA,ynaI,insH‑4,ynaJ,[uspE] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1388888 | 0 (0.000) | 107 (1.380) | 62/96 | 0.0 | 100% | intergenic (‑77/‑42) | tpx/ycjG | lipid hydroperoxide peroxidase/L‑Ala‑D/L‑Glu epimerase |
| ? | NC_000913 | 1398623 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+151) | uspE/fnr | universal stress protein with a role cellular motility/DNA‑binding transcriptional dual regulator FNR | |||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1388840‑1388888‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > NC_000913/1398623‑1398670 ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT < 1:365798/49‑1ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTAAATAACACAGCAAACGCTATT < 1:4031608/49‑1 CGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTAC < 1:285961/50‑1 GTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACA < 1:5156574/50‑1 GTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:236894/1‑48 TCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAG > 1:5055815/1‑50 TCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAG < 1:1589483/50‑1 TCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAG < 1:3793340/50‑1 CACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGG > 1:1116537/1‑50 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGG > 1:1415808/1‑50 ACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTC < 1:5818683/50‑1 ACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTC > 1:3713536/1‑50 CCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCT < 1:1231506/50‑1 CCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCT > 1:3318731/1‑50 CCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCT > 1:3498547/1‑50 CTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTC < 1:613544/50‑1 TAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCC > 1:1566537/1‑50 TAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCC > 1:4975029/1‑50 AGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCT > 1:4293235/1‑50 GTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCT > 1:4474208/1‑49 GTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCT > 1:3104578/1‑49 GTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCC < 1:3370911/48‑1 GTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCC < 1:2302605/48‑1 TTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTA > 1:527074/1‑50 TTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTA > 1:437367/1‑49 TTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTA > 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ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACT < 1:4411244/49‑1 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACT < 1:1505857/49‑1 TGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGT > 1:2845656/1‑49 TGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGT > 1:1602510/1‑49 GTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTC > 1:4656690/1‑49 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAA > 1:1001423/1‑50 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAA < 1:1102227/50‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAA > 1:245524/1‑50 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCA < 1:1376723/49‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCA < 1:5339527/49‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCA < 1:2883436/49‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTC < 1:4915435/48‑1 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:2546772/1‑50 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC < 1:339600/49‑1 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC < 1:3932588/49‑1 ATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGC < 1:2348059/50‑1 TAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCA < 1:3686299/50‑1 ACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGT > 1:2392317/1‑50 ACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGT < 1:3153097/50‑1 ACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGT < 1:4538254/50‑1 CACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTT < 1:101119/50‑1 CACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTT < 1:2166330/50‑1 ACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTT < 1:6001876/50‑1 ACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTT < 1:5212315/50‑1 ACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTT > 1:680428/1‑50 CAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG < 1:2326177/50‑1 CAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG > 1:5350263/1‑50 AGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGT < 1:1490104/50‑1 AGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG > 1:2166926/1‑49 AGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG > 1:4842678/1‑49 AGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG > 1:2164662/1‑49 GCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTA < 1:4400572/50‑1 GCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTA < 1:5191073/50‑1 GCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTA < 1:1516339/50‑1 CAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAA > 1:4257401/1‑50 CAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAA < 1:464443/50‑1 CAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAA < 1:4123372/50‑1 AAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAT > 1:5940788/1‑50 AACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATT < 1:2132877/50‑1 AACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATT < 1:3189169/50‑1 AACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATT < 1:4735354/50‑1 AACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATT < 1:3954842/50‑1 AACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAT > 1:3306202/1‑49 AACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAT > 1:5584250/1‑49 AACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAT > 1:3898592/1‑49 ACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATT > 1:5286519/1‑49 CGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTA > 1:1291869/1‑49 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAA < 1:1985975/50‑1 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAA < 1:5572208/50‑1 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:2625595/1‑49 CTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:166476/1‑48 CTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:718390/1‑48 CTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:1743662/1‑48 TATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:2276398/1‑47 TATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:3006001/1‑47 ATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:4381768/1‑46 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT < 1:1267002/50‑1 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > 1:4755913/1‑50 TTACAGGGGCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > 1:4363781/1‑50 TACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > 1:5701983/1‑49 ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1388840‑1388888‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > NC_000913/1398623‑1398670 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |