Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 3,850,891 G→A Q68* (CAA→TAA)  ilvN ← acetohydroxy acid synthase I subunit IlvN

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0009133,850,8910GA100.0% 269.9 / NA 67Q68* (CAA→TAA) ilvNacetohydroxy acid synthase I subunit IlvN
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (41/26);  total (41/26)

GGACTGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAGTAGC  >  NC_000913/3850844‑3850934
                                               |                                           
ggaCTGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGc                                           <  1:2622076/50‑1 (MQ=255)
  aCTGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCt                                          >  1:5624800/1‑49 (MQ=255)
  aCTGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCt                                          >  1:4013154/1‑49 (MQ=255)
   cTGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTa                                        >  1:3395270/1‑50 (MQ=255)
   cTGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTa                                        >  1:3930942/1‑50 (MQ=255)
   cTGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTa                                        >  1:1880837/1‑50 (MQ=255)
    tGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTat                                       >  1:4564621/1‑50 (MQ=255)
    tGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTat                                       >  1:5363295/1‑50 (MQ=255)
    tGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTat                                       >  1:3497519/1‑50 (MQ=255)
    tGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTat                                       >  1:2268803/1‑50 (MQ=255)
    tGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTat                                       >  1:1956316/1‑50 (MQ=255)
     gATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTat                                       >  1:4036356/1‑49 (MQ=255)
     gATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTat                                       >  1:3382942/1‑49 (MQ=255)
      aTTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTatca                                     <  1:673373/50‑1 (MQ=255)
      aTTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTatca                                     <  1:740774/50‑1 (MQ=255)
      aTTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTatc                                      <  1:6022521/49‑1 (MQ=255)
       ttACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTatcat                                    >  1:2135524/1‑50 (MQ=255)
       ttACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTatcat                                    <  1:4937502/50‑1 (MQ=255)
        tACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTatcatc                                   >  1:2974536/1‑50 (MQ=255)
          cGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCt                                  <  1:248338/49‑1 (MQ=255)
          cGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCt                                  <  1:1560355/49‑1 (MQ=255)
          cGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCt                                  <  1:5003749/49‑1 (MQ=255)
          cGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTg                                 <  1:2521309/50‑1 (MQ=255)
            cTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCt                               >  1:1154417/1‑50 (MQ=255)
               cACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTc                              >  1:2228995/1‑48 (MQ=255)
                aCTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTc                              >  1:3836046/1‑47 (MQ=255)
                 cTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGa                          <  1:1285922/50‑1 (MQ=255)
                 cTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGa                          >  1:3134989/1‑50 (MQ=255)
                  tttCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGAc                         >  1:5723724/1‑50 (MQ=255)
                    tCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGAc                         <  1:1546517/48‑1 (MQ=255)
                    tCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGAc                         <  1:1725989/48‑1 (MQ=255)
                    tCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGc                       >  1:4613793/1‑50 (MQ=255)
                     cACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCt                      >  1:4653360/1‑50 (MQ=255)
                      aCGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCt                      <  1:5812873/49‑1 (MQ=255)
                      aCGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCt                      <  1:3635752/49‑1 (MQ=255)
                      aCGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTg                     <  1:315662/50‑1 (MQ=255)
                      aCGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTg                     <  1:1625334/50‑1 (MQ=255)
                        gACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgt                   >  1:4368025/1‑50 (MQ=255)
                        gACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgt                   >  1:2121665/1‑50 (MQ=255)
                         aCATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgtc                  <  1:5878191/50‑1 (MQ=255)
                          cATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgtcg                 >  1:3767606/1‑50 (MQ=255)
                          cATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgtcg                 >  1:3111241/1‑50 (MQ=255)
                           aTCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgtcgt                >  1:409157/1‑50 (MQ=255)
                              ttCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCAt             >  1:952130/1‑50 (MQ=255)
                               tCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCAtt            >  1:4256132/1‑50 (MQ=255)
                                 cAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTg           <  1:2785927/49‑1 (MQ=255)
                                 cAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGa          <  1:1661374/50‑1 (MQ=255)
                                  aGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGAc         >  1:3653654/1‑50 (MQ=255)
                                   gCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGAc         >  1:2631662/1‑49 (MQ=255)
                                    cTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGAc         >  1:1618467/1‑48 (MQ=255)
                                    cTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGAc         >  1:3572334/1‑48 (MQ=255)
                                    cTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCa       <  1:3955307/50‑1 (MQ=255)
                                    cTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCa       <  1:2193908/50‑1 (MQ=255)
                                     ttATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAg      >  1:892305/1‑50 (MQ=255)
                                     ttATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAg      >  1:619251/1‑50 (MQ=255)
                                       aTCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAg      >  1:5419703/1‑48 (MQ=255)
                                        tCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAGTa    <  1:1484626/49‑1 (MQ=255)
                                        tCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAGTa    <  1:2814452/49‑1 (MQ=255)
                                        tCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAGTAg   <  1:630433/50‑1 (MQ=255)
                                        tCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAGTAg   <  1:456691/50‑1 (MQ=255)
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                                         cGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAGTAGc  >  1:4143162/1‑50 (MQ=255)
                                         cGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAGTAGc  >  1:1543622/1‑50 (MQ=255)
                                          gATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAGTAGc  <  1:5593454/49‑1 (MQ=255)
                                          gATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAGTAGc  >  1:5986528/1‑49 (MQ=255)
                                           aTTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAGTAGc  >  1:4539828/1‑48 (MQ=255)
                                               |                                           
GGACTGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAGTAGC  >  NC_000913/3850844‑3850934

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: