| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 603,467 | Δ5,885 bp | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG], nfsB, ybdF, ybdJ, ybdK, sokE, hokE, insL‑2 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 603467 | 609351 | 5885 | 60 [0] | [0] 61 | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG],nfsB,ybdF,ybdJ,ybdK,sokE,hokE,insL‑2 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 603466 | 0 (0.000) | 59 (1.200) | 43/94 | 0.0 | 100% | coding (1198/1248 nt) | ybdG | miniconductance mechanosensitive channel YbdG |
| ? | NC_000913 | 609352 = | 0 (0.000) | intergenic (+175/+107) | insL‑2/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyl transferase EntD | |||||
TTACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/603416‑603466‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCT > NC_000913/609352‑609400 TTACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCG < 1:3872457/50‑1 ACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAG > 1:885956/1‑50 ACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAG > 1:3034561/1‑50 ACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAG > 1:810735/1‑50 CTGCTTAAATGCCCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAG < 1:832103/49‑1 TGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGT > 1:2520599/1‑49 TGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGT > 1:447652/1‑49 gTTAAAGGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAA < 1:3010803/48‑1 CTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAAT < 1:2450838/50‑1 TAAATCCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCC > 1:2891044/1‑50 ATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCG > 1:142090/1‑50 TGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCG > 1:3149683/1‑49 CACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCAT < 1:694110/50‑1 CCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATAT < 1:3319138/50‑1 CGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCC < 1:2135971/50‑1 CGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCC < 1:2665570/50‑1 GCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCG > 1:2626151/1‑50 CAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGT < 1:402212/50‑1 CAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGT > 1:655510/1‑50 CAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGT > 1:1352039/1‑50 CAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGT > 1:2762537/1‑50 AGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTT < 1:2454878/50‑1 AGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTT > 1:251866/1‑50 AGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTT < 1:2723853/50‑1 AGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGAGAGTAATCCCCGCATATCCGGTT < 1:2104426/50‑1 GAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTG > 1:2974071/1‑50 GAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTG > 1:302978/1‑50 AGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT > 1:827662/1‑50 GAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT > 1:3714930/1‑49 AGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT > 1:1282495/1‑48 AGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT > 1:2004643/1‑48 GCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAG > 1:3700205/1‑50 GCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAG < 1:3631276/50‑1 GCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAG < 1:982176/50‑1 CGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGG < 1:1074985/50‑1 tAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:2387797/2‑50 GAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:348495/1‑50 TATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAG < 1:1760011/50‑1 TATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAG > 1:195754/1‑50 ATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAG > 1:3802940/1‑49 ATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAG > 1:2868923/1‑49 TCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGA > 1:3551999/1‑50 TCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGA < 1:3510459/50‑1 ATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATG > 1:1131075/1‑50 ATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATG > 1:474439/1‑50 ATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATG < 1:3436595/50‑1 ATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAT < 1:2597560/49‑1 ATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAT < 1:476834/49‑1 GCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGT < 1:3055961/49‑1 GCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGT > 1:2314538/1‑49 CCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTA < 1:2138381/49‑1 CCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGT > 1:3848195/1‑48 CGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAG < 1:3399708/50‑1 GGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGG > 1:3789194/1‑50 GTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGG > 1:3230319/1‑49 TTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCA < 1:3179850/50‑1 TGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAC > 1:3477656/1‑50 GGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACC > 1:1785917/1‑50 GGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAC < 1:1099503/49‑1 CGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTG > 1:133364/1‑50 AGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCT < 1:30411/50‑1 TTACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/603416‑603466‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCT > NC_000913/609352‑609400 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |