Predicted mutation
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RA	NC_000913	3,850,891	G→A	Q68* (CAA→TAA)	ilvN ←	acetohydroxy acid synthase I subunit IlvN

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*	NC_000913	3,850,891	0	G	A	100.0%	242.5 / NA	60	Q68* (CAA→TAA)	ilvN	acetohydroxy acid synthase I subunit IlvN
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (32/28);  total (32/28)

ACTGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAGTAGCCA  >  NC_000913/3850846‑3850936                                              |                                              aCTGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCtt                                           <  1:1421872/50‑1 (MQ=255)   tGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTat                                         >  1:1156942/1‑50 (MQ=255)    gATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTat                                         >  1:1025625/1‑49 (MQ=255)     aTTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTatca                                       >  1:3013859/1‑50 (MQ=255)     aTTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTatca                                       >  1:1161912/1‑50 (MQ=255)     aTTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTatca                                       <  1:2786060/50‑1 (MQ=255)     aTTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTatca                                       <  1:83022/50‑1 (MQ=255)     aTTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTatca                                       <  1:3868001/50‑1 (MQ=255)     aTTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTat                                         <  1:2534029/48‑1 (MQ=255)     aTTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTat                                         <  1:3707933/48‑1 (MQ=255)     aTTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTCatc                                        <  1:419586/49‑1 (MQ=38)      ttACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTatcat                                      <  1:3203512/50‑1 (MQ=255)      ttACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTatcat                                      <  1:367955/50‑1 (MQ=255)       tACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTatcatc                                     >  1:606953/1‑50 (MQ=255)       tACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTatcatc                                     >  1:1988111/1‑50 (MQ=255)         cGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCt                                    <  1:3962862/49‑1 (MQ=255)           cTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCt                                 >  1:2079250/1‑50 (MQ=255)           cTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCt                                 >  1:2823078/1‑50 (MQ=255)             gCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTc                                >  1:917267/1‑49 (MQ=255)                   tCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGAc                           <  1:1120719/48‑1 (MQ=255)                   tCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACg                          <  1:2811950/49‑1 (MQ=255)                   tCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACg                          <  1:935906/49‑1 (MQ=255)                   tCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGc                         >  1:3383725/1‑50 (MQ=255)                     aCGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCt                        <  1:3153039/49‑1 (MQ=255)                     aCGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTg                       >  1:2010782/1‑50 (MQ=255)                     aCGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTg                       >  1:2973735/1‑50 (MQ=255)                     aCGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTg                       <  1:2350066/50‑1 (MQ=255)                      cGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTgg                      >  1:2431577/1‑50 (MQ=255)                       gACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgt                     >  1:2703122/1‑50 (MQ=255)                       gACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgt                     >  1:603777/1‑50 (MQ=255)                        aCATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgtc                    <  1:1528284/50‑1 (MQ=255)                        aCATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgtc                    <  1:3039676/50‑1 (MQ=255)                        aCATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgtc                    >  1:451351/1‑50 (MQ=255)                        aCATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgtc                    <  1:1097890/50‑1 (MQ=255)                         cATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgtcg                   >  1:3563905/1‑50 (MQ=255)                         cATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgtcg                   <  1:3529989/50‑1 (MQ=255)                          aTCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgtcgt                  >  1:1041923/1‑50 (MQ=255)                            cTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCa                >  1:746899/1‑50 (MQ=255)                            cTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCa                >  1:658181/1‑50 (MQ=255)                               ccAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgtcgtc                 <  1:824692/46‑1 (MQ=255)                               ccAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgtcgtc                 <  1:144396/46‑1 (MQ=255)                               ccAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCa                <  1:210546/47‑1 (MQ=255)                               ccAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCAt               <  1:1892349/48‑1 (MQ=255)                                  gCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGAc           >  1:3269349/1‑49 (MQ=255)                                   cTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGAc           >  1:3423518/1‑48 (MQ=255)                                   cTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCa         <  1:3420804/50‑1 (MQ=255)                                   cTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCa         <  1:2927442/50‑1 (MQ=255)                                    ttATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAg        >  1:1782968/1‑50 (MQ=255)                                    ttATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAg        >  1:776418/1‑50 (MQ=255)                                    ttATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAg        >  1:1674516/1‑50 (MQ=255)                                     tATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAg        >  1:2472406/1‑49 (MQ=255)                                     tATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAg        >  1:3622364/1‑49 (MQ=255)                                      aTCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAg        >  1:2751748/1‑48 (MQ=255)                                      aTCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAGt       <  1:383483/49‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑