Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 4,354,915 G→A intergenic (‑198/+39) lysU ← / ← dtpC lysine‑‑tRNA ligase/Ap4A synthetase/Ap3A synthetase/dipeptide/tripeptide:H(+) symporter DtpC

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  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0009134,354,9150GA100.0% 218.7 / NA 55intergenic (‑198/+39)lysU/dtpClysine‑‑tRNA ligase/Ap4A synthetase/Ap3A synthetase/dipeptide/tripeptide:H(+) symporter DtpC
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (27/28);  total (27/28)

ATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCG  >  NC_000913/4354869‑4354960
                                              |                                             
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 tGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTAAAAg                                           >  1:1593087/1‑50 (MQ=255)
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   gTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTAAAAGt                                          <  1:327610/49‑1 (MQ=255)
   gTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTAAAAGt                                          >  1:3409995/1‑49 (MQ=255)
   gTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTAAAAGt                                          <  1:2709019/49‑1 (MQ=255)
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     ttAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTAAAAGTTaa                                       >  1:3286557/1‑50 (MQ=255)
      tAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTAAAAGTTaa                                       <  1:826470/49‑1 (MQ=255)
      tAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTAAAAGTTaa                                       <  1:1361292/49‑1 (MQ=255)
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        aaTGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTAAAAGTTAAtt                                     >  1:2784014/1‑49 (MQ=255)
        aaTGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTAAAAGTTAAtt                                     <  1:3862037/49‑1 (MQ=255)
         aTGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTAAAAGTTAATTTa                                   <  1:2806418/50‑1 (MQ=255)
         aTGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTAAAAGTTAATTTa                                   <  1:3674775/50‑1 (MQ=255)
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           gACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTAAAAGTTAATTTAtt                                 >  1:1263190/1‑50 (MQ=255)
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            aCTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTAAAAGTTAATTTAtt                                 <  1:1414511/49‑1 (MQ=255)
            aCTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTAAAAGTTAATTTATTc                                <  1:3519960/50‑1 (MQ=255)
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                    aTCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTAAAAGTTAATTTATTCATAACCaa                        <  1:3891131/50‑1 (MQ=255)
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                           tttGTTAGTGTTATAAACTAAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGtttt                 <  1:3293925/50‑1 (MQ=255)
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                             tGTTAGTGTTATAAACTAAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGttttt                <  1:3349520/49‑1 (MQ=255)
                             tGTTAGTGTTATAAACTAAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGttttt                <  1:3313742/49‑1 (MQ=255)
                             tGTTAGTGTTATAAACTAAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGttttt                <  1:1181726/49‑1 (MQ=255)
                             tGTTAGTGTTATAAACTAAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTa               >  1:1776070/1‑50 (MQ=255)
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                                tAGTGTTATAAACTAAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGa            >  1:2258152/1‑50 (MQ=255)
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                                  gtgtTATAAACTAAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGAc           <  1:3362111/49‑1 (MQ=255)
                                   tgtTATAAACTAAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAg         >  1:1332094/1‑50 (MQ=255)
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                                      tataAACTAAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGtt       >  1:979649/1‑49 (MQ=255)
                                        taAACTAAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAAt    <  1:3921716/50‑1 (MQ=255)
                                          aaCTAAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCg  >  1:3645693/1‑50 (MQ=255)
                                          aaCTAAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCg  <  1:2714296/50‑1 (MQ=255)
                                          aaCTAAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCg  >  1:1992385/1‑50 (MQ=255)
                                              |                                             
ATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCG  >  NC_000913/4354869‑4354960

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: