Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 3,850,891 G→A Q68* (CAA→TAA)  ilvN ← acetohydroxy acid synthase I subunit IlvN

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0009133,850,8910GA100.0% 243.5 / NA 60Q68* (CAA→TAA) ilvNacetohydroxy acid synthase I subunit IlvN
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (37/23);  total (37/23)

GGACTGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAGTAGCCA  >  NC_000913/3850844‑3850936
                                               |                                             
ggaCTGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGc                                             >  1:2285117/1‑50 (MQ=255)
 gaCTGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCt                                            >  1:2648503/1‑50 (MQ=255)
  aCTGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCt                                            >  1:2977754/1‑49 (MQ=255)
  aCTGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCt                                            >  1:3562729/1‑49 (MQ=255)
   cTGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTa                                          <  1:181819/50‑1 (MQ=255)
    tGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTat                                         >  1:877859/1‑50 (MQ=255)
      aTTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTatca                                       <  1:918883/50‑1 (MQ=255)
      aTTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTatca                                       <  1:139866/50‑1 (MQ=255)
      aTTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTat                                         <  1:1775242/48‑1 (MQ=255)
         aCGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTatcatc                                     <  1:1522627/49‑1 (MQ=255)
         aCGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCt                                    >  1:392319/1‑50 (MQ=255)
         aCGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCt                                    >  1:403042/1‑50 (MQ=255)
         aCGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCt                                    >  1:757425/1‑50 (MQ=255)
          cGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCt                                    <  1:3098158/49‑1 (MQ=255)
          cGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCt                                    <  1:188769/49‑1 (MQ=255)
          cGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTg                                   >  1:20139/1‑50 (MQ=255)
          cGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTg                                   <  1:2167646/50‑1 (MQ=255)
          cGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTg                                   >  1:250701/1‑50 (MQ=255)
            cTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCt                                 >  1:1725959/1‑50 (MQ=255)
            cTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCt                                 <  1:3827769/50‑1 (MQ=255)
            cTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCt                                 <  1:2272130/50‑1 (MQ=255)
               cACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTcc                               <  1:857235/49‑1 (MQ=255)
               cACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTc                                >  1:1670619/1‑48 (MQ=255)
                 cTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGa                            >  1:2531718/1‑50 (MQ=255)
                 cTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGa                            >  1:1186722/1‑50 (MQ=255)
                    tCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGAc                           <  1:1513055/48‑1 (MQ=255)
                    tCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGAc                           <  1:1462701/48‑1 (MQ=255)
                     cACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCt                        >  1:2747149/1‑50 (MQ=255)
                      aCGACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTg                       <  1:989124/50‑1 (MQ=255)
                        gACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgt                     >  1:2885391/1‑50 (MQ=255)
                        gACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgt                     >  1:1348306/1‑50 (MQ=255)
                        gACATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgt                     >  1:3273224/1‑50 (MQ=255)
                         aCATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgtc                    <  1:3683892/50‑1 (MQ=255)
                         aCATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgtc                    >  1:3557279/1‑50 (MQ=255)
                          cATCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgtcg                   <  1:3469361/50‑1 (MQ=255)
                           aTCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgtcgt                  >  1:3905826/1‑50 (MQ=255)
                           aTCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgtcgt                  >  1:3042443/1‑50 (MQ=255)
                           aTCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgtcgt                  <  1:3752592/50‑1 (MQ=255)
                           aTCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgtcgt                  >  1:3365512/1‑50 (MQ=255)
                            tCTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGgtcgt                  >  1:2957123/1‑49 (MQ=255)
                             cTTCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCa                >  1:2697381/1‑50 (MQ=255)
                              ttCCAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCAt               >  1:3096392/1‑50 (MQ=255)
                                ccAGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCAtt              <  1:2751240/49‑1 (MQ=255)
                                  aGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGAc           >  1:2101154/1‑50 (MQ=255)
                                  aGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGAc           >  1:2954719/1‑50 (MQ=255)
                                  aGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGAc           <  1:1790907/50‑1 (MQ=255)
                                  aGCTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGAc           >  1:724387/1‑50 (MQ=255)
                                    cTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGAc           >  1:3393593/1‑48 (MQ=255)
                                    cTTATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCa         <  1:1347226/50‑1 (MQ=255)
                                     ttATCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAg        >  1:2869570/1‑50 (MQ=255)
                                       aTCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAg        >  1:3701841/1‑48 (MQ=255)
                                       aTCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAg        >  1:2844913/1‑48 (MQ=255)
                                       aTCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAg        >  1:4020487/1‑48 (MQ=255)
                                        tCGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAGTAg     >  1:1049543/1‑50 (MQ=255)
                                         cGATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAGTAGc    >  1:4431905/1‑50 (MQ=255)
                                          gATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAGTAGc    <  1:3380537/49‑1 (MQ=255)
                                          gATTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAGTAGc    >  1:3441438/1‑49 (MQ=255)
                                           gtttAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAGTAGCCa  <  1:1597220/49‑1 (MQ=255)
                                           aTTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAGTAGc    >  1:1791212/1‑48 (MQ=255)
                                           aTTTAGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAGTAGCCa  <  1:1623982/50‑1 (MQ=255)
                                               |                                             
GGACTGATTACGCTGCACTTTCACGACATCTTCCAGCTTATCGATTTGGCTTATCATCTGCTCCAGACGCTGGTCGTCATTGACCAGTAGCCA  >  NC_000913/3850844‑3850936

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: