| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 603,467 | Δ5,885 bp | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG], nfsB, ybdF, ybdJ, ybdK, sokE, hokE, insL‑2 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 603467 | 609351 | 5885 | 120 [0] | [0] 117 | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG],nfsB,ybdF,ybdJ,ybdK,sokE,hokE,insL‑2 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 603466 | 0 (0.000) | 111 (1.020) | 63/94 | 0.0 | 100% | coding (1198/1248 nt) | ybdG | miniconductance mechanosensitive channel YbdG |
| ? | NC_000913 | 609352 = | 0 (0.000) | intergenic (+175/+107) | insL‑2/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyl transferase EntD | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
ACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGACTGATGAAGTCGCAGACCAAACTCTTCGACAATCGCAAATATGTGATCG > NC_000913/603418‑603515 | aCTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAg > 1:2828343‑M1/1‑49 (MQ=255)aCTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAg > 1:7990173‑M1/1‑49 (MQ=255)aCTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGA < 1:2144099‑M1/49‑1 (MQ=255)aCTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGA < 1:311551‑M1/49‑1 (MQ=255)aCTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGA < 1:6521755‑M1/49‑1 (MQ=255)aCTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGA < 1:8542714‑M1/49‑1 (MQ=255) cTGCTTAAATGCCCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgt < 1:4299465‑M1/50‑3 (MQ=255) cTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgt < 1:4412717‑M1/50‑3 (MQ=255) cTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAg < 1:4135662‑M1/49‑2 (MQ=255) cTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaat > 1:5395725‑M1/1‑45 (MQ=255) cTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaa < 1:1623374‑M1/49‑5 (MQ=255) 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aCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcata > 1:794485‑M1/1‑36 (MQ=255) aCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcata < 1:7325514‑M1/50‑15 (MQ=255) aCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcata < 1:2338082‑M1/50‑15 (MQ=255) cGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatcc < 1:5388274‑M1/50‑18 (MQ=255) gCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccg > 1:8103306‑M1/1‑32 (MQ=255) gCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccg < 1:8342641‑M1/50‑19 (MQ=255) ccAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccgg < 1:5797393‑M1/50‑20 (MQ=255) ccAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccgg < 1:8209724‑M1/50‑20 (MQ=255) cAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggt > 1:3101215‑M1/1‑30 (MQ=255) cAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggt > 1:2813644‑M1/1‑30 (MQ=255) cAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggt < 1:3477966‑M1/50‑21 (MQ=255) cAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggt < 1:3700755‑M1/50‑21 (MQ=255) agagagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggtt > 1:2607640‑M1/1‑29 (MQ=255) agagagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggtt > 1:4483843‑M1/1‑29 (MQ=255) agagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgt > 1:2906801‑M1/1‑27 (MQ=255) agagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgt > 1:3664355‑M1/1‑27 (MQ=255) agagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgt < 1:8435410‑M1/50‑24 (MQ=255) agagCGAATATCATCGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgt > 1:159858‑M1/1‑27 (MQ=255) agCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtca < 1:7305914‑M1/50‑26 (MQ=255) agCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtca < 1:5278852‑M1/50‑26 (MQ=255) agCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgt > 1:6465830‑M1/1‑25 (MQ=255) gCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcag < 1:2167486‑M1/50‑27 (MQ=255) gCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcag < 1:5853838‑M1/50‑27 (MQ=255) gCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcag < 1:8513873‑M1/50‑27 (MQ=255) gCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccacgcatatccggttgtcag < 1:8327052‑M1/50‑27 (MQ=255) cGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcagg < 1:7625426‑M1/50‑28 (MQ=255) cGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcagg > 1:6751172‑M1/1‑23 (MQ=255) gAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:6580404‑M1/1‑22 (MQ=255) gAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:3794987‑M1/1‑22 (MQ=255) gAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:6573272‑M1/1‑22 (MQ=255) aaTATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:3509110‑M1/1‑21 (MQ=255) atatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:1441513‑M1/1‑20 (MQ=255) tatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcag < 1:4198896‑M1/50‑32 (MQ=255) tatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcag < 1:6103782‑M1/50‑32 (MQ=255) atCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcag > 1:8517330‑M1/1‑18 (MQ=255) tCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcagga < 1:7691850‑M1/50‑34 (MQ=255) tCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcagga > 1:6447990‑M1/1‑17 (MQ=255) cATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggat > 1:3496852‑M1/1‑16 (MQ=255) cATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggat > 1:1783359‑M1/1‑16 (MQ=255) aTTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatg > 1:2601159‑M1/1‑15 (MQ=255) aTTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatg < 1:5055988‑M1/50‑36 (MQ=255) aTTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggat < 1:186099‑M1/49‑35 (MQ=255) ttGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatgg < 1:5349208‑M1/50‑37 (MQ=255) gCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggt < 1:524081‑M1/49‑38 (MQ=255) ccGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaa < 1:507155‑M1/50‑40 (MQ=255) ccGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaa < 1:2320294‑M1/50‑40 (MQ=255) ccGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggta < 1:3854996‑M1/49‑39 (MQ=255) ccGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggt > 1:4175633‑M1/1‑11 (MQ=255) ccGGTTGGCGAgtaatccccgcataaccggttgtcaggtcaggatggtaa < 1:1290830‑M1/50‑40 (MQ=255) ggTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaagg > 1:390002‑M1/1‑9 (MQ=255) ggTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaagg > 1:2279584‑M1/1‑9 (MQ=255) ggTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaagg > 1:4661192‑M1/1‑9 (MQ=255) ggTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaagg > 1:7681344‑M1/1‑9 (MQ=255) gTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggc < 1:2825262‑M1/50‑43 (MQ=255) gTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaagg > 1:1358614‑M1/1‑8 (MQ=255) ttGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggca > 1:4125749‑M1/1‑7 (MQ=255) ggCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacc > 1:1216457‑M1/1‑5 (MQ=255) gCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacct < 1:3338719‑M1/50‑47 (MQ=255) gCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacct < 1:6967535‑M1/50‑47 (MQ=255) gCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacct < 1:4035608‑M1/50‑47 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |