| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 389,898 | Δ9,908 bp | yaiT–[yaiZ] | yaiT, insF‑2, insE‑2, yaiT, iprA, ampH, sbmA, yaiW, yaiY, [yaiZ] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 389898 | 399805 | 9908 | 138 [0] | [0] 138 | yaiT–[yaiZ] | yaiT,insF‑2,insE‑2,yaiT,iprA,ampH,sbmA,yaiW,yaiY,[yaiZ] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 389897 | 0 (0.000) | 131 (1.150) | 67/98 | 0.0 | 100% | intergenic (‑170/‑354) | hemB/yaiT | porphobilinogen synthase/putative autotransporter YaiT |
| ? | NC_000913 | 399806 = | 0 (0.000) | intergenic (+1/+23) | yaiZ/ddlA | DUF2754 domain‑containing protein YaiZ/D‑alanine‑‑D‑alanine ligase A | |||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
GGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATC > NC_000913/399758‑399855 | aatagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttg < 1:4010377‑M2/1‑1 (MQ=255) atagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGaa < 1:4323426‑M2/3‑1 (MQ=255) atagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGaa < 1:2554507‑M2/3‑1 (MQ=255) atagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGaa > 1:7464109‑M2/48‑50 (MQ=255) atagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGa < 1:5234286‑M2/2‑1 (MQ=255) atagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGa < 1:7252617‑M2/2‑1 (MQ=255) tagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGaa > 1:3166114‑M2/47‑49 (MQ=255) tagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAat < 1:2587667‑M2/4‑1 (MQ=255) agaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAata > 1:5500865‑M2/46‑50 (MQ=255) gaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAatat > 1:1532262‑M2/45‑50 (MQ=255) gaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAatat > 1:6470729‑M2/45‑50 (MQ=255) gaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAatat < 1:6736521‑M2/6‑1 (MQ=255) gaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAatat > 1:4554575‑M2/45‑50 (MQ=255) gaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAatat > 1:7077240‑M2/45‑50 (MQ=255) gaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAatat < 1:3661926‑M2/6‑1 (MQ=255) gaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAata < 1:1389946‑M2/5‑1 (MQ=255) aaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAatat > 1:4975080‑M2/44‑49 (MQ=255) aaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAAtatt < 1:5070706‑M2/7‑1 (MQ=255) aacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAAtatta < 1:6765923‑M2/8‑1 (MQ=255) aacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAAtatta < 1:4825986‑M2/8‑1 (MQ=255) acagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAAtattat < 1:4850066‑M2/9‑1 (MQ=255) cagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATc > 1:3422851‑M2/41‑50 (MQ=255) cagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATc > 1:55404‑M2/41‑50 (MQ=255) cagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATc < 1:3705961‑M2/10‑1 (MQ=255) agcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCg > 1:899675‑M2/40‑50 (MQ=255) agcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCg > 1:415584‑M2/40‑50 (MQ=255) gcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCgg < 1:152635‑M2/12‑1 (MQ=255) caataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCggg > 1:4886058‑M2/38‑50 (MQ=255) caataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCggg < 1:3812886‑M2/13‑1 (MQ=255) aataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGc > 1:5418890‑M2/37‑50 (MQ=255) aataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGc < 1:4613932‑M2/14‑1 (MQ=255) aataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGc < 1:7440665‑M2/14‑1 (MQ=255) aataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGc > 1:7880447‑M2/37‑50 (MQ=255) ataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCg > 1:1545446‑M2/36‑50 (MQ=255) taattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGt < 1:8212233‑M2/16‑1 (MQ=255) aattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGt > 1:8283330‑M2/34‑49 (MQ=255) attttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGtt > 1:4607977‑M2/33‑49 (MQ=255) attttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGtt > 1:667693‑M2/33‑49 (MQ=255) attttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTa < 1:3444342‑M2/18‑1 (MQ=255) ttttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTaa < 1:5571591‑M2/19‑1 (MQ=255) ttttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTa > 1:1187379‑M2/32‑49 (MQ=255) tttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTaa > 1:141308‑M2/31‑49 (MQ=255) ttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTaaaa > 1:2904128‑M2/30‑50 (MQ=255) ttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTaaa < 1:837188‑M2/20‑1 (MQ=255) tatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTaaaa < 1:2012831‑M2/21‑1 (MQ=255) tatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTaaaa > 1:7648920‑M2/29‑49 (MQ=255) tatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTaaaa > 1:6476814‑M2/29‑49 (MQ=255) atattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAata > 1:8117402‑M2/28‑50 (MQ=255) atattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAat < 1:4811401‑M2/22‑1 (MQ=255) atattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAat < 1:1530021‑M2/22‑1 (MQ=255) tattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAatat < 1:6065908‑M2/24‑1 (MQ=255) ttcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATAtt < 1:7964341‑M2/25‑1 (MQ=255) ttcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATAtt < 1:7527119‑M2/25‑1 (MQ=255) ttcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTa < 1:6944814‑M2/26‑1 (MQ=255) ttcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTa < 1:1335365‑M2/26‑1 (MQ=255) tcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTa > 1:7980130‑M2/24‑49 (MQ=255) cactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACa > 1:5073276‑M2/23‑50 (MQ=255) cactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACa > 1:3929701‑M2/23‑50 (MQ=255) cactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACa > 1:8406407‑M2/23‑50 (MQ=255) actgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACAt > 1:372360‑M2/22‑50 (MQ=255) gaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtgt > 1:6748439‑M2/19‑50 (MQ=255) gaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtgt > 1:974266‑M2/19‑50 (MQ=255) aaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtgtg < 1:6015438‑M2/33‑1 (MQ=255) aaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtgtg < 1:1200501‑M2/33‑1 (MQ=255) aaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTgg > 1:3132405‑M2/17‑50 (MQ=255) tatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGttt < 1:5171811‑M2/37‑1 (MQ=255) tatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGttt < 1:1500068‑M2/37‑1 (MQ=255) atttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGtttt > 1:2735563‑M2/13‑50 (MQ=255) tttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGtttt < 1:2136158‑M2/38‑1 (MQ=255) tttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGtttt < 1:5599288‑M2/38‑1 (MQ=255) ttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTc > 1:7574218‑M2/11‑49 (MQ=255) ttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTc > 1:1540203‑M2/11‑49 (MQ=255) ttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTc > 1:143518‑M2/11‑49 (MQ=255) ttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTc > 1:885575‑M2/11‑49 (MQ=255) ttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTc > 1:4775125‑M2/11‑49 (MQ=255) tttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCaa > 1:5775548‑M2/10‑50 (MQ=255) tttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCa < 1:8087122‑M2/40‑1 (MQ=255) ttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCaa < 1:2778725‑M2/41‑1 (MQ=255) ttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCaa < 1:8452486‑M2/41‑1 (MQ=255) taatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATg > 1:2293690‑M2/8‑50 (MQ=255) taatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATg > 1:3173557‑M2/8‑50 (MQ=255) taatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATg > 1:1344975‑M2/8‑50 (MQ=255) taatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATg > 1:354034‑M2/8‑50 (MQ=255) 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1:4223569/47‑1 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGt < 1:1480214/46‑1 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTa < 1:8154071/48‑1 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATc > 1:1663486/1‑50 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATc > 1:2284313/1‑50 (MQ=255) | GGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATC > NC_000913/399758‑399855 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |