| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1994264 = | 128 (1.170) | 240 (3.090) +ATTTCTAATGTCGT |
3/70 | 11.4 | 72.6% | coding (443/1833 nt) | uvrC | excision nuclease subunit C |
| ? | NC_000913 | 3208976 = | 128 (1.170) | coding (953/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate:succinate antiporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
TCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAAT > NC_000913/3208928‑3209025 | tCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCa > 2:3014276/1‑50 (MQ=255) cggcggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCa < 1:2367865/49‑1 (MQ=255) cggcggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCAc > 1:4531181/1‑50 (MQ=255) ggcggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCAc < 2:765491/49‑1 (MQ=255) ggcggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCAc < 1:4964104/49‑1 (MQ=255) ggcggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACt < 1:1126014/50‑1 (MQ=255) ggcggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACt > 2:4804375/1‑50 (MQ=255) ggcggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACt > 2:165828/1‑50 (MQ=255) ggcggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACt > 1:1487799/1‑50 (MQ=255) cggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGa > 1:1864107/1‑50 (MQ=255) cggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGa > 2:2687793/1‑50 (MQ=255) cggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGa > 1:1348502/1‑50 (MQ=255) cggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGa < 2:3336028/50‑1 (MQ=255) ggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAt < 1:4346724/50‑1 (MQ=255) ggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAt < 1:3841951/50‑1 (MQ=255) gTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtg < 2:3278512/50‑1 (MQ=255) tGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtgc > 1:4117314/1‑50 (MQ=255) tGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtgc > 2:2741542/1‑50 (MQ=255) aTTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCTCTGAtgct < 2:4065551/49‑1 (MQ=255) aTTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtgctg < 1:1202107/50‑1 (MQ=255) aTTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtgctg > 2:2952144/1‑50 (MQ=255) aTTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtgct < 2:4462927/49‑1 (MQ=255) aTTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtgct < 1:4275191/49‑1 (MQ=255) aTTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtgct < 2:1296003/49‑1 (MQ=255) aTTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtgct < 2:2862462/49‑1 (MQ=255) ttATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtgctgc > 1:3999098/1‑50 (MQ=255) ttATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtgctgc < 1:181031/50‑1 (MQ=255) tataTCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATgctgct > 2:1653218/1‑50 (MQ=255) atatCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATgctgct < 1:2582342/49‑1 (MQ=255) atatCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATgctgct < 1:563061/49‑1 (MQ=255) atatCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCtt > 2:4168738/1‑50 (MQ=255) atatCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCtt > 2:2199812/1‑50 (MQ=255) atatCGACGCCGCGCTGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCtt > 2:3397713/1‑50 (MQ=38) tatCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTc > 1:5331201/1‑50 (MQ=255) tatCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTc < 1:4393235/50‑1 (MQ=255) tatCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTc < 1:2333871/50‑1 (MQ=255) tCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCt < 1:3118567/49‑1 (MQ=255) tCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTg < 2:4910613/50‑1 (MQ=255) tCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTg > 2:3383475/1‑50 (MQ=255) cGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTgc > 1:2753614/1‑50 (MQ=255) aTGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTgcgc < 2:2247453/50‑1 (MQ=255) gCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCAt > 1:19378/1‑50 (MQ=255) ccGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCAtt < 1:2925133/50‑1 (MQ=255) ccGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCAt < 2:3244914/49‑1 (MQ=255) cgcgATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTa > 1:2751399/1‑50 (MQ=255) cgcgATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTa < 2:5367982/50‑1 (MQ=255) cgATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATc < 1:3070366/50‑1 (MQ=255) gATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCGCTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCa < 1:1099081/50‑1 (MQ=255) gATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTAt > 2:713167/1‑48 (MQ=255) gATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTAt > 1:287256/1‑48 (MQ=255) gATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTAt > 1:2383851/1‑48 (MQ=255) gATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTAt > 2:4902953/1‑48 (MQ=255) gATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTAt > 2:5067903/1‑48 (MQ=255) gATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTAt > 1:4849658/1‑48 (MQ=255) gATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCa < 1:3137716/50‑1 (MQ=255) gATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCa < 1:5387066/50‑1 (MQ=255) gATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCa < 2:3786280/50‑1 (MQ=255) gATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCa < 1:2928994/50‑1 (MQ=255) aTGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAg < 1:3641992/50‑1 (MQ=255) aTGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAg < 1:3863709/50‑1 (MQ=255) gTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGtt < 1:4492738/49‑1 (MQ=255) gTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGtt < 1:3489244/49‑1 (MQ=255) gTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTg > 2:2376134/1‑50 (MQ=255) cGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTgg > 1:5194863/1‑49 (MQ=255) ggTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTggg < 2:2460389/49‑1 (MQ=255) ggTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGga > 2:3711345/1‑50 (MQ=255) ggTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGga > 1:3557830/1‑50 (MQ=255) ggTTACAGCATGATGGGACTGATGCTGCTGCGGCGCATTATCAGATggta < 2:3173601/50‑3 (MQ=255) gTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGgac < 1:241786/50‑1 (MQ=255) ttACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGgacg < 1:2768474/50‑1 (MQ=255) ttACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGgac > 2:2525928/1‑49 (MQ=255) tACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGgacga > 1:4193917/1‑50 (MQ=255) tACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGgacga > 1:144685/1‑50 (MQ=255) tACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGgacga > 2:2779447/1‑50 (MQ=255) tACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGgacga > 2:3649071/1‑50 (MQ=255) cAGCGTGGTGGCACTGATGCTGGTTCTGCGCATTAACAGCTGGgtcgcc < 2:4207447/49‑3 (MQ=25) cAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACa > 1:506124/1‑50 (MQ=255) cAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACa < 2:4462211/50‑1 (MQ=255) cAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACa < 2:663095/50‑1 (MQ=255) cAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACa > 2:202894/1‑50 (MQ=255) aGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACAt > 2:2527190/1‑50 (MQ=255) aGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACAt < 1:4243007/50‑1 (MQ=255) gCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACAtt > 1:3459865/1‑50 (MQ=255) gCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACAtt < 1:1952235/50‑1 (MQ=255) gCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACAtt < 1:911647/50‑1 (MQ=255) cGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTg < 1:581095/50‑1 (MQ=255) cGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTg < 2:4895178/50‑1 (MQ=255) gtggtgGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGt < 2:4696598/50‑1 (MQ=255) ggtggCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGt > 1:1846144/1‑48 (MQ=255) ggtggCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGt > 1:4160652/1‑48 (MQ=255) gtggCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAg > 1:1473935/1‑50 (MQ=255) gtggCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAg > 1:3654092/1‑50 (MQ=255) tggCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGt < 1:2135423/50‑1 (MQ=255) gCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGtaa < 2:4225793/50‑1 (MQ=255) gCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGta < 2:4632503/49‑1 (MQ=255) cACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGtaat < 2:1164927/50‑1 (MQ=255) cACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGtaat < 2:4937090/50‑1 (MQ=255) cACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGtaat < 1:2663591/50‑1 (MQ=255) cACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGtaa > 1:370585/1‑49 (MQ=255) cACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTAAGtaat < 1:4256725/50‑1 (MQ=255) | TCGGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAAT > NC_000913/3208928‑3209025 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |