Missing coverage evidence...
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*	*	÷	NC_000913	3423697–3424234	3426803–3424653	420–3107	26 [23]	[21] 29	[rrfD]–rrlD	[rrfD],rrlD

CATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACAC  >  NC_000913/3423647‑3423709                                                  |              cATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATgg               <  1:132071/50‑1 (MQ=255) cATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATgg               >  2:374500/1‑50 (MQ=255) cATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATgg               >  1:4526310/1‑50 (MQ=255)  atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              <  1:3218650/50‑1 (MQ=255)    atCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:4032142/1‑48 (MQ=255)    atCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:3653894/1‑48 (MQ=255)    atCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:395094/1‑48 (MQ=255)     tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  2:4488389/1‑47 (MQ=255)     tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGga            <  2:2053480/49‑1 (MQ=255)     tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGga            <  1:3918534/49‑1 (MQ=255)      cAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgaga          >  2:996498/1‑50 (MQ=255)      cAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgaga          >  1:3072062/1‑50 (MQ=255)       aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAc         <  2:2856692/50‑1 (MQ=255)       aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAc         >  2:4144327/1‑50 (MQ=255)        gCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcc        <  2:2752791/50‑1 (MQ=255)        gCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcc        >  2:3560739/1‑50 (MQ=255)         cACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       >  1:2637566/1‑50 (MQ=255)          aCGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       >  1:1779702/1‑49 (MQ=255)           cGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCca     >  2:4272642/1‑50 (MQ=40)            gCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcac    <  1:1393620/50‑1 (MQ=38)            gCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcac    <  1:13094/50‑1 (MQ=38)            gCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCca     >  2:1123368/1‑49 (MQ=38)               aaaTTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCacac  >  1:3472516/1‑49 (MQ=32)               aaaTTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCacac  >  2:1155140/1‑49 (MQ=32)               aaaTTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCacac  >  2:3355101/1‑49 (MQ=32)               aaaTTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCacac  >  2:3502103/1‑49 (MQ=32)                                                  |              CATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACAC  >  NC_000913/3423647‑3423709

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑