Missing coverage evidence...
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ATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACAC  >  NC_000913/3423648‑3423709                                                  |             atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  2:3147821/1‑50 (MQ=255) atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:4771063/1‑50 (MQ=255) atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:3757302/1‑50 (MQ=255)  tatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATgggg             <  2:535240/50‑1 (MQ=255)  tatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATgggg             <  1:5833358/50‑1 (MQ=255)  tatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:1253731/1‑49 (MQ=255)  tatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  2:1498125/1‑49 (MQ=255)  tatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:109429/1‑49 (MQ=255)   atCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  2:2168459/1‑48 (MQ=255)    tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgag           <  1:3505640/50‑1 (MQ=255)    tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgag           <  1:5164731/50‑1 (MQ=255)    tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGga            <  2:4559211/49‑1 (MQ=255)    tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGga            <  1:3122685/49‑1 (MQ=255)     cAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgaga          >  2:3969820/1‑50 (MQ=255)     cAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgaga          >  2:2298321/1‑50 (MQ=255)     cAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgaga          >  1:558415/1‑50 (MQ=255)      aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgaga          <  1:2320450/49‑1 (MQ=255)      aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgaga          <  1:969987/49‑1 (MQ=255)      aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAc         <  2:1741737/50‑1 (MQ=255)       gCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcc        >  2:1583929/1‑50 (MQ=255)       gCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcc        >  1:4324879/1‑50 (MQ=255)        cACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       >  2:3531147/1‑50 (MQ=255)        cACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       >  1:3764567/1‑50 (MQ=255)         aCGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcccc      <  2:1349597/50‑1 (MQ=255)         aCGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       >  2:2072696/1‑49 (MQ=255)         aCGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       >  1:2721850/1‑49 (MQ=255)         aCGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       >  1:3054681/1‑49 (MQ=255)         aCGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       >  2:5634567/1‑49 (MQ=255)          cGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCca     <  1:2662390/50‑1 (MQ=40)           gCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcac    <  1:5351790/50‑1 (MQ=38)           gCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcac    <  1:358314/50‑1 (MQ=38)            cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcaca   <  2:4334556/50‑1 (MQ=38)             tAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCacac  >  1:1379623/1‑50 (MQ=35)              aaaTTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCacac  >  2:4215980/1‑49 (MQ=32)                                                  |             ATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACAC  >  NC_000913/3423648‑3423709

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑