Missing coverage evidence...
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ATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACT  >  NC_000913/388646‑388713                   |                                                  ttACGAGA‑TGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAg                   <  1:922328/49‑1 (MQ=17) ttACGAGA‑TGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAg                   >  1:3563838/2‑50 (MQ=17)  tACGAGA‑TGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAgg                  >  2:4983643/1‑50 (MQ=17)        gatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCg             >  2:3486075/3‑50 (MQ=255)        gatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCg             >  1:3164685/3‑50 (MQ=255)         atGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGt            <  2:476164/49‑1 (MQ=255)           ggACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGtt           >  2:807531/1‑49 (MQ=255)           ggACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGtt           >  2:3626661/1‑49 (MQ=255)           ggACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGtt           >  1:4964996/1‑49 (MQ=255)            gACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTc          <  2:4725145/49‑1 (MQ=255)              cGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCAcc       <  2:4879759/50‑1 (MQ=255)              cGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCAcc       <  1:2494694/50‑1 (MQ=255)              cGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCAcc       <  1:1817240/50‑1 (MQ=255)               ggTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCg      >  2:105651/1‑50 (MQ=255)               ggTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCg      >  2:4025799/1‑50 (MQ=255)               ggTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCg      >  2:3619897/1‑50 (MQ=255)               ggTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCg      >  2:726247/1‑50 (MQ=255)               ggTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCg      >  1:2735573/1‑50 (MQ=255)               ggTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCg      >  1:1078774/1‑50 (MQ=255)               ggTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGACGGCGCGTTCACCg      >  2:2869242/1‑50 (MQ=18)                gTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGt     <  1:4799280/50‑1 (MQ=255)                 tCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTa    <  2:122289/50‑1 (MQ=255)                 tCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTa    <  2:795349/50‑1 (MQ=255)                 tCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTa    >  1:4071503/1‑50 (MQ=255)                 tCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTa    <  2:521884/50‑1 (MQ=255)                 tCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTa    <  2:5602991/50‑1 (MQ=255)                   cccTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTAc   <  2:830332/49‑1 (MQ=255)                   cccTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTAc   <  1:175893/49‑1 (MQ=255)                   cccTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTAc   <  1:1217436/49‑1 (MQ=255)                   cccTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACt  <  1:47914/50‑1 (MQ=255)                   |                                                  ATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGGCGTTCACCGTACT  >  NC_000913/388646‑388713

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑