| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 603,467 | Δ5,885 bp | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG], nfsB, ybdF, ybdJ, ybdK, sokE, hokE, insL‑2 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 603467 | 609351 | 5885 | 89 [0] | [0] 90 | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG],nfsB,ybdF,ybdJ,ybdK,sokE,hokE,insL‑2 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 603466 | 0 (0.000) | 86 (0.950) | 58/94 | 0.0 | 100% | coding (1198/1248 nt) | ybdG | miniconductance mechanosensitive channel YbdG |
| ? | NC_000913 | 609352 = | 0 (0.000) | intergenic (+175/+107) | insL‑2/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyl transferase EntD | |||||
ACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/603418‑603466‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCT > NC_000913/609352‑609400 ACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAG > 1:4524698/1‑50ACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAG > 1:5490352/1‑50 cgGCTTAAATGCCCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAG < 1:3270910/47‑1 CTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGT < 1:5137763/50‑1 CTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAG < 1:2745794/49‑1 CTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAG > 1:4922287/1‑49 TGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGT > 1:2899591/1‑49 GCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCAGTGCCGGTTGGCGAGTAA > 1:6635216/1‑50 CTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAAT > 1:1135056/1‑50 CTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAAT > 1:3939441/1‑50 CTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAA < 1:3290233/49‑1 TAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCC > 1:6262123/1‑50 TAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCC > 1:975258/1‑50 TAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCC > 1:3247714/1‑50 TAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCC > 1:487791/1‑50 AAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCC < 1:283805/49‑1 AAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCC < 1:1209912/49‑1 AATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCC > 1:2179244/1‑50 AATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCC < 1:2050887/50‑1 AATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCC > 1:3312331/1‑50 AATGAACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCC < 1:6983456/50‑1 ATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCG > 1:2134361/1‑50 ATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCG < 1:881394/50‑1 ATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCG > 1:364876/1‑50 TGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGC < 1:487814/50‑1 TGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCG > 1:3693790/1‑49 GCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCA > 1:4174449/1‑50 CACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCA > 1:572379/1‑49 CCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATAT < 1:1053626/50‑1 CCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATAT > 1:2167315/1‑50 CCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATC > 1:5560681/1‑50 CCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATC > 1:3460336/1‑50 CGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCC < 1:4263487/50‑1 CGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCC < 1:1102897/50‑1 GCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCG > 1:6524739/1‑50 GCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCG > 1:5133805/1‑50 GCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCG < 1:167267/50‑1 GCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCG < 1:5505231/50‑1 CCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGG < 1:5464544/50‑1 CCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGG > 1:17505/1‑50 CAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGT > 1:1483306/1‑50 CAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGT > 1:6490702/1‑50 AGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTT < 1:6488105/50‑1 AGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTT > 1:2390105/1‑50 GAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTG < 1:2972100/50‑1 GAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTG < 1:4498056/50‑1 AGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT > 1:5148246/1‑50 GAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTC < 1:4434902/50‑1 GAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT > 1:6335427/1‑49 GAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT > 1:210120/1‑49 AGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCA < 1:73406/50‑1 AGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT > 1:3812483/1‑48 AGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT > 1:5635157/1‑48 GCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAG < 1:6959665/50‑1 CGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGG < 1:6116144/50‑1 GAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:1268137/1‑50 GAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:3789998/1‑50 GAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:3494221/1‑50 GAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:3426507/1‑50 ATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCA < 1:3033239/50‑1 ATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:4212486/1‑48 TATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAG > 1:6046196/1‑50 TCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGA > 1:3061727/1‑50 TCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGG < 1:6570163/49‑1 CATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAT > 1:5938174/1‑50 ATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAT < 1:3208651/49‑1 ATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAT < 1:1381487/49‑1 TGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGG > 1:3667678/1‑49 GCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGT < 1:6404299/49‑1 GCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGT > 1:4936058/1‑49 GCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGT < 1:4228441/49‑1 GCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGT > 1:1248727/1‑49 CCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTA < 1:1217594/49‑1 CGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAG < 1:5975137/50‑1 CGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAG < 1:4516973/50‑1 GGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGG > 1:1668043/1‑50 GGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGG > 1:5468680/1‑50 GTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGG > 1:712323/1‑49 TTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCA < 1:582966/50‑1 TGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAC > 1:4392585/1‑50 GGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAC < 1:1966491/49‑1 GCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCT < 1:5365469/50‑1 CGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTG < 1:5652475/50‑1 CGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTG < 1:462082/50‑1 CGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTG > 1:7013019/1‑50 CGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTG > 1:3394001/1‑50 GAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGC > 1:1361280/1‑50 AGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCTGGATGTTAAGGCACCTGCT > 1:2100878/1‑50 AGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCT < 1:949493/50‑1 ACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/603418‑603466‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCT > NC_000913/609352‑609400 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |