| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,388,889 | Δ9,734 bp | ycjG–[uspE] | ycjG, mpaA, ymjC, ymjD, ycjY, pgrR, mppA, ynaI, insH‑4, ynaJ, [uspE] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1388889 | 1398622 | 9734 | 86 [0] | [0] 86 | ycjG–[uspE] | ycjG,mpaA,ymjC,ymjD,ycjY,pgrR,mppA,ynaI,insH‑4,ynaJ,[uspE] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1388888 | 0 (0.000) | 84 (0.910) | 58/96 | 0.0 | 100% | intergenic (‑77/‑42) | tpx/ycjG | lipid hydroperoxide peroxidase/L‑Ala‑D/L‑Glu epimerase |
| ? | NC_000913 | 1398623 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+151) | uspE/fnr | universal stress protein with a role cellular motility/DNA‑binding transcriptional dual regulator FNR | |||||
ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1388840‑1388888‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > NC_000913/1398623‑1398670 ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT < 1:5289087/49‑1 CGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:2313018/1‑49 GTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACA < 1:6074481/50‑1 GTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACA < 1:2133242/50‑1 GTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:3520100/1‑48 TCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAG < 1:317865/50‑1 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGG > 1:6251072/1‑50 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGG < 1:4389805/50‑1 ACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTC < 1:6132864/50‑1 ACCTAGTTTATGCTAACTGCCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTC < 1:3933547/50‑1 CTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTC > 1:5403170/1‑50 TAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCC > 1:5193568/1‑50 AGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCT > 1:841672/1‑50 GTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTT < 1:3376162/50‑1 GTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCT > 1:2482020/1‑49 TTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTA < 1:3603974/50‑1 TATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTAC > 1:3075046/1‑49 TATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTAC < 1:4819257/49‑1 ATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAA > 1:2898872/1‑50 ATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAA > 1:6126766/1‑50 ATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACA < 1:6668598/49‑1 TGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAA < 1:145742/49‑1 CTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAA > 1:4541135/1‑50 CTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACA < 1:3722100/49‑1 CTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACA < 1:794593/49‑1 TAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAAC > 1:3933186/1‑50 TAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAAC > 1:1578194/1‑50 AACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACT > 1:2903774/1‑50 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTG > 1:1328029/1‑50 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACT < 1:4810903/49‑1 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAAC < 1:966705/48‑1 CTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGT < 1:5583821/50‑1 GTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTC > 1:5044116/1‑49 GTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTC > 1:1326743/1‑49 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAA < 1:3289067/50‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCA < 1:61500/49‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCA < 1:4125013/49‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTC < 1:652529/48‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTC < 1:2237358/48‑1 CAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC > 1:4892540/1‑50 CAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC > 1:4558183/1‑50 AATAACACGGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC < 1:481539/49‑1 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:4063815/1‑50 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:6669120/1‑50 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:4072888/1‑50 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG < 1:2679545/50‑1 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC < 1:6593494/49‑1 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC < 1:886502/49‑1 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC < 1:1879081/49‑1 AACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAG > 1:5235191/1‑50 AACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAG > 1:71536/1‑50 AACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAG > 1:6270157/1‑50 AACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAG > 1:317902/1‑50 ACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGT < 1:4422551/50‑1 CACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTT < 1:966485/50‑1 CACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTT > 1:6501909/1‑50 ACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTT > 1:4597544/1‑50 ACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTT < 1:145332/50‑1 ACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTT < 1:2320771/50‑1 ACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTT > 1:1689551/1‑50 ACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTT > 1:2058899/1‑50 CAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG > 1:5495345/1‑50 CAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG < 1:3359992/50‑1 AGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGT < 1:1511626/50‑1 AGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG > 1:731935/1‑49 GCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTA < 1:4779289/50‑1 GCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTA < 1:6039089/50‑1 GCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGT > 1:6263768/1‑49 CAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCCGTTTGTAA > 1:5674498/1‑50 AAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAT > 1:263080/1‑50 AACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATT < 1:1296626/50‑1 CGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA < 1:3495465/50‑1 CGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA < 1:4532618/50‑1 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAA < 1:5032576/50‑1 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAA < 1:2666858/50‑1 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:1424466/1‑49 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:4906965/1‑49 CTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAA < 1:2827476/50‑1 CTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAA < 1:2930954/50‑1 TATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:6151532/1‑47 TATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:1914469/1‑47 ATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAGGCAGTTTGTAATTAA > 1:5389913/1‑46 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT < 1:4590829/50‑1 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGA < 1:1782710/49‑1 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAG < 1:1021810/48‑1 TACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > 1:3492604/1‑49 ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1388840‑1388888‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > NC_000913/1398623‑1398670 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |