Missing coverage evidence...
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CCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACAC  >  NC_000913/3423637‑3423709                                                  |                        ccAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTAc                         >  1:4891380/1‑50 (MQ=255)  cAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTAct                        >  1:1338995/1‑50 (MQ=255)  cAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTAct                        >  1:3327026/1‑50 (MQ=255)   aaCTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTActc                       <  1:2479926/50‑1 (MQ=255)   aaCTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTActc                       >  1:2463094/1‑50 (MQ=255)    aCTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTActct                      >  1:488515/1‑50 (MQ=255)    aCTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTActct                      <  1:2130957/50‑1 (MQ=255)    aCTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTActct                      <  1:2132041/50‑1 (MQ=255)     cTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACtctc                     <  1:4780387/50‑1 (MQ=255)     cTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACtctc                     <  1:2498035/50‑1 (MQ=255)       gAGCCATATCAGTACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCg                    >  1:7107506/1‑49 (MQ=255)       gAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCg                    >  1:5226513/1‑49 (MQ=255)        aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCa                  >  1:2105081/1‑50 (MQ=255)        aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCa                  >  1:4985640/1‑50 (MQ=255)         gCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCAt                 >  1:5951439/1‑50 (MQ=255)         gCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCAt                 <  1:6294194/50‑1 (MQ=255)         gCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCAt                 <  1:4844233/50‑1 (MQ=255)          ccATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATg                >  1:3888644/1‑50 (MQ=255)           cATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATgg               >  1:2825536/1‑50 (MQ=255)           cATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATgg               >  1:3197721/1‑50 (MQ=255)            atatCAGCTCGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              <  1:4094359/50‑1 (MQ=255)             tatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:1869891/1‑49 (MQ=255)              atCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:5232415/1‑48 (MQ=255)              atCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:3224506/1‑48 (MQ=255)              atCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:5332397/1‑48 (MQ=255)               tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgag           <  1:5055271/50‑1 (MQ=255)                cAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgaga          >  1:4317443/1‑50 (MQ=255)                 aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAc         <  1:5152650/50‑1 (MQ=255)                 aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAc         <  1:918784/50‑1 (MQ=255)                 aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAc         >  1:1442930/1‑50 (MQ=255)                   cACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       >  1:5053752/1‑50 (MQ=255)                   cACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       <  1:5464045/50‑1 (MQ=255)                    aCGGTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTTCTCACGCATGGGGAGAcccc      <  1:2206813/50‑1 (MQ=11)                    aCGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       >  1:4658975/1‑49 (MQ=255)                    aCGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       >  1:3945504/1‑49 (MQ=255)                    aCGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       >  1:6490765/1‑49 (MQ=255)                     cGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCca     >  1:256869/1‑50 (MQ=40)                     cGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCca     <  1:5512176/50‑1 (MQ=40)                      gCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcac    <  1:5740443/50‑1 (MQ=38)                      gCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCca     >  1:2014604/1‑49 (MQ=38)                       cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcaca   <  1:2044523/50‑1 (MQ=38)                       cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcaca   <  1:745018/50‑1 (MQ=38)                        tAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCacac  >  1:2968247/1‑50 (MQ=35)                                                  |                        CCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACAC  >  NC_000913/3423637‑3423709

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑