| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 92,854 | (GCG)4→3 | coding (1442‑1444/1767 nt) | ftsI → | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 92844 | 92846 | 3 | 44 [0] | [0] 44 | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 92847 = | 0 (0.000) | 39 (1.320) | 31/78 | 0.0 | 100% | coding (1435/1767 nt) | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| ? | NC_000913 | = 92843 | 0 (0.000) | coding (1431/1767 nt) | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI | |||||
CGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/92904‑92847‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccgccTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGAT < NC_000913/92843‑92795 CGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACG < 1:2360924/50‑1 GGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGC < 1:610627/50‑1 TACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCG < 1:1890971/50‑1 CCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCC < 1:313008/50‑1 CGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCG < 1:1718550/50‑1 GTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCC < 1:803941/50‑1 TTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCT < 1:92060/50‑1 TTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCT < 1:1548473/50‑1 TTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTG > 1:1725696/1‑50 TTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTG > 1:1695405/1‑50 TTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTG < 1:2036235/49‑1 ATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAG < 1:1167121/50‑1 ATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAG < 1:2315825/50‑1 TGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGC > 1:815655/1‑50 GGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCG > 1:865775/1‑50 CGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCC < 1:183129/50‑1 GATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCA > 1:78090/1‑50 ATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCAC < 1:332843/50‑1 ATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCAC > 1:1621935/1‑50 ATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCAC < 1:248460/50‑1 TACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACG > 1:2493036/1‑50 CGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCT < 1:2721518/50‑1 GATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTT > 1:371934/1‑50 GATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTT > 1:1238075/1‑50 ATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTT < 1:282616/50‑1 TAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTC > 1:570284/1‑50 TTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCA > 1:1656731/1‑50 TTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCA > 1:2764305/1‑50 TAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCAT < 1:1933701/49‑1 TAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCA < 1:1818600/48‑1 AATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATAT > 1:1722424/1‑50 ATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATG > 1:661692/1‑50 ATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATAT < 1:1028236/49‑1 ATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATAT < 1:2503812/49‑1 TCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGC < 1:2226528/50‑1 CGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCA > 1:850245/1‑50 CCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACC < 1:964193/50‑1 CGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCA < 1:1639979/50‑1 GCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCAC < 1:1202370/50‑1 GCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCAC < 1:475013/50‑1 CCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACA < 1:715805/50‑1 TCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTG > 1:31767/1‑50 CACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGC > 1:1636651/1‑50 CACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTG < 1:1540032/49‑1 ACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCG > 1:1188637/1‑50 GCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGA > 1:2224029/1‑50 GCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGA > 1:1687579/1‑50 GCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAA > 1:1461157/1‑50 CTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGAT > 1:914269/1‑50 CGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/92904‑92847‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccgccTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGAT < NC_000913/92843‑92795 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |