| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 92,854 | (GCG)4→3 | coding (1442‑1444/1767 nt) | ftsI → | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 92844 | 92846 | 3 | 31 [0] | [0] 32 | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 92847 = | 0 (0.000) | 23 (0.960) | 21/78 | 0.0 | 100% | coding (1435/1767 nt) | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| ? | NC_000913 | = 92843 | 0 (0.000) | coding (1431/1767 nt) | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI | |||||
GCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/92905‑92847‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccgccTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGA < NC_000913/92843‑92796 GCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCAC > 1:1626315/1‑50 CCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCC < 1:1834379/50‑1 GGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGC > 1:2673464/1‑50 GTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCC < 1:259882/50‑1 TTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCT < 1:2067583/50‑1 TTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGG > 1:2504647/1‑50 AATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGT < 1:2666641/49‑1 AATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGT < 1:870162/49‑1 AATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGT < 1:2576180/49‑1 ATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTA < 1:1876764/49‑1 CGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCC < 1:1705425/50‑1 GATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCA < 1:2627863/50‑1 TACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACG < 1:169910/50‑1 CGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCT < 1:1950796/50‑1 GATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTT > 1:12181/1‑50 GATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTT < 1:312538/50‑1 ATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTT < 1:2002278/50‑1 TAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCAT < 1:2354906/49‑1 AATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATAT > 1:470279/1‑50 ATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATG > 1:2224325/1‑50 ATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATAT < 1:1988103/49‑1 TCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGC < 1:420038/50‑1 CGCCTTCACCCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCA < 1:2307545/50‑1 CCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACA < 1:371491/50‑1 CACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGC > 1:1602195/1‑50 CACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTG < 1:1583155/49‑1 ACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGC < 1:330004/49‑1 CGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACTCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGG < 1:1909010/50‑1 CGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGG < 1:1905005/50‑1 CCGACGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGAC < 1:2354646/50‑1 GCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGG < 1:1316230/50‑1 GCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATG > 1:2471325/1‑49 GCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATG > 1:611876/1‑49 CCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGA > 1:1807249/1‑50 CCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGA > 1:906321/1‑50 GCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/92905‑92847‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccgccTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGA < NC_000913/92843‑92796 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |