| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,240,439 | C→T | V60V (GTC→GTT) D545N (GAC→AAC) |
ymgM → cvrA ← |
protein YmgM putative K(+):H(+) antiporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,240,439 | 0 | C | T | 100.0% | 102.5 / NA | 29 | V60V (GTC→GTT) D545N (GAC→AAC) | ymgM cvrA | protein YmgM putative K(+):H(+) antiporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (12/17); total (12/17) | |||||||||||
CTTTCTCGGCCACCGTCCAGATCATCCCGGCAAACTCTACCTGGTCACCGACAACCGGTGCCGCGCCTAACAACTGCTGGACAATTTCACC > NC_000913/1240394‑1240484 | ctttctCGGCCACCGTCCAGATCATCCCGGCAAACTCTACCTGGTTAcc < 1:1616782/49‑1 (MQ=255) tttctCGGCCACCGTCCAGATCATCCCGGCAAACTCTACCTGGTTACCGa > 1:1050544/1‑50 (MQ=255) tctcGGCCACCGTCCAGATCATCCCGGCAAACTCTACCTGGTTACCg < 1:1193502/47‑1 (MQ=255) tctcGGCCACCGTCCAGATCATCCCGGCAAACTCTACCTGGTTACCg < 1:1528300/47‑1 (MQ=255) ctcGGCCACCGTCCAGATCATCCCGGCAAACTCTACCTGGTTACCGACaa > 1:363162/1‑50 (MQ=255) ctcGGCCACCGTCCAGATCATCCCGGCAAACTCTACCTGGTTACCGACaa > 1:321852/1‑50 (MQ=255) ggCCACCGTCCAGATCATCCCGGCAAACTCTACCTGGTTACCGACaa < 1:451229/47‑1 (MQ=255) ggCCACCGTCCAGATCATCCCGGCAAACTCTACCTGGTTACCGACAAcc < 1:1265048/49‑1 (MQ=255) ggCCACCGTCCAGATCATCCCGGCAAACTCTACCTGGTTACCGACAAc < 1:1625822/48‑1 (MQ=255) ggCCACCGTCCAGATCATCCCGGCAAACTCTACCTGGTTACCGACAACCg > 1:1977870/1‑50 (MQ=255) ggCCACCGTCCAGATCATCCCGGCAAACTCTACCTGGTTACCGACAACCg > 1:2001649/1‑50 (MQ=255) gCCACCGTCCAGATCATCCCGGCAAACTCTACCTGGTTACCGACAACCgg < 1:1584389/50‑1 (MQ=255) ccGTCCAGATCATCCCGGCAAACTCTACCTGGTTACCGACAACCGGTGcc < 1:1865637/50‑1 (MQ=255) gTCCAGATCATCCCGGCAAACTCTACCTGGTTACCGACAACCGGTGCcgc > 1:1369235/1‑50 (MQ=255) aGATCATCCCGGCAAACTCTACCTGGTTACCGACAACCGGTGCCGCGCCt < 1:2005008/50‑1 (MQ=255) gATCATCCCGGCAAACTCTACCTGGTTACCGACAACCGGTGCCGCGCCTa < 1:30207/50‑1 (MQ=255) atcCCGGCAAACTCTACCTGGTTACCGACAACCGGTGCCGCGCCTaacaa > 1:707552/1‑50 (MQ=255) cGGCAAACTCTACCTGGTTACCGACAACCGGTGCCGCGCCTAACAActgc < 1:98044/50‑1 (MQ=255) ggCAAACTCTACCTGGTTACCGACAACCGGTGCCGCGCCTAACAActgct < 1:2164010/50‑1 (MQ=255) aaaCTCTACCTGGTTACCGACAACCGGTGCCGCGCCTAACAACTGCTGGa < 1:27175/50‑1 (MQ=255) aaaCTCTACCTGGTTACCGACAACCGGTGCCGCGCCTAACAACTGCTGGa > 1:163483/1‑50 (MQ=255) aCTCTACCTGGTTACCGACAACCGGTGCCGCGCCTAACAACTGCTGGAc > 1:1246064/1‑49 (MQ=255) tACCTGGTTACCGACAACCGGTGCCGCGCCTAACAACTGCTGGACAAt < 1:1985481/48‑1 (MQ=255) aCCTGGTTACCGACAACCGGTGCCGCGCCTAACAACTGCTGGACAAttt > 1:2096977/1‑49 (MQ=255) ccTGGTTACCGACAACCGGTGCCGCGCCTAACAACTGCTGGACAAttt < 1:1906917/48‑1 (MQ=255) ccTGGTTACCGACAACCGGTGCCGCGCCTAACAACTGCTGGACAAtt < 1:79124/47‑1 (MQ=255) ccTGGTTACCGACAACCGGTGCCGCGCCTAACAACTGCTGGACAATTTCa > 1:1662453/1‑50 (MQ=255) cTGGTTACCGACAACCGGTGCCGCGCCTAACAACTGCTGGACAATTTCAc < 1:1655519/50‑1 (MQ=255) tGGTTACCGACAACCGGTGCCGCGCCTAACAACTGCTGGACAATTTCAcc > 1:1086430/1‑50 (MQ=255) | CTTTCTCGGCCACCGTCCAGATCATCCCGGCAAACTCTACCTGGTCACCGACAACCGGTGCCGCGCCTAACAACTGCTGGACAATTTCACC > NC_000913/1240394‑1240484 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |