Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,983,666 | T→C | F237L (TTC→CTC) | aslB → | putative anaerobic sulfatase maturation enzyme AslB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,983,666 | 0 | T | C | 100.0% | 62.8 / NA | 17 | F237L (TTC→CTC) | aslB | putative anaerobic sulfatase maturation enzyme AslB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (10/7); total (10/7) |
TGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCA > NC_000913/3983620‑3983705 | tGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGCTc > 1:42275/1‑49 (MQ=255) gATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGCTCg > 1:170273/1‑49 (MQ=255) atatTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGCTCgg > 1:1106607/1‑49 (MQ=255) atatTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGCTCg < 1:1190889/48‑1 (MQ=255) aGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGCTCGGTGAGtt > 1:387409/1‑49 (MQ=255) aGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGCTCGGTGAGtt > 1:1066866/1‑49 (MQ=255) aGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGCTCGGTGAGt < 1:1890983/48‑1 (MQ=255) gggTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGCTCGGTGAGttt < 1:1212639/49‑1 (MQ=255) ggTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGCTCGGTGAGTTTc < 1:23461/49‑1 (MQ=255) tAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGCTCGGTGAGTTTCTGGTGGc > 1:1709334/1‑49 (MQ=255) ggAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGCTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGata < 1:1955080/49‑1 (MQ=255) aaTGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGCTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATAtt > 1:1837371/1‑49 (MQ=255) aTGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGCTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTc < 1:347821/49‑1 (MQ=255) aTGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGCTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTc < 1:1477982/49‑1 (MQ=255) gTGCGCCCCGAGGAGCTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACt > 1:1139442/1‑49 (MQ=255) gcCCCGAGGAGCTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGAt > 1:1990436/1‑49 (MQ=255) ccGAGGAGCTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCa > 1:677774/1‑48 (MQ=255) | TGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCA > NC_000913/3983620‑3983705 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |