| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 380111 | 0 (0.000) | 66 (0.850) +CGAGAT |
38/86 | 0.2 | 68.6% | coding (732/774 nt) | yaiO | outer membrane protein YaiO |
| ? | NC_000913 | 4070444 = | 69 (0.780) | intergenic (‑43/+71) | yihR/yihS | putative aldose 1‑epimerase YihR/sulfoquinovose isomerase | |||||
AAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/380063‑380111‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGA > NC_000913/4070444‑4070481 |||||| AAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:2454240/1‑50 AGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACG < 1:3462689/50‑1 AGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:1424775/1‑49 GGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:1961733/1‑48 GAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:2827481/1‑47 AATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:3764230/1‑46 AATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:4272765/1‑46 ATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGAT < 1:1861365/50‑1 TCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATG < 1:3119627/50‑1 AGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGA < 1:6244389/50‑1 GAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGAC > 1:5780801/1‑50 GAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGAC < 1:3589805/50‑1 ATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGG < 1:1675989/50‑1 TTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGT > 1:2423300/1‑50 CCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCC > 1:4399860/1‑50 CAGGTCAGATGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCC < 1:754547/50‑1 CAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCC > 1:6051095/1‑50 AGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCT > 1:3736784/1‑50 AGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCT > 1:2186642/1‑50 AGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCT < 1:3024778/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC < 1:3074942/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC > 1:252599/1‑50 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC < 1:3755934/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC < 1:2014114/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC > 1:5531083/1‑50 AGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCC > 1:4090648/1‑50 AGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCC > 1:3740451/1‑50 AGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCC > 1:6046744/1‑50 AGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCC < 1:4288315/49‑1 AGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCC < 1:1200372/49‑1 AGACGAGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCC < 1:4553814/50‑1 GACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCC > 1:792480/1‑50 ACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCc < 1:1346007/50‑2 ACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCc > 1:2223725/1‑49 GGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTT > 1:5542239/1‑50 GGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTT > 1:2066178/1‑50 GGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTT > 1:6161638/1‑50 GGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTG > 1:1784833/1‑50 GGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTG < 1:2248237/50‑1 GCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGG > 1:5332367/1‑50 GCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGG > 1:1319789/1‑50 GCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGG < 1:5250449/50‑1 CTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:2873003/1‑50 GCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:2726549/1‑48 GCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:3779672/1‑48 CAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAG < 1:2921441/50‑1 CAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGG < 1:565524/48‑1 CAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGG < 1:5924723/48‑1 CAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGG < 1:1213326/48‑1 CAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:5470252/1‑47 CAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:3307103/1‑47 AAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGA < 1:3436281/50‑1 AAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGA > 1:2451248/1‑48 AAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGA > 1:2952320/1‑48 AGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG > 1:1949017/1‑50 AGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG < 1:4419758/50‑1 GTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGG > 1:6645598/1‑50 TTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGG > 1:5983763/1‑50 TGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGT > 1:2156018/1‑50 CAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTT < 1:5206515/49‑1 CAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTT < 1:530987/49‑1 CAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGT > 1:1495879/1‑48 CAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGT > 1:3177906/1‑48 AGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAG > 1:5487165/1‑50 AGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAG > 1:3489442/1‑50 GACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGG < 1:1821566/50‑1 GACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGG < 1:3584839/50‑1 ACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGG < 1:1810860/50‑1 ACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGG < 1:4259754/50‑1 ACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGG < 1:3272343/50‑1 CCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGat < 1:1669862/50‑3 CCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGt < 1:5979788/50‑2 GTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGt > 1:4113256/1‑47 GTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGt > 1:2916300/1‑47 |||||| AAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/380063‑380111‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGA > NC_000913/4070444‑4070481 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |