| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 603,467 | Δ5,885 bp | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG], nfsB, ybdF, ybdJ, ybdK, sokE, hokE, insL‑2 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 603467 | 609351 | 5885 | 105 [0] | [0] 105 | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG],nfsB,ybdF,ybdJ,ybdK,sokE,hokE,insL‑2 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 603466 | 0 (0.000) | 102 (1.200) | 66/94 | 0.0 | 100% | coding (1198/1248 nt) | ybdG | miniconductance mechanosensitive channel YbdG |
| ? | NC_000913 | 609352 = | 0 (0.000) | intergenic (+175/+107) | insL‑2/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyl transferase EntD | |||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
ACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/603418‑603466‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCT > NC_000913/609352‑609400 ACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAG > 1:3607608/1‑50ACTCCTTAAATGCAGCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAG < 1:4994651/50‑1 CTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGT < 1:5519920/50‑1 CTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGT < 1:222305/50‑1 CTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAG < 1:1003379/49‑1 GCTTAAATGCACCCGCCAGAGTGCGAATATCATTGCCGGTTGGAGAGTAA > 1:5734687/1‑50 CTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAAT < 1:3249210/50‑1 CTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAAT > 1:5048994/1‑50 CTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAA < 1:4223304/49‑1 TTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATC > 1:1406469/1‑50 TAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCC > 1:569231/1‑50 AAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCC > 1:5519056/1‑50 AAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCC > 1:322878/1‑50 AAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATC < 1:6053567/48‑1 AAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATC < 1:2120822/48‑1 AATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCC < 1:2023948/50‑1 AATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCC > 1:2891166/1‑50 AATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCC < 1:6614209/50‑1 AATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCC > 1:6696840/1‑50 AATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCC > 1:431534/1‑50 AATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCC < 1:625203/49‑1 AATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCC < 1:4466718/49‑1 TGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGC < 1:6250981/50‑1 TGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCG > 1:2319178/1‑49 TGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCG > 1:4822650/1‑49 GCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCA > 1:3671736/1‑50 CACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCAT < 1:4993133/50‑1 CACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCA > 1:1980839/1‑49 CACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCA < 1:418321/49‑1 gCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATA < 1:672396/49‑1 ACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATA > 1:818968/1‑50 ACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATA > 1:1124613/1‑50 ACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATA < 1:6313775/50‑1 CCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATAT > 1:2719258/1‑50 CCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATAT < 1:2329826/50‑1 CCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATC < 1:3294939/50‑1 CCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATC > 1:5347155/1‑50 CGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCC < 1:3666548/50‑1 CGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCC > 1:5377511/1‑50 GCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCG > 1:382723/1‑50 GCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCG > 1:1743145/1‑50 GCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCG > 1:5423701/1‑50 CCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGCTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCG > 1:2899035/1‑49 CAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGT > 1:2356357/1‑50 CAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGT > 1:4657081/1‑50 AGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTT < 1:4493524/50‑1 AGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTT < 1:6398158/50‑1 AGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTT < 1:3480119/50‑1 GAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTG < 1:4472788/50‑1 GAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTG > 1:1520533/1‑50 GAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTG < 1:1401652/50‑1 GAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTG < 1:4960195/50‑1 AGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT < 1:6658571/50‑1 AGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT < 1:3479459/50‑1 GAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT > 1:1311142/1‑49 GAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT > 1:2522756/1‑49 AGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCA < 1:1458949/50‑1 AGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCA < 1:5180360/50‑1 CGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGG > 1:4218030/1‑50 CGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGG > 1:335451/1‑50 GAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGa > 1:5350247/1‑49 GAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:6098238/1‑50 AATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTC < 1:2402348/50‑1 AATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:2749754/1‑49 ATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCA < 1:4834461/50‑1 TATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAG < 1:1015267/50‑1 TATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAG < 1:2909445/50‑1 TATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAG > 1:2233271/1‑50 TCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGA > 1:1676739/1‑50 TCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGA > 1:2859434/1‑50 TCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGG < 1:4202261/49‑1 TCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGG < 1:549384/49‑1 ATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATG > 1:1427513/1‑50 ATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATG > 1:2427577/1‑50 ATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATG > 1:6041510/1‑50 ATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATG < 1:747072/50‑1 ATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAT < 1:6592728/49‑1 TTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGG < 1:5475839/50‑1 TGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGG > 1:3825413/1‑49 GCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGT < 1:5539425/49‑1 GCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGT > 1:4152056/1‑49 CCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAA < 1:1261982/50‑1 CCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTA < 1:3506503/49‑1 CCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGT > 1:1385149/1‑48 GGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGG > 1:2983551/1‑50 GGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGG > 1:6336894/1‑50 GGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGG < 1:5476346/50‑1 GTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGC < 1:737927/50‑1 TTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCA < 1:6212470/50‑1 TTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCA > 1:5500280/1‑50 TGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAC > 1:3931917/1‑50 TGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAC > 1:4276524/1‑50 TGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGAAAGGCAC > 1:4258370/1‑50 GCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCT > 1:3694521/1‑50 GCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCT < 1:4753990/50‑1 GCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACC < 1:4676693/49‑1 GCGAGTAATCCCCGCATAGCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACC < 1:4373674/49‑1 GAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGC > 1:1580047/1‑50 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |