| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,388,889 | Δ9,734 bp | ycjG–[uspE] | ycjG, mpaA, ymjC, ymjD, ycjY, pgrR, mppA, ynaI, insH‑4, ynaJ, [uspE] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1388889 | 1398622 | 9734 | 110 [0] | [0] 113 | ycjG–[uspE] | ycjG,mpaA,ymjC,ymjD,ycjY,pgrR,mppA,ynaI,insH‑4,ynaJ,[uspE] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1388888 | 0 (0.000) | 109 (1.260) | 65/96 | 0.0 | 100% | intergenic (‑77/‑42) | tpx/ycjG | lipid hydroperoxide peroxidase/L‑Ala‑D/L‑Glu epimerase |
| ? | NC_000913 | 1398623 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+151) | uspE/fnr | universal stress protein with a role cellular motility/DNA‑binding transcriptional dual regulator FNR | |||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1388840‑1388888‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > NC_000913/1398623‑1398670 ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:6017720/1‑50ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA < 1:6490047/50‑1 CGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTAC < 1:1000317/50‑1 CGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTAC < 1:2351728/50‑1 CGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTAC < 1:1846166/50‑1 CGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTAC < 1:756805/50‑1 CGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:4748912/1‑49 CGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:2200231/1‑49 CGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:4096527/1‑49 GTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACA < 1:2511954/50‑1 GTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:4671597/1‑48 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1:867972/49‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCA < 1:1178535/49‑1 AATAACGCAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG < 1:3407255/50‑1 AATAACACAGCAAGCGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG < 1:5858131/50‑1 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:78634/1‑50 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:6645455/1‑50 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC < 1:5579361/49‑1 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC < 1:3137545/49‑1 ATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGC < 1:789087/50‑1 TAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCA < 1:2573258/50‑1 TAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCA < 1:4637566/50‑1 TAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:4926584/1‑48 AACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAG > 1:1331533/1‑50 ACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGT < 1:3113803/50‑1 ACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAG < 1:4539758/49‑1 CACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTT > 1:6250924/1‑50 CACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTT > 1:2352931/1‑50 ACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTT < 1:3876540/50‑1 ACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTT > 1:154920/1‑50 ACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTT < 1:6583853/50‑1 CAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG < 1:22814/50‑1 CAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG < 1:4102863/50‑1 CAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG < 1:772412/50‑1 AGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGT < 1:3684741/50‑1 AGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG > 1:2707251/1‑49 GCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTA < 1:6484501/50‑1 AAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAT < 1:1936481/50‑1 AAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAT < 1:2347023/50‑1 AACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATT < 1:5845007/50‑1 AACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATT < 1:719438/50‑1 AACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAT > 1:4041987/1‑49 ACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTA < 1:1803234/50‑1 ACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTA < 1:2665496/50‑1 ACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATT > 1:6167565/1‑49 ACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATT > 1:2812848/1‑49 CGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA < 1:6130208/50‑1 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAA < 1:1391890/50‑1 CTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAA < 1:5521239/50‑1 CTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:1599528/1‑48 CTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:4656682/1‑48 CTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:6617491/1‑48 CTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:1625708/1‑48 ATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:238996/1‑46 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT < 1:2356945/50‑1 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGA < 1:2743503/49‑1 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAG < 1:1293027/48‑1 ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1388840‑1388888‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > NC_000913/1398623‑1398670 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |