| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 389,898 | Δ9,908 bp | yaiT–[yaiZ] | yaiT, insF‑2, insE‑2, yaiT, iprA, ampH, sbmA, yaiW, yaiY, [yaiZ] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 389898 | 399805 | 9908 | 144 [0] | [0] 151 | yaiT–[yaiZ] | yaiT,insF‑2,insE‑2,yaiT,iprA,ampH,sbmA,yaiW,yaiY,[yaiZ] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 389897 | 0 (0.000) | 140 (1.580) | 73/98 | 0.0 | 100% | intergenic (‑170/‑354) | hemB/yaiT | porphobilinogen synthase/putative autotransporter YaiT |
| ? | NC_000913 | 399806 = | 0 (0.000) | intergenic (+1/+23) | yaiZ/ddlA | DUF2754 domain‑containing protein YaiZ/D‑alanine‑‑D‑alanine ligase A | |||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
GGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATC > NC_000913/399758‑399855 | aatagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttg > 1:2977179‑M2/49‑49 (MQ=255)aatagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttg < 1:3483576‑M2/1‑1 (MQ=255)aatagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttg < 1:1982395‑M2/1‑1 (MQ=255)aatagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttg < 1:3338822‑M2/1‑1 (MQ=255) atagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGaa > 1:3955255‑M2/48‑50 (MQ=255) atagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGaa > 1:6142047‑M2/48‑50 (MQ=255) tagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAat < 1:3669082‑M2/4‑1 (MQ=255) agaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAata > 1:3680702‑M2/46‑50 (MQ=255) agaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAata > 1:3507288‑M2/46‑50 (MQ=255) agaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAata > 1:2996405‑M2/46‑50 (MQ=255) gaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAata < 1:3929961‑M2/5‑1 (MQ=255) 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attttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGtt < 1:2313725‑M2/17‑1 (MQ=255) attttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGtt < 1:1935120‑M2/17‑1 (MQ=255) attttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGtt > 1:4606229‑M2/33‑49 (MQ=255) attttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGtt < 1:1659295‑M2/17‑1 (MQ=255) attttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGtt < 1:642441‑M2/17‑1 (MQ=255) attttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTa < 1:5181504‑M2/18‑1 (MQ=255) ttttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTa > 1:4017304‑M2/32‑49 (MQ=255) tttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGACGTTaa > 1:4442851‑M2/31‑49 (MQ=255) ttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTaaa < 1:4456021‑M2/20‑1 (MQ=255) ttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTaaa < 1:2766383‑M2/20‑1 (MQ=255) tatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTaaaa < 1:6172664‑M2/21‑1 (MQ=255) atattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAata > 1:5970644‑M2/28‑50 (MQ=255) atattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAat < 1:5611791‑M2/22‑1 (MQ=255) tattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAatat > 1:3903209‑M2/27‑50 (MQ=255) tattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAatat < 1:6284253‑M2/24‑1 (MQ=255) tattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAatat > 1:5991153‑M2/27‑50 (MQ=255) tattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAatat < 1:2238756‑M2/24‑1 (MQ=255) tattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAata < 1:1396371‑M2/23‑1 (MQ=255) attcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAatat > 1:1887555‑M2/26‑49 (MQ=255) ttcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATAtt < 1:6599073‑M2/25‑1 (MQ=255) ttcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATAtt < 1:3763514‑M2/25‑1 (MQ=255) ttcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTa > 1:614492‑M2/25‑50 (MQ=255) cactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTAc < 1:4422266‑M2/27‑1 (MQ=255) cactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTAc < 1:2019781‑M2/27‑1 (MQ=255) cactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACa > 1:5828970‑M2/23‑50 (MQ=255) cactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACa > 1:4658293‑M2/23‑50 (MQ=255) actgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACAt > 1:22702‑M2/22‑50 (MQ=255) ctgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACAtt < 1:6436044‑M2/30‑1 (MQ=255) gaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtgt > 1:4789089‑M2/19‑50 (MQ=255) aaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtgtg < 1:2258947‑M2/33‑1 (MQ=255) aaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtgtg > 1:1967728‑M2/18‑50 (MQ=255) aaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtgtg > 1:3361456‑M2/18‑50 (MQ=255) aaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtgtg < 1:1619142‑M2/33‑1 (MQ=255) aaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtg < 1:2835222‑M2/31‑1 (MQ=255) aaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTgg < 1:3416006‑M2/34‑1 (MQ=255) aaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTgg > 1:2188264‑M2/17‑50 (MQ=255) aatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGt > 1:1691440‑M2/16‑50 (MQ=255) aatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGt < 1:6333629‑M2/35‑1 (MQ=255) aatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGt < 1:3791464‑M2/35‑1 (MQ=255) aatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGt > 1:5346098‑M2/16‑50 (MQ=255) atatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGtt < 1:1883917‑M2/36‑1 (MQ=255) tatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGttt < 1:5662533‑M2/37‑1 (MQ=255) tatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGttt > 1:1237977‑M2/14‑50 (MQ=255) tttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGtttt < 1:5258219‑M2/38‑1 (MQ=255) ttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTc > 1:4427662‑M2/11‑49 (MQ=255) tttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCaa > 1:1832492‑M2/10‑50 (MQ=255) ttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCaa < 1:4640161‑M2/41‑1 (MQ=255) taatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAAt < 1:6305167‑M2/42‑1 (MQ=255) taatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATg > 1:596874‑M2/8‑50 (MQ=255) taatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATg > 1:1098803‑M2/8‑50 (MQ=255) aatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATg < 1:1528300‑M2/43‑1 (MQ=255) aatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGc > 1:6545821‑M2/7‑50 (MQ=255) aatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGc > 1:6566140‑M2/7‑50 (MQ=255) atcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGc < 1:3697730‑M2/44‑1 (MQ=255) atcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGc < 1:833391‑M2/44‑1 (MQ=255) atcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGc < 1:6550471‑M2/44‑1 (MQ=255) atcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCg > 1:2077691‑M2/6‑50 (MQ=255) cttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGt > 1:3246814‑M2/4‑49 (MQ=255) cttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGt > 1:3726083‑M2/4‑49 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGtt < 1:5488899/47‑1 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGt < 1:3988747/46‑1 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGt < 1:4284253/46‑1 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTa < 1:87150/48‑1 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTAt < 1:3394083/49‑1 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTAt < 1:2502571/49‑1 (MQ=255) | GGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATC > NC_000913/399758‑399855 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |