Missing coverage evidence...
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CCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACA  >  NC_000913/3423637‑3423708                                                  |                       ccAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTAc                        <  1:3686999/50‑1 (MQ=255) ccAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTAc                        >  1:8253408/1‑50 (MQ=255) ccAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTAc                        <  1:4771244/50‑1 (MQ=255) ccAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTAc                        <  1:3338691/50‑1 (MQ=255) ccAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTAc                        <  1:2795051/50‑1 (MQ=255)   aaCTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTActc                      >  1:535821/1‑50 (MQ=255)   aaCTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTActc                      <  1:2753101/50‑1 (MQ=255)   aaCTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTActc                      <  1:5345830/50‑1 (MQ=255)    aCTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTActct                     >  1:6631172/1‑50 (MQ=255)    aCTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTActct                     >  1:2338483/1‑50 (MQ=255)    aCTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTActct                     >  1:2552603/1‑50 (MQ=255)     cTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACtctc                    <  1:2012650/50‑1 (MQ=255)     cTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACtctc                    <  1:5980895/50‑1 (MQ=255)     cTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACtctc                    >  1:3013029/1‑50 (MQ=255)      tGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCg                   >  1:6127792/1‑50 (MQ=255)      tGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCg                   >  1:566371/1‑50 (MQ=255)       gAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCg                   >  1:1256287/1‑49 (MQ=255)        aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCg                   <  1:1698159/48‑1 (MQ=255)        aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCg                   <  1:144712/48‑1 (MQ=255)        aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGc                  <  1:1528254/49‑1 (MQ=255)        aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCa                 <  1:6847426/50‑1 (MQ=255)          ccATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATg               <  1:1274557/50‑1 (MQ=255)          ccATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATg               <  1:792924/50‑1 (MQ=255)           cATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATgg              <  1:3409835/50‑1 (MQ=255)           cATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATgg              <  1:3459599/50‑1 (MQ=255)           cATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATgg              >  1:2970658/1‑50 (MQ=255)           cATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATgg              <  1:7252046/50‑1 (MQ=255)            atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg             >  1:1134699/1‑50 (MQ=255)            atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg             <  1:4676617/50‑1 (MQ=255)            atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg             <  1:2707221/50‑1 (MQ=255)            atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg             <  1:2095822/50‑1 (MQ=255)             tatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg             >  1:1573753/1‑49 (MQ=255)             tatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg             >  1:5508792/1‑49 (MQ=255)               tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgag          <  1:214722/50‑1 (MQ=255)               tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgag          <  1:2560464/50‑1 (MQ=255)               tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgag          <  1:8230766/50‑1 (MQ=255)               tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGga           <  1:2470157/49‑1 (MQ=255)                cAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgaga         >  1:5777760/1‑50 (MQ=255)                cAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgaga         >  1:7599092/1‑50 (MQ=255)                 aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAc        >  1:5813222/1‑50 (MQ=255)                   cACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc      >  1:7249307/1‑50 (MQ=255)                   cACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc      >  1:3697079/1‑50 (MQ=255)                    aCGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcccc     <  1:5697887/50‑1 (MQ=255)                      gCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcac   <  1:7378213/50‑1 (MQ=38)                       cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcaca  <  1:5661044/50‑1 (MQ=38)                                                  |                       CCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACA  >  NC_000913/3423637‑3423708

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑