| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,165,151 | Δ12,060 bp | yegP–gatY | 17 genes yegP, yegQ, cyaR, ogrK, yegZ, yegR, yegS, gatR, insE‑5, insF‑5, gatR, gatD, gatC, gatB, gatA, gatZ, gatY |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2165151 | 2177210 | 12060 | 134 [0] | [0] 138 | yegP–gatY | yegP,yegQ,cyaR,ogrK,yegZ,yegR,yegS,gatR,insE‑5,insF‑5,gatR,gatD,gatC,gatB,gatA,gatZ,gatY |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2165150 | 0 (0.000) | 133 (1.220) | 59/98 | 0.0 | 100% | intergenic (+152/‑39) | baeR/yegP | DNA‑binding transcriptional activator BaeR/DUF1508 domain‑containing protein YegP |
| ? | NC_000913 | 2177211 = | 0 (0.000) | intergenic (‑7/+301) | gatY/fbaB | tagatose‑1,6‑bisphosphate aldolase 2 subunit GatY/fructose‑bisphosphate aldolase class I | |||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
CTGTGCGTTGTTCAGCATCTGCTTTGTCGATACCACGTACATTTTCATATCCTGTCGTTTGTTTTCGATTTCAAAATATAATGAAATTATTTGTTTTT > NC_000913/2177163‑2177260 | ggcatcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaAt > 1:2541945‑M2/49‑50 (MQ=255)ggcatcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaAt < 1:2358157‑M2/2‑1 (MQ=255)ggcatcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaAt > 1:4749613‑M2/49‑50 (MQ=255) gcatcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATc > 1:2970828‑M2/48‑50 (MQ=255) catcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATcc < 1:5891475‑M2/4‑1 (MQ=255) catcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATcc > 1:2159455‑M2/47‑50 (MQ=255) atcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCt > 1:6749693‑M2/46‑50 (MQ=255) atcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCt < 1:6909512‑M2/5‑1 (MQ=255) atcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCt < 1:4071177‑M2/5‑1 (MQ=255) atcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCt > 1:173652‑M2/46‑50 (MQ=255) tcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTg > 1:5727773‑M2/45‑50 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cgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtttgtt > 1:7615915‑M2/36‑50 (MQ=255) gctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtttgttt < 1:1814848‑M2/16‑1 (MQ=255) gctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtttgttt < 1:827830‑M2/16‑1 (MQ=255) gctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtttgtt < 1:4692198‑M2/15‑1 (MQ=255) gctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtttgtt < 1:5798122‑M2/15‑1 (MQ=255) gctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtttgtt < 1:1064895‑M2/15‑1 (MQ=255) gctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtttgtt < 1:6779456‑M2/15‑1 (MQ=255) gctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtttgtt < 1:7350487‑M2/15‑1 (MQ=255) gctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtttgtt < 1:7509458‑M2/15‑1 (MQ=255) ctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGtttt < 1:2705221‑M2/17‑1 (MQ=255) ctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGtttt < 1:1364624‑M2/17‑1 (MQ=255) ctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGtttt < 1:7342643‑M2/17‑1 (MQ=255) ctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGtttt > 1:8015601‑M2/34‑50 (MQ=255) ctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGtttt > 1:7436572‑M2/34‑50 (MQ=255) tcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTc > 1:3351612‑M2/33‑50 (MQ=255) atactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTc < 1:6235170‑M2/18‑1 (MQ=255) tactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGAt < 1:5920544‑M2/21‑1 (MQ=255) tactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGAt > 1:854662‑M2/30‑50 (MQ=255) tactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGAt > 1:2207850‑M2/30‑50 (MQ=255) actttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGAtt > 1:4806250‑M2/29‑50 (MQ=255) ctttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGAttt < 1:6345770‑M2/23‑1 (MQ=255) ctttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGAttt < 1:3866360‑M2/23‑1 (MQ=255) ctttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGAttt < 1:2044867‑M2/23‑1 (MQ=255) ctttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGAtt < 1:4360422‑M2/22‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |