Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 380112 | 388665 | 8554 | 93 [0] | [21] 22 | [yaiO]–tauD | [yaiO],yaiX,insC‑1,insD‑1,yaiX,yaiP,ykiC,yaiS,tauA,tauB,tauC,tauD |
GAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAAAATCATCGGTTGGGGTGTCGTACCACACTTTACCTGCCGTCAGCCCGA > NC_000913/380062‑380160 | gAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTa > 1:223629/1‑50 (MQ=255) gAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTa > 1:5711218/1‑50 (MQ=255) gAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTa < 1:8314144/50‑1 (MQ=255) gAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTa < 1:3106347/50‑1 (MQ=255) gAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTa > 1:7666827/1‑50 (MQ=255) aGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcg < 1:1659989‑M1/50‑3 (MQ=255) ggAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:6998133‑M1/1‑47 (MQ=255) gAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:7283295‑M1/1‑46 (MQ=255) aaTCAGAAGTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgaga < 1:7797134‑M1/50‑6 (MQ=255) aTCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagat > 1:1360283‑M1/1‑44 (MQ=255) aTCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagat < 1:3881999‑M1/50‑7 (MQ=255) aTCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagat < 1:1102676‑M1/50‑7 (MQ=255) aTCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagat < 1:2024207‑M1/50‑7 (MQ=255) aTCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagat > 1:1001488‑M1/1‑44 (MQ=255) aTCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagat > 1:3698702‑M1/1‑44 (MQ=255) tCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatg < 1:4878915‑M1/50‑8 (MQ=255) aGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatgga < 1:6198719‑M1/50‑10 (MQ=255) aGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatgg < 1:6408608‑M1/49‑9 (MQ=255) aaTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacg < 1:3548645‑M1/50‑12 (MQ=255) aaTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacg < 1:3011236‑M1/50‑12 (MQ=255) aaTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacg < 1:4158654‑M1/50‑12 (MQ=255) aaTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacg > 1:1196690‑M1/1‑39 (MQ=255) aTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacgg < 1:212991‑M1/50‑13 (MQ=255) tttCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggt < 1:2223601‑M1/50‑14 (MQ=255) tttCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggt < 1:5922348‑M1/50‑14 (MQ=255) tttCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggt < 1:4167422‑M1/50‑14 (MQ=255) tttCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggt < 1:1019911‑M1/50‑14 (MQ=255) tCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcc > 1:8291145‑M1/1‑35 (MQ=255) tCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtc < 1:284905‑M1/49‑15 (MQ=255) ccAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtccc > 1:6665558‑M1/1‑34 (MQ=255) ccAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtccc > 1:857594‑M1/1‑34 (MQ=255) ccAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcc < 1:555537‑M1/49‑16 (MQ=255) cAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccc > 1:6855390‑M1/1‑33 (MQ=255) cAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccc > 1:3124392‑M1/1‑33 (MQ=255) cAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccc < 1:8193399‑M1/50‑18 (MQ=255) aGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccct < 1:3317163‑M1/50‑19 (MQ=255) aGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccct > 1:6798571‑M1/1‑32 (MQ=255) aGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccct < 1:1839647‑M1/50‑19 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 1:823441‑M1/50‑20 (MQ=255) gTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcg > 1:3880720‑M1/1‑30 (MQ=255) gTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcg < 1:677969‑M1/50‑21 (MQ=255) tCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgc > 1:6992315‑M1/1‑29 (MQ=255) cAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcc > 1:2217315‑M1/1‑28 (MQ=255) aGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccc > 1:8078423‑M1/1‑27 (MQ=255) aGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccc > 1:7964027‑M1/1‑27 (MQ=255) aGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccc > 1:1077568‑M1/1‑27 (MQ=255) gACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccc > 1:5970052‑M1/1‑26 (MQ=255) cGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccct > 1:4702472‑M1/1‑24 (MQ=255) cGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccct < 1:522706‑M1/50‑27 (MQ=255) cGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccct < 1:7287537‑M1/50‑27 (MQ=255) cGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccct < 1:109154‑M1/50‑27 (MQ=255) gggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccctt < 1:5672720‑M1/50‑28 (MQ=255) gggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccctt < 1:159984‑M1/50‑28 (MQ=255) gggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccctt < 1:1399021‑M1/50‑28 (MQ=255) gggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccctt < 1:8087519‑M1/50‑28 (MQ=255) gggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccctt < 1:2215322‑M1/50‑28 (MQ=255) gCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgg < 1:687007‑M1/50‑30 (MQ=255) cTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg < 1:6498913‑M1/50‑31 (MQ=255) cTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:6485561‑M1/1‑20 (MQ=255) cTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:311726‑M1/1‑20 (MQ=255) cTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:343748‑M1/1‑20 (MQ=255) cTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:3908228‑M1/1‑20 (MQ=255) tGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:8099508‑M1/1‑19 (MQ=255) aaGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggaga < 1:7547644‑M1/50‑35 (MQ=255) aaGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgggga > 1:1639130‑M1/1‑16 (MQ=255) aaGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgggga > 1:6669744‑M1/1‑16 (MQ=255) aGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagag > 1:5923188‑M1/1‑15 (MQ=255) aGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagag > 1:3582385‑M1/1‑15 (MQ=255) ttGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagaggg > 1:5535656‑M1/1‑13 (MQ=255) cAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggtta < 1:4032536‑M1/50‑41 (MQ=255) cAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggtta < 1:8111526‑M1/50‑41 (MQ=255) cAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggtt < 1:2655685‑M1/49‑40 (MQ=255) cAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggt > 1:3680066‑M1/1‑10 (MQ=255) cAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggt > 1:282076‑M1/1‑10 (MQ=255) aGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttag < 1:8111533‑M1/50‑42 (MQ=255) gACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagg > 1:610415‑M1/1‑8 (MQ=255) gACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagg < 1:472713‑M1/50‑43 (MQ=255) gACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagg > 1:6785472‑M1/1‑8 (MQ=255) ccGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt < 1:7327259‑M1/50‑45 (MQ=255) cGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtg < 1:2425232‑M1/50‑46 (MQ=255) cGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtg < 1:2372784‑M1/50‑46 (MQ=255) cGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt > 1:6461713‑M1/1‑5 (MQ=255) cGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt > 1:1510362‑M1/1‑5 (MQ=255) gTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtga < 1:2631953‑M1/50‑47 (MQ=255) gTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt > 1:7424805‑M1/1‑4 (MQ=255) ttAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgag > 1:8173864‑M1/1‑3 (MQ=255) ttAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgag < 1:3173861‑M1/50‑48 (MQ=255) ttAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgag < 1:5987492‑M1/50‑48 (MQ=255) ttAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgag < 1:1066362‑M1/50‑48 (MQ=255) tAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgagg > 1:4600200‑M1/1‑2 (MQ=255) acgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgaggg > 1:130414‑M1/1‑1 (MQ=255) acgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgaggg > 1:7155960‑M1/1‑1 (MQ=255) acgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgagg < 1:6692613‑M1/49‑49 (MQ=255) | GAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAAAATCATCGGTTGGGGTGTCGTACCACACTTTACCTGCCGTCAGCCCGA > NC_000913/380062‑380160 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |