| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 603,467 | Δ5,885 bp | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG], nfsB, ybdF, ybdJ, ybdK, sokE, hokE, insL‑2 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 603467 | 609351 | 5885 | 126 [0] | [0] 126 | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG],nfsB,ybdF,ybdJ,ybdK,sokE,hokE,insL‑2 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 603466 | 0 (0.000) | 120 (1.160) | 61/94 | 0.0 | 100% | coding (1198/1248 nt) | ybdG | miniconductance mechanosensitive channel YbdG |
| ? | NC_000913 | 609352 = | 0 (0.000) | intergenic (+175/+107) | insL‑2/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyl transferase EntD | |||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
GGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTT > NC_000913/609303‑609401 | actgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgag > 1:306294‑M2/50‑50 (MQ=255) ctgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgag > 1:7991250‑M2/49‑49 (MQ=255) ctgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgag > 1:7662810‑M2/49‑49 (MQ=255) tgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGt > 1:1447859‑M2/48‑49 (MQ=255) tgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGt > 1:4571765‑M2/48‑49 (MQ=255) gcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTaa > 1:2966956‑M2/47‑50 (MQ=255) gcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTaa > 1:3993117‑M2/47‑50 (MQ=255) gcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTaa > 1:2378079‑M2/47‑50 (MQ=255) gcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTaa > 1:5573328‑M2/47‑50 (MQ=255) cttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTaa < 1:5458410‑M2/4‑1 (MQ=255) ttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATc > 1:4114138‑M2/45‑50 (MQ=255) aaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcc < 1:7209912‑M2/7‑1 (MQ=255) aaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcc < 1:4417296‑M2/7‑1 (MQ=255) aatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcccc < 1:4236573‑M2/9‑1 (MQ=255) aatccacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATccc < 1:3656015‑M2/8‑1 (MQ=255) atgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCg > 1:4513397‑M2/41‑50 (MQ=255) aggcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCg < 1:6409462‑M2/10‑1 (MQ=255) tgcccccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGc < 1:4287584‑M2/11‑1 (MQ=255) tgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCg > 1:2617194‑M2/40‑49 (MQ=255) tgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCg > 1:6688387‑M2/40‑49 (MQ=255) cccccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCa < 1:1100138‑M2/12‑1 (MQ=255) cacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCat < 1:654129‑M2/13‑1 (MQ=255) cacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCa > 1:1403453‑M2/38‑49 (MQ=255) cacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCa > 1:7569388‑M2/38‑49 (MQ=255) cacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCa > 1:3973250‑M2/38‑49 (MQ=255) acccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata > 1:4536779‑M2/37‑50 (MQ=255) acccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata > 1:6751854‑M2/37‑50 (MQ=255) acccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata < 1:365752‑M2/14‑1 (MQ=255) acccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata < 1:1128753‑M2/14‑1 (MQ=255) acccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata < 1:2406370‑M2/14‑1 (MQ=255) acccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata > 1:1753433‑M2/37‑50 (MQ=255) ccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATc < 1:6013521‑M2/16‑1 (MQ=255) ccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATc < 1:2726398‑M2/16‑1 (MQ=255) ccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATc > 1:3142779‑M2/35‑50 (MQ=255) ccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATc < 1:7185971‑M2/16‑1 (MQ=255) cgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATcc < 1:912221‑M2/17‑1 (MQ=255) cgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATcc < 1:6208294‑M2/17‑1 (MQ=255) cgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATcc > 1:6380284‑M2/34‑50 (MQ=255) cgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATcc > 1:3791945‑M2/34‑50 (MQ=255) gccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCg > 1:5503076‑M2/33‑50 (MQ=255) gccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCg > 1:2552515‑M2/33‑50 (MQ=255) ccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCgg > 1:4911471‑M2/32‑50 (MQ=255) cagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGt < 1:5543187‑M2/20‑1 (MQ=255) cagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGt < 1:8297615‑M2/20‑1 (MQ=255) cagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATACCCGGt > 1:6416042‑M2/31‑50 (MQ=255) agagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGtt > 1:7359310‑M2/30‑50 (MQ=255) agagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGtt < 1:7452968‑M2/21‑1 (MQ=255) agagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGtt > 1:5963281‑M2/30‑50 (MQ=255) agagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGtt < 1:529764‑M2/21‑1 (MQ=255) gagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTg < 1:4112389‑M2/22‑1 (MQ=255) gagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTg > 1:7346770‑M2/29‑50 (MQ=255) gagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTg < 1:3317366‑M2/22‑1 (MQ=255) gagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTg > 1:3601815‑M2/29‑50 (MQ=255) agagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgt > 1:7611521‑M2/28‑50 (MQ=255) agagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgt > 1:7734785‑M2/28‑50 (MQ=255) agagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgt < 1:2154956‑M2/23‑1 (MQ=255) gagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtc < 1:1130382‑M2/24‑1 (MQ=255) gagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgt > 1:3232165‑M2/27‑49 (MQ=255) gagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgt > 1:6866998‑M2/27‑49 (MQ=255) agcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtca < 1:1814645‑M2/25‑1 (MQ=255) agcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtca < 1:6072203‑M2/25‑1 (MQ=255) agcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgt > 1:4822320‑M2/26‑48 (MQ=255) gcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcag > 1:2744671‑M2/25‑50 (MQ=255) gaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:7861379‑M2/23‑50 (MQ=255) gaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:3752379‑M2/23‑50 (MQ=255) gaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt < 1:5622275‑M2/28‑1 (MQ=255) gaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCAGCATATCCGGTTgtcaggt < 1:4135378‑M2/28‑1 (MQ=255) aatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtc < 1:3778916‑M2/29‑1 (MQ=255) atatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:1618430‑M2/21‑48 (MQ=255) atatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:7831313‑M2/21‑48 (MQ=255) atatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:7692786‑M2/21‑48 (MQ=255) atatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:2500563‑M2/21‑48 (MQ=255) tatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtcag > 1:5029704‑M2/20‑50 (MQ=255) tcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATTCGGTTGTCAGGTCAGGa > 1:6045613‑M2/18‑50 (MQ=255) tcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGa < 1:3650577‑M2/33‑1 (MQ=255) tcattgccggtgggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGa < 1:5805170‑M2/33‑1 (MQ=255) cattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAt > 1:2672438‑M2/17‑50 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATg < 1:7313581‑M2/35‑1 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATg > 1:4827348‑M2/16‑50 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATg < 1:4274829‑M2/35‑1 (MQ=255) tgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATgg > 1:1142220‑M2/14‑49 (MQ=255) gccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGt > 1:2283420‑M2/13‑49 (MQ=255) gccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGt < 1:4764120‑M2/37‑1 (MQ=255) ccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTa < 1:7415735‑M2/38‑1 (MQ=255) cggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAg < 1:3241498‑M2/40‑1 (MQ=255) cggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAg < 1:7854084‑M2/40‑1 (MQ=255) cggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAg < 1:5926251‑M2/40‑1 (MQ=255) ggttggcgtGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAgg > 1:4015472‑M2/10‑50 (MQ=255) ggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAgg < 1:6634650‑M2/41‑1 (MQ=255) ggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAgg < 1:3823996‑M2/41‑1 (MQ=255) ggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAgg > 1:2479918‑M2/10‑50 (MQ=255) ggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAgg > 1:5459862‑M2/10‑50 (MQ=255) ggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAgg < 1:2262469‑M2/41‑1 (MQ=255) gcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCt < 1:1228215‑M2/46‑1 (MQ=255) gcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCt > 1:1243108‑M2/5‑50 (MQ=255) cgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTg > 1:4253584‑M2/4‑50 (MQ=255) cgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTg < 1:5976867‑M2/47‑1 (MQ=255) gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGc > 1:4035916‑M2/3‑50 (MQ=255) gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGc > 1:3422317‑M2/3‑50 (MQ=255) aGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCt > 1:167757‑M2/2‑50 (MQ=255) | GGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTT > NC_000913/609303‑609401 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |