Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ NC_000913 3423692–3424234 3428523–3424653 420–4832 40 [36] [36] 38 [rrfD]–[rrsD] [rrfD],rrlD,alaU,ileU,[rrsD]

TGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACAC  >  NC_000913/3423642‑3423709
                                                 |                  
tGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCg                    >  1:3295687/1‑50 (MQ=255)
  aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCg                    <  1:7565641/48‑1 (MQ=255)
  aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCg                    <  1:7459237/48‑1 (MQ=255)
  aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCg                    <  1:4314457/48‑1 (MQ=255)
  aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGc                   <  1:746250/49‑1 (MQ=255)
  aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGc                   <  1:6640800/49‑1 (MQ=255)
  aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGc                   <  1:5571338/49‑1 (MQ=255)
  aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGc                   <  1:5249152/49‑1 (MQ=255)
   gCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCAt                 <  1:1479945/50‑1 (MQ=255)
   gCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCAt                 <  1:5958823/50‑1 (MQ=255)
   gCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCAt                 >  1:5921254/1‑50 (MQ=255)
   gCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCAt                 >  1:1766637/1‑50 (MQ=255)
   gCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCAt                 <  1:3026726/50‑1 (MQ=255)
   gCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCAt                 >  1:170140/1‑50 (MQ=255)
    ccATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATg                >  1:243028/1‑50 (MQ=255)
    ccATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATg                <  1:6188076/50‑1 (MQ=255)
    ccATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATg                >  1:7562553/1‑50 (MQ=255)
     cATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATgg               <  1:3102309/50‑1 (MQ=255)
     cATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATgg               >  1:4155348/1‑50 (MQ=255)
     cATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATgg               <  1:5065184/50‑1 (MQ=255)
      atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:1714678/1‑50 (MQ=255)
      atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:266247/1‑50 (MQ=255)
      atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:3927269/1‑50 (MQ=255)
       tatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATgggg             <  1:1257501/50‑1 (MQ=255)
        atCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:6740139/1‑48 (MQ=255)
        atCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:3666144/1‑48 (MQ=255)
         tCAGAACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGga            <  1:3043220/49‑1 (MQ=255)
           aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAc         <  1:1943428/50‑1 (MQ=255)
           aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAc         <  1:6832677/50‑1 (MQ=255)
           aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAc         <  1:7348168/50‑1 (MQ=255)
            gCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcc        >  1:1999390/1‑50 (MQ=255)
            gCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcc        <  1:7325286/50‑1 (MQ=255)
             cACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       >  1:4053910/1‑50 (MQ=255)
             cACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       >  1:3656924/1‑50 (MQ=255)
               cGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCca     >  1:5179392/1‑50 (MQ=40)
                 gtAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcaca   <  1:8660/49‑1 (MQ=25)
                 cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcaca   <  1:5302698/50‑1 (MQ=38)
                 cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcaca   >  1:2346708/1‑50 (MQ=38)
                 cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcaca   <  1:4330195/50‑1 (MQ=38)
                  tAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCacac  >  1:2160270/1‑50 (MQ=35)
                                                 |                  
TGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACAC  >  NC_000913/3423642‑3423709

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: