| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 603,467 | Δ5,885 bp | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG], nfsB, ybdF, ybdJ, ybdK, sokE, hokE, insL‑2 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 603467 | 609351 | 5885 | 92 [0] | [0] 94 | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG],nfsB,ybdF,ybdJ,ybdK,sokE,hokE,insL‑2 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 603466 | 0 (0.000) | 89 (1.050) | 56/94 | 0.0 | 100% | coding (1198/1248 nt) | ybdG | miniconductance mechanosensitive channel YbdG |
| ? | NC_000913 | 609352 = | 0 (0.000) | intergenic (+175/+107) | insL‑2/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyl transferase EntD | |||||
GGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTT > NC_000913/609303‑609401 | actgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgag > 1:4012073‑M2/50‑50 (MQ=255)actgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgag > 1:400733‑M2/50‑50 (MQ=255) tgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGt > 1:4597546‑M2/48‑49 (MQ=255) cttaaatgcccccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTaa < 1:4679626‑M2/4‑1 (MQ=255) aaatgctcccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATc < 1:1071793‑M2/6‑1 (MQ=255) aaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcc < 1:1813762‑M2/7‑1 (MQ=255) aaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATc < 1:5007212‑M2/6‑1 (MQ=255) aaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATc < 1:2039948‑M2/6‑1 (MQ=255) aaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATc < 1:3664972‑M2/6‑1 (MQ=255) aatgcgcccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcccc < 1:3064334‑M2/9‑1 (MQ=255) aatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcccc > 1:949714‑M2/42‑50 (MQ=255) aatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcccc > 1:1414481‑M2/42‑50 (MQ=255) aatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcccc > 1:5567733‑M2/42‑50 (MQ=255) aatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcccc > 1:1572439‑M2/42‑50 (MQ=255) atgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCg < 1:5530628‑M2/10‑1 (MQ=255) tgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCg > 1:5162324‑M2/40‑49 (MQ=255) gcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCa > 1:3598557‑M2/39‑50 (MQ=255) gcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCa > 1:1573807‑M2/39‑50 (MQ=255) gcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCa > 1:2400898‑M2/39‑50 (MQ=255) cacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCat < 1:1286306‑M2/13‑1 (MQ=255) cacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCa > 1:1953476‑M2/38‑49 (MQ=255) acccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata > 1:4418736‑M2/37‑50 (MQ=255) cccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCatat < 1:4612899‑M2/15‑1 (MQ=255) ccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATc > 1:67391‑M2/35‑50 (MQ=255) cgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATcc < 1:510023‑M2/17‑1 (MQ=255) cgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATcc > 1:4502009‑M2/34‑50 (MQ=255) gccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCg < 1:5762453‑M2/18‑1 (MQ=255) ccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCgg < 1:4212877‑M2/19‑1 (MQ=255) ccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCgg > 1:5130074‑M2/32‑50 (MQ=255) ccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCgg > 1:6103359‑M2/32‑50 (MQ=255) cagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGt > 1:6340646‑M2/31‑50 (MQ=255) cagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGt > 1:5019814‑M2/31‑50 (MQ=255) cagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGt < 1:912274‑M2/20‑1 (MQ=255) cagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGt < 1:6601835‑M2/20‑1 (MQ=255) cagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGt > 1:6611702‑M2/31‑50 (MQ=255) cagagagcgaatatcattgccggttggcgaATAATCCCCGCATATCCGGt > 1:3034243‑M2/31‑50 (MQ=255) agagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGtt > 1:2173468‑M2/30‑50 (MQ=255) agagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGtt > 1:5537737‑M2/30‑50 (MQ=255) gagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTg > 1:4779956‑M2/29‑50 (MQ=255) gagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTg > 1:5016331‑M2/29‑50 (MQ=255) gagcgaatatcattgccggttggcgcGTAATCCCCGCATATCCGGTTgt > 1:2306199‑M2/27‑49 (MQ=255) agcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgt > 1:284454‑M2/26‑48 (MQ=255) gcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcag > 1:4713055‑M2/25‑50 (MQ=255) gcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcag > 1:43211‑M2/25‑50 (MQ=255) gcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcag < 1:2224134‑M2/26‑1 (MQ=255) cgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcagg < 1:1172496‑M2/27‑1 (MQ=255) gaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt < 1:4501846‑M2/28‑1 (MQ=255) gaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt < 1:1114698‑M2/28‑1 (MQ=255) gaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt < 1:3697159‑M2/28‑1 (MQ=255) gaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:1203470‑M2/23‑50 (MQ=255) gaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt < 1:2646230‑M2/28‑1 (MQ=255) gaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:2101477‑M2/23‑50 (MQ=255) gaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt < 1:885864‑M2/28‑1 (MQ=255) aatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:6342052‑M2/22‑49 (MQ=255) aatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:1671629‑M2/22‑49 (MQ=255) aatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:2489275‑M2/22‑49 (MQ=255) atatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:2799631‑M2/21‑48 (MQ=255) tatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtcag < 1:3201386‑M2/31‑1 (MQ=255) tatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtcag < 1:5217168‑M2/31‑1 (MQ=255) tatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtcag > 1:1853749‑M2/20‑50 (MQ=255) atcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtcag > 1:905673‑M2/19‑49 (MQ=255) tcattgcgggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGtcaggtcagg < 1:4631303‑M2/32‑1 (MQ=255) tcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGtcaggtcagg < 1:6515864‑M2/32‑1 (MQ=255) tcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGa < 1:4835420‑M2/33‑1 (MQ=255) tcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGa > 1:5929725‑M2/18‑50 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATg < 1:980664‑M2/35‑1 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATg < 1:4777463‑M2/35‑1 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATg < 1:1332802‑M2/35‑1 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATg > 1:5058712‑M2/16‑50 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATg < 1:3519210‑M2/35‑1 (MQ=255) ttgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATgg < 1:1434825‑M2/36‑1 (MQ=255) ttgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATgg < 1:877910‑M2/36‑1 (MQ=255) ttgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATgg > 1:294960‑M2/15‑50 (MQ=255) ttgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATgg < 1:6244393‑M2/36‑1 (MQ=255) gccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGt < 1:6694729‑M2/37‑1 (MQ=255) ccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGt > 1:6418425‑M2/12‑48 (MQ=255) ccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTaa < 1:3216453‑M2/39‑1 (MQ=255) ccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTa < 1:5822923‑M2/38‑1 (MQ=255) ggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAgg < 1:4506027‑M2/41‑1 (MQ=255) ggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAgg > 1:2497136‑M2/10‑50 (MQ=255) gttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGc < 1:1162314‑M2/42‑1 (MQ=255) tggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAc > 1:4294366‑M2/7‑50 (MQ=255) ggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAcc > 1:1717258‑M2/6‑50 (MQ=255) ggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAcc > 1:865692‑M2/6‑50 (MQ=255) gcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAcc < 1:2030274‑M2/45‑1 (MQ=255) gcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCt < 1:2659289‑M2/46‑1 (MQ=255) gcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCt > 1:425015‑M2/5‑50 (MQ=255) cgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTg < 1:3615203‑M2/47‑1 (MQ=255) cgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTg < 1:3534208‑M2/47‑1 (MQ=255) gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGc > 1:2037051‑M2/3‑50 (MQ=255) aGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCt > 1:3887841‑M2/2‑50 (MQ=255) gTAGTCCCCGCATGTCCGGTTGTCGGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCtt < 1:3686172/50‑1 (MQ=255) gTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCtt < 1:4239515/50‑1 (MQ=255) gTAATCCCCGCATATACGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCtt > 1:3794391/1‑50 (MQ=255) | GGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTT > NC_000913/609303‑609401 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |