| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,299,499 | Δ1,199 bp | insH21 | insH21 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1299499 | 1300697 | 1199 | 92 [0] | [0] 92 | insH21 | insH21 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1299498 | 0 (0.000) | 84 (1.030) | 54/90 | 0.0 | 100% | intergenic (+253/‑33) | ychE/insH21 | putative inner membrane protein/IS5 transposase and trans‑activator |
| ? | NC_000913 | 1300698 = | 0 (0.000) | intergenic (+151/‑484) | insH21/oppA | IS5 transposase and trans‑activator/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
GACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAT > NC_000913/1300649‑1300747 | ttgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa > 1:6054509‑M2/50‑50 (MQ=255)ttgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa < 1:2148540‑M2/1‑1 (MQ=255) gaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat > 1:4581730‑M2/48‑49 (MQ=255) gaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat > 1:2220103‑M2/48‑49 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa < 1:4087147‑M2/4‑1 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa > 1:1471873‑M2/47‑50 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa > 1:2922296‑M2/47‑50 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa < 1:2412821‑M2/4‑1 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaata < 1:5915912‑M2/3‑1 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaata < 1:2179582‑M2/3‑1 (MQ=255) aatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataat < 1:1471035‑M2/5‑1 (MQ=255) aatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataat < 1:3764703‑M2/5‑1 (MQ=255) aatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataat < 1:2144368‑M2/5‑1 (MQ=255) atgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataata < 1:561032‑M2/6‑1 (MQ=255) tattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCa < 1:4647714‑M2/10‑1 (MQ=255) ttattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCaa < 1:2780978‑M2/11‑1 (MQ=255) ttattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAAt > 1:5669936‑M2/39‑50 (MQ=255) ttattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAAt > 1:1688368‑M2/39‑50 (MQ=255) ttattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAAt < 1:4723833‑M2/12‑1 (MQ=255) tattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAAtt > 1:6230342‑M2/38‑50 (MQ=255) ttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt > 1:202856‑M2/36‑50 (MQ=255) ttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt < 1:6699347‑M2/15‑1 (MQ=255) taattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt > 1:296257‑M2/35‑49 (MQ=255) taattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt > 1:1002740‑M2/35‑49 (MQ=255) aattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTgtg < 1:5845855‑M2/16‑2 (MQ=255) aattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGtt > 1:6294951‑M2/34‑49 (MQ=255) aattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGtt > 1:2846031‑M2/34‑49 (MQ=255) attccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaa < 1:4766235‑M2/18‑1 (MQ=255) attccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaa < 1:4864526‑M2/18‑1 (MQ=255) attccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTa < 1:519980‑M2/17‑1 (MQ=255) attccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTa > 1:3414661‑M2/33‑49 (MQ=255) ttccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa < 1:2809267‑M2/19‑1 (MQ=255) ttccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa > 1:1486454‑M2/32‑50 (MQ=255) tccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAat > 1:882634‑M2/31‑50 (MQ=255) ccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAat < 1:1464224‑M2/20‑1 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAatta < 1:4984447‑M2/22‑1 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAatta > 1:3286565‑M2/29‑50 (MQ=255) actgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattat < 1:4882631‑M2/23‑1 (MQ=255) actgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattat > 1:2328867‑M2/28‑50 (MQ=255) actgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattat > 1:5624805‑M2/28‑50 (MQ=255) actgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattat < 1:890578‑M2/23‑1 (MQ=255) ctgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattatt > 1:6339007‑M2/27‑50 (MQ=255) ctgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattatt < 1:936350‑M2/24‑1 (MQ=255) ctgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattatt > 1:1537633‑M2/27‑50 (MQ=255) ctgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattatt < 1:2452298‑M2/24‑1 (MQ=255) ctgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattatt < 1:820325‑M2/24‑1 (MQ=255) gcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgt > 1:6351366‑M2/25‑50 (MQ=255) gcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgt > 1:2249538‑M2/25‑50 (MQ=255) gcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgt > 1:1309767‑M2/25‑50 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtg < 1:2940833‑M2/25‑1 (MQ=255) tttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCa > 1:5503741‑M2/22‑50 (MQ=255) ttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAt > 1:262481‑M2/21‑50 (MQ=255) ttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAt > 1:3741960‑M2/21‑50 (MQ=255) tggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAtt > 1:1363379‑M2/20‑50 (MQ=255) tggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAtt > 1:5704382‑M2/20‑50 (MQ=255) tggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAt < 1:6655188‑M2/30‑1 (MQ=255) ggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt > 1:1782966‑M2/19‑50 (MQ=255) ggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAtt < 1:1516500‑M2/31‑1 (MQ=255) ggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAtt < 1:1841151‑M2/31‑1 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt > 1:4593965‑M2/18‑49 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt > 1:4350772‑M2/18‑49 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt < 1:2163105‑M2/32‑1 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc < 1:4961314‑M2/33‑1 (MQ=255) gaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCact < 1:6141287‑M2/36‑1 (MQ=255) gaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac > 1:1224289‑M2/15‑49 (MQ=255) aggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCacta > 1:4792243‑M2/14‑50 (MQ=255) ggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactac < 1:5651439‑M2/38‑1 (MQ=255) ggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactac > 1:3272399‑M2/13‑50 (MQ=255) ggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactac < 1:6345537‑M2/38‑1 (MQ=255) gaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactact < 1:3754546‑M2/39‑1 (MQ=255) gaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactact < 1:3706297‑M2/39‑1 (MQ=255) gaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactact < 1:5234917‑M2/39‑1 (MQ=255) aaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg < 1:5066328‑M2/40‑1 (MQ=255) aaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg > 1:89955‑M2/11‑50 (MQ=255) aaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg < 1:2863889‑M2/40‑1 (MQ=255) aaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg > 1:4103600‑M2/11‑50 (MQ=255) aaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg > 1:5800780‑M2/11‑50 (MQ=255) gtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGaa < 1:3926522‑M2/43‑1 (MQ=255) gtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGaa > 1:2558719‑M2/8‑50 (MQ=255) tgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAAc < 1:5543459‑M2/44‑1 (MQ=255) tgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAAc > 1:5671115‑M2/7‑50 (MQ=255) gctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACt > 1:4762189‑M2/6‑50 (MQ=255) gctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACt > 1:1789492‑M2/6‑50 (MQ=255) gctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACt > 1:843795‑M2/6‑50 (MQ=255) ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACt < 1:2094666‑M2/45‑1 (MQ=255) ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTg > 1:3409763‑M2/5‑50 (MQ=255) taaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTg > 1:6137837‑M2/4‑49 (MQ=255) taaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTg > 1:2335261‑M2/4‑49 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGt < 1:5257015‑M2/47‑1 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTaa > 1:5901283‑M2/2‑50 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTaa > 1:6434246‑M2/2‑50 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAt < 1:938124/50‑1 (MQ=255) | GACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAT > NC_000913/1300649‑1300747 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |