Missing coverage evidence...
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CAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACAC  >  NC_000913/3423638‑3423709                                                  |                       cAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTAct                        >  1:3835658/1‑50 (MQ=255) cAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTAct                        >  1:4218735/1‑50 (MQ=255)  aaCTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTActc                       >  1:4055651/1‑50 (MQ=255)  aaCTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTActc                       >  1:2877675/1‑50 (MQ=255)   aCTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTActct                      >  1:4830903/1‑50 (MQ=255)   aCTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTActct                      <  1:4457348/50‑1 (MQ=255)   aCTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTActct                      <  1:4533987/50‑1 (MQ=255)    cTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACtctc                     <  1:5688604/50‑1 (MQ=255)    cTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACtctc                     <  1:5865203/50‑1 (MQ=255)    cTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACtctc                     >  1:6218998/1‑50 (MQ=255)     tGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCg                    >  1:4385264/1‑50 (MQ=255)       aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCg                    <  1:2349795/48‑1 (MQ=255)       aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCa                  >  1:4963277/1‑50 (MQ=255)        gCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCAt                 >  1:3006584/1‑50 (MQ=255)        gCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCAt                 >  1:217715/1‑50 (MQ=255)         ccATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATg                >  1:1887864/1‑50 (MQ=255)         ccATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATg                >  1:6024131/1‑50 (MQ=255)         ccATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATg                >  1:6541429/1‑50 (MQ=255)          cgtatCAGCACGGTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATgg               <  1:1014921/48‑1 (MQ=17)          cATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATgg               <  1:2713812/50‑1 (MQ=255)          cATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATgg               <  1:249131/50‑1 (MQ=255)           atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              <  1:3808554/50‑1 (MQ=255)           atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              <  1:2627629/50‑1 (MQ=255)           atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              <  1:6439066/50‑1 (MQ=255)           atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              <  1:260013/50‑1 (MQ=255)           atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:2447100/1‑50 (MQ=255)            tatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:2490691/1‑49 (MQ=255)             atCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:5604061/1‑48 (MQ=255)              tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgag           <  1:3796973/50‑1 (MQ=255)              tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGga            <  1:4452016/49‑1 (MQ=255)              tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGga            <  1:1968443/49‑1 (MQ=255)                aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgaga          <  1:864422/49‑1 (MQ=255)                aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAc         >  1:4830563/1‑50 (MQ=255)                aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAc         >  1:4563290/1‑50 (MQ=255)                  cACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       <  1:5606190/50‑1 (MQ=255)                  cACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       >  1:5835233/1‑50 (MQ=255)                  cACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       >  1:819073/1‑50 (MQ=255)                  cACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       >  1:3930003/1‑50 (MQ=255)                   aCGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcccc      <  1:2323075/50‑1 (MQ=255)                   aCGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       >  1:544492/1‑49 (MQ=255)                     gCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcac    <  1:501172/50‑1 (MQ=38)                        aaaTTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCacac  >  1:6203905/1‑49 (MQ=32)                        aaaTTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCacac  >  1:3281580/1‑49 (MQ=32)                                                  |                       CAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACAC  >  NC_000913/3423638‑3423709

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑