Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ NC_000913 3423687–3424651 3428530–3424653 3–4844 52 [50] [46] 52 [rrfD]–[rrsD] [rrfD],rrlD,alaU,ileU,[rrsD]

CCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACAC  >  NC_000913/3423637‑3423709
                                                 |                       
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ccAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTAc                         <  1:5703353/50‑1 (MQ=255)
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 cAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTAct                        <  1:4546301/50‑1 (MQ=255)
 cAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTAct                        <  1:2198144/50‑1 (MQ=255)
   aCTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTActct                      <  1:6333517/50‑1 (MQ=255)
   aCTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTActct                      <  1:2277888/50‑1 (MQ=255)
    cTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACtctc                     <  1:5724512/50‑1 (MQ=255)
    cTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACtctc                     >  1:5726785/1‑50 (MQ=255)
    cTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACtctc                     <  1:5999273/50‑1 (MQ=255)
     tGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCg                    >  1:6187076/1‑50 (MQ=255)
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       aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCg                    <  1:1712129/48‑1 (MQ=255)
       aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCa                  <  1:2635437/50‑1 (MQ=255)
       aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCa                  <  1:7280105/50‑1 (MQ=255)
       aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCa                  >  1:793899/1‑50 (MQ=255)
        gCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCAt                 <  1:6519155/50‑1 (MQ=255)
        gCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCAt                 <  1:4882275/50‑1 (MQ=255)
        gCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCAt                 <  1:3706825/50‑1 (MQ=255)
        gCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCAt                 >  1:4039783/1‑50 (MQ=255)
        gCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCAt                 <  1:4054746/50‑1 (MQ=255)
         ccATATCAGCCCGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATg                <  1:5587620/50‑1 (MQ=255)
         ccATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATg                <  1:4719695/50‑1 (MQ=255)
          cATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATgg               <  1:5394960/50‑1 (MQ=255)
           atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:4091649/1‑50 (MQ=255)
           atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:3263251/1‑50 (MQ=255)
           atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:2933316/1‑50 (MQ=255)
            tatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:2733723/1‑49 (MQ=255)
              tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:1774034/1‑47 (MQ=255)
              tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:2516835/1‑47 (MQ=255)
              tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:5968107/1‑47 (MQ=255)
              tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgag           <  1:4702983/50‑1 (MQ=255)
              tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgag           <  1:259443/50‑1 (MQ=255)
              tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGga            <  1:1568850/49‑1 (MQ=255)
                ggCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgaga          <  1:1995374/48‑1 (MQ=255)
                aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAc         >  1:2760571/1‑50 (MQ=255)
                aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAc         >  1:7091524/1‑50 (MQ=255)
                aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAc         >  1:6511902/1‑50 (MQ=255)
                  cACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       >  1:2976269/1‑50 (MQ=255)
                  cACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       <  1:3840373/50‑1 (MQ=255)
                   aCGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       >  1:7253533/1‑49 (MQ=255)
                   aCGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc       >  1:3476950/1‑49 (MQ=255)
                    cGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCca     >  1:4569720/1‑50 (MQ=40)
                     gCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcccc      <  1:4433675/48‑1 (MQ=38)
                     gCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcac    <  1:6348515/50‑1 (MQ=38)
                     gCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcac    <  1:1889651/50‑1 (MQ=38)
                      cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcaca   <  1:6660970/50‑1 (MQ=38)
                      cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcaca   <  1:3393927/50‑1 (MQ=38)
                      cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcaca   >  1:3937414/1‑50 (MQ=38)
                      cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcaca   >  1:1337317/1‑50 (MQ=38)
                       tAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCacac  >  1:1125946/1‑50 (MQ=35)
                                                 |                       
CCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACAC  >  NC_000913/3423637‑3423709

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: