Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,844,219 | 0 | T | G | 30.3% | 251.6 / 15.4 | 99 | F86V (TTT→GTT) | adeD | cryptic adenine deaminase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (24/45); new base G (30/0); total (54/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.99e-11 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
AAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCG‑TCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCT‑GGTTTGCCCG‑CTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCA > NC_000913/3843985‑3844456 | aaaTTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCTGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCCGGGGTTAt > 1:1708735/1‑239 (MQ=255) atcaCATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTTCTGGTGTTTGCGCAGAAAAAACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGGGCCCGGGGTtttttgtgc > 2:2285827/1‑233 (MQ=255) aTTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCt < 1:2285827/239‑1 (MQ=255) tAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGc < 1:1846127/239‑1 (MQ=255) ccGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGGGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGGGCCCGGGGTTTTTGATGCCCACCTGccat > 2:1846127/1‑236 (MQ=255) gCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCCGGGGTTTTTTTTGCTCACCTGGCTAtttc > 2:819276/1‑237 (MQ=255) gCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGGTTATTGATTGTCACCTGCATATTGa > 1:1898518/1‑239 (MQ=255) aTTGATAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGAGTCCGGGGTTTTTTTTGCTCCCCCTCACATTTAATACCGCAggaaga > 2:1384499/1‑239 (MQ=255) tGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATc < 1:1211559/226‑1 (MQ=255) ttCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGGTTTTTGTTGCTCACCTGCACATTTTATCCAGccctgtg > 2:1211559/1‑220 (MQ=255) ttCCCGTGGCGACGCTGTTGCAGATTATATTATTGATCATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGTCATGGGTTTTTGTTTGTCACCTCGATATTTGATCCATCatgatgtagcccggc > 2:1963706/1‑226 (MQ=255) ggCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAAc < 1:1268677/239‑1 (MQ=255) ttatattatTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAGTCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCcgcgc < 1:1380685/238‑1 (MQ=255) ttatattatTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCcgcgc < 1:1437598/238‑1 (MQ=255) tattatTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAAc < 1:1203837/219‑1 (MQ=255) ttGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGGGCCAGGGGTTTTTTGTGGTCACCCCCATATTTGATCCCGCATGGTGAAACCGGGCCCCTTTTTAACCCCCACCCCGCCGCCCgggcctgcc > 2:1437598/1‑232 (MQ=255) gATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGGCTgacga > 1:2305864/1‑238 (MQ=255) gATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAAATGCGGGGCCCGGGGTTTTTGATTCTCCCCCTCCTACTGAATCCCGGCTGATGAAGCCGGGCACTTTTTAAAACACTACCCTCCCCCCCgggcctgcga > 2:1825702/1‑230 (MQ=255) aTAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCcgc < 2:816702/225‑1 (MQ=255) aTAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCcgc > 1:816702/1‑225 (MQ=255) aaTGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACg < 2:65494/192‑1 (MQ=255) aaTGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACg > 1:65494/1‑192 (MQ=255) aaTGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGGTTTTTTATTCTCACCCGCATATTGAATTCCGCATGGTGACCGCGGGCTCTTTTTAAACCCCTACCCCGCCGCCCGGccctgaga > 2:2358090/1‑229 (MQ=255) aaTGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGGTTATTTATGCTCACCTGCCTATTGAATCCAGCATGAATACGCCGGGCACTTTTGTAAACGCTAacccg > 2:1203837/1‑217 (MQ=255) tctcTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCa < 1:1604463/160‑1 (MQ=255) ctctATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGaa < 1:664173/172‑1 (MQ=255) ctctATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGa < 1:573237/201‑1 (MQ=255) ctctATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGGGTCAGGGGTTTTTGATGCTCACCCTCATTTTGAAACCAGCCTGATGCCGCCGGGCACTTTTTAAACCGCCTCACGGCCGCGCGGCCGGGAGACCGGTAttt > 2:5323/1‑239 (MQ=255) ttCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAACTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTc < 1:1322341/188‑1 (MQ=255) cGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTc < 1:1316144/239‑1 (MQ=255) cGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGGGCCAGGGGTTATTGATGTTCACCTGCATAtt > 2:1604463/1‑160 (MQ=255) gACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCCGGGGTTTTTTGTGCTCCCCCTCCTATTTAATCCCGCCTGATGTACCCGGTCACTTTTTAAAACGCCAcc > 2:573237/1‑201 (MQ=255) gACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGGGCCAGGGGTTTTTTATTCTCACCCTCCTTTTTAATCCCGCctga > 2:664173/1‑172 (MQ=255) gATCAATGGCGGAGAAACTTCCGGCCCCATTGTGCTTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCCGGGGTTATTTTTGTTCACCTTCATATTTTATCCAGCATGGTGACGCCGGGCCCttttttaa > 2:1322341/1‑184 (MQ=255) aTCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGGGCCAGGGGTTTTTGATGCTCACCCGCATATTTGATCCCGCATGATTACCCCCGTCTCTTTTGTAACCACCTCCCCGCCGCCGCGCCTGTCGACCGCTATTTTCGTCCCCCactcaag > 2:2241794/1‑233 (MQ=255) tGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCCGGGGTTTTTGATGCCCACCTCGCTATTTAATCCAGCAGGATTACCCCGGTCACTTTTTAAAACCCCACCCCGCCGCGCGGCCCTGCGACCCTTATTTTCGGCCCTCATGAAAACgccc > 2:911211/1‑236 (MQ=255) ttCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGt < 1:2304798/201‑1 (MQ=255) aTTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGGGCCAGGGGTTTTTGATGCTCCCCTGCCTATTGAATCCAGGATGATGACCCCGGTCACTTTTGAAAACGCTACCCCTCCGCGCGGCCTGGCGACCGTTATTTGCggc > 2:2304798/1‑199 (MQ=255) aGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATg < 2:2381029/101‑1 (MQ=255) aGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATg > 1:2381029/1‑101 (MQ=255) tACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGa < 1:1876553/182‑1 (MQ=255) ccGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCCACGGCGGGGGCAGGGGTTATTGTTGCTCACCTGCCAATTGGATCCAGCATGCTGAGTGCGGTCCCTTTTTAAAACGCTTCCCCGCCGCCCGGCCTGACGGCCGTTATTTTCTGCCCTACTGAAATCGTTCAAGGT‑AGGGGCGGAACCGGTTTTGCCC‑TGTTTGACCG‑ccggtgcgtc > 2:1400927/1‑230 (MQ=255) ccGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGt < 1:1814088/166‑1 (MQ=255) gtgtTGGCGCAGAATGCACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATg < 2:1036234/84‑1 (MQ=255) gtgtTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATg > 1:1036234/1‑84 (MQ=255) gtgtTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCatg > 2:1321888/1‑110 (MQ=255) gtgtTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCatg < 1:1321888/110‑1 (MQ=255) gtgtTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGGTTATTTATGCTCACCTGCATATTGAATCCCGCATGATGACGCCGGGCACTTTTTAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGGTTTTTGCGCCCCTCATGaa > 2:1876553/1‑182 (MQ=255) tgtTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGc < 1:1270483/92‑1 (MQ=255) tgtTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCG‑TCAACGTGATGGGCGAAGc < 1:325445/204‑1 (MQ=255) gtTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTTTTGATGCTCACCTGCATTTTTAATTCATCCTGATTGAGCCGGTCCCTTTTTAAACCGCTACCCTGCCCCGCGGCCTGACGACCGTTATTTTCGACCCTCACGAAATTG‑TTAATGTGAATGGGGAAGCCGGGTTCGCCTGGGTTTGCCC‑‑CCGTTCCGCACaggc > 2:527770/1‑239 (MQ=255) gtTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGACACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCG‑TCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCT‑GGTTTGCCCG‑CTGTGCCGAACagg < 1:1963706/238‑1 (MQ=255) ttGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCG‑TCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCT‑GGTTTGCCCG‑CTGTGCCGAACaggca > 1:494129/1‑239 (MQ=255) ttGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGGGCCCGGGGTTATTGATGACCTCCTGCATATTGAATCCAGCAAGAAGACCACGGTCCCTTTTGAAAACGCGACCCTGCCGCGCGGCCCGAAGACCGTTATTTGCGAACCCCATGAAATCG‑TCCACGTGATGGGCGAAGCAGGGTTCTCCT‑GGTTTTCCCC‑CTGTGCCCAACaggca > 2:429674/1‑239 (MQ=255) cgcAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCCGGGGTTATTGATGCTCACCCGCATATTTAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTTAAACCCCTACCCTGCCGCGCGGCCCGACGACCGTTATTTGCGAc > 2:1814088/1‑166 (MQ=255) cgcAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTTATGCTCCCCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCCCTTTTGAAACCGCTACCCCGCCGCCCGGGCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCCTGAAATCG‑TCCACGGGATTGGCGAAGCCGGGTTCGGCC‑GGTTTGCCCGCCTGGGCCAAAc‑ggcaaggc > 2:2305439/1‑239 (MQ=255) cgcAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGCGCCAGGGGTTATTTATGCTCCCCTGCATATTGAAAACAGCATGATTAAGCCGGTTACTTTTGTAACCGCCACCCCTACGCGCGGCCCGACGACCGCTATTTTCGACACCCTTAGAAACC‑TCAAAGCGATAGGGGAAGCCGGGATCTCCC‑GGGTTTCGCG‑CGGTGCCCGACagcgaaggc > 2:2014266/1‑239 (MQ=255) gAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGGCGGGGGTTTTTTCTGCTCATCAGTATATTTaaag > 2:1270483/1‑90 (MQ=255) aaTACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTc < 1:931326/110‑1 (MQ=255) aaTACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCG‑TCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCT‑GGTTTGCCCG‑CTGTGCCGAACaggcaaggc < 1:773495/234‑1 (MQ=255) tACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTg < 1:848879/155‑1 (MQ=255) gATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCG‑TCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCT‑GGTTTGCCCG‑CTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAAc < 1:1736843/231‑1 (MQ=255) gATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCG‑TCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCT‑GGTTTGCCCG‑CTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGt < 1:911211/235‑1 (MQ=255) aTGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGTGACCCTCATGAAATCG‑GCCACGTGATGGGCGAAGCCGGATTTGCCC‑GGGTTGCCCG‑CTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTAcct > 2:100084/1‑236 (MQ=255) tGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTTCCAGGGGTTTTTGATGCTCCCCTGCATATTTTATCCAGCAAGAAGACGCCGGTCACTTTTGaaa > 2:931326/1‑110 (MQ=255) tGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTAt < 2:525729/57‑1 (MQ=255) tGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTAt > 1:525729/1‑57 (MQ=255) tGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCa > 2:591579/1‑66 (MQ=255) tGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCa < 1:591579/66‑1 (MQ=255) tGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAg < 2:296995/84‑1 (MQ=255) tGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGaa < 2:539993/160‑1 (MQ=255) tGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGaa > 1:539993/1‑160 (MQ=255) tGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCAAATTGAATTCAg > 1:296995/1‑84 (MQ=255) tGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGGTTTTTGATGCTCACCCGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCCGCCGCGCGGCCTGACGCCCGTTATTTGCGACCCTCATGAAAACG‑TCAACGGGATGGGCGAAGCCGGGTTCGCCC‑GGTTTGTCCG‑CCTGGCCGAACAGGCAAGGCAAAAACAGTAc > 2:773495/1‑235 (MQ=255) cTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCCGGGGTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTTTAACCGCTACCCTGCCTCGCGGCCTGCCGGCCGTTAATTGCGACCCTCCTTAAATCG‑TCCACGTGATGGGCGGAGCCGGCTTCTCCT‑GGTTTTCCCC‑CTGTGCCGAACAGGCAAGGCCAAACCAGTACTTAc > 2:1736843/1‑237 (MQ=255) cTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATg > 1:538695/1‑60 (MQ=255) cTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATg < 2:538695/60‑1 (MQ=255) cTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGa > 1:2024175/1‑106 (MQ=255) cTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGa < 2:2024175/106‑1 (MQ=255) cTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCG‑TCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCT‑GGTTTGCCCG‑c < 2:43511/203‑1 (MQ=255) cTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCG‑TCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCT‑GGTTTGCCCG‑c > 1:43511/1‑203 (MQ=255) cTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGGTTTTTGGTGCTCACCTGCAGATTGAATCCAGCATGATGACGCCCGCCCCCTTTGAAACCGCTCCCCTGCCGCGCCGCCTGCCGACCGTTTTTTGGGACCCTCAt > 2:848879/1‑155 (MQ=255) ccGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCg > 2:294592/1‑145 (MQ=255) ccGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCg < 1:294592/145‑1 (MQ=255) ccGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCG‑TCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCT‑GGTTTGCCCG‑CTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGt < 1:1384499/239‑1 (MQ=255) cGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTTGTGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGAAGCCGGTCACTTTTTAAACCGCCACCCTGCCGCGCGGCCCGACGACCCGTATTTGCGACCCTCATGGAATCG‑TCAACGTGATTGGCGAAGCCGGATTTGCCC‑GGTTTGTCCG‑CTGTGCCCAAACGGGAAGGCCAAACCAGTACTTACAGGTc > 2:1916620/1‑239 (MQ=255) gCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTTATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCCGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCG‑TCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCT‑GGTTTGCCCG‑CTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCa > 1:507342/1‑238 (MQ=255) cTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCG‑TCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCT‑GGTTTGCCCG‑CTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAg < 1:2358090/238‑1 (MQ=255) cAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTTGTGCCCACCCGCATATTTAATCCAGCAAGATGACCCCGGTCACTTTTTAAACCCCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGCCCGCTTTTTGTGACCCTCATGAAATCG‑CGCACGTGAGGGGCGGAGCCGGGTTGCCCC‑GGTTTGCCCG‑CCGTGCCGCACAGGCCAGGCAAAACCAGAACTTAAAggcaactcctt > 2:910612/1‑229 (MQ=255) gATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGcc > 1:1622916/1‑45 (MQ=255) gATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCt < 2:1622916/46‑1 (MQ=255) aTTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCG‑TCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCT‑GGTTTGCCCG‑CTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTAc < 1:819276/238‑1 (MQ=255) tGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCG‑TCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCT‑GGTTTGCCCG‑CTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCg < 2:494129/239‑1 (MQ=255) ggcgCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCg < 2:2128259/118‑1 (MQ=255) ggcgCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCg > 1:2128259/1‑118 (MQ=255) gcAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCCCCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCG‑TCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCT‑GGTTTGCCCG‑CTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCt < 1:5323/238‑1 (MQ=255) tGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCG‑TCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCT‑GGTTTGCCCG‑CTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTaa < 1:1825702/238‑1 (MQ=255) gTTTATTGATGCTCCCCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCG‑TCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCT‑GGTTTGCCCG‑CTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGc < 1:429674/237‑1 (MQ=255) gTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCG‑TCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCT‑GGTTTGCCCG‑CTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGAACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGGGCCa > 1:1023994/1‑239 (MQ=255) | AAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCG‑TCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCT‑GGTTTGCCCG‑CTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCA > NC_000913/3843985‑3844456 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |