Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,510,524 | C→A | intergenic (+391/+166) | yjhV → / ← fecE | pseudogene, KpLE2 phage‑like element/ferric citrate ABC transporter ATPase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,510,524 | 0 | C | A | 100.0% | 151.5 / NA | 39 | intergenic (+391/+166) | yjhV/fecE | pseudogene, KpLE2 phage‑like element/ferric citrate ABC transporter ATPase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (19/20); total (19/20) |
ATTGGTAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTGGCACAGAGCGAAATTTTTTGATCTCCCCCCTGAAATCTAAACTTAGTCATGTCACGTTTTTGGGTTTCTAAAATTTTAACTTCGCGTTTTTCGTTGCCGTAAGGGTTATACAGAAATGTCCGTTAAGCAGAGTTCAAAATTGATTGCCGTGATCACGACTGGTTTGAAAGCCGCGCCCAAGCCTGTACAGCTCTGGTTTGCGTTGATTATGAACCTGTCAGCCTAAAGCAAGCGGATGGACGATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGCCAGTCCAGTTTCATTCAGTCGTGGTTTGGTTCTTACGGCCTGTGCAATCTACCTCATTAGGCACATCGGCCTGCCAGATACCGGCTCGGGGTGTATTTCCGCTTCCACG > NC_000913/4510298‑4510750 | aTTGGTAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTGGCACAGAGCGAAATTTTTTGATCTCCCCCCTGAAATCTAAACTTAGTCATGTCACGTTTTTGGGTTTCTAAAATTTTAACTTCGCGTTTTTCGTTGCCGTAAGGGTTATACAGAAATGTCCGTTAAGCAGAGTTCAAAATTGATTGCCGTGATCACGACTGGTTTGAAAGCCGCGCCCAAGCCTGTACAGATCTGGTTTGCGt < 1:555334/239‑1 (MQ=255) tGAATGTCCGCTCTGGCACAGAGCGAAATTTTTTGATCTCCCCCCTGAAATCTAAACTTAGTCATGTCACGTTTTTGGGTTTCTAAAATTTTAACTTCGCGTTTTTCGTTGCCGTAAGGGTTATACAGAAATGTCCGTTAAGCAGAGTTCAAAATTGATTGCCGTGATCACGACTGGTTTGAAAGCCGCGCCCAAGCCTGTACAGATCTGGTTTGCGTTGATTa < 1:725525/224‑1 (MQ=255) 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ATTGGTAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTGGCACAGAGCGAAATTTTTTGATCTCCCCCCTGAAATCTAAACTTAGTCATGTCACGTTTTTGGGTTTCTAAAATTTTAACTTCGCGTTTTTCGTTGCCGTAAGGGTTATACAGAAATGTCCGTTAAGCAGAGTTCAAAATTGATTGCCGTGATCACGACTGGTTTGAAAGCCGCGCCCAAGCCTGTACAGCTCTGGTTTGCGTTGATTATGAACCTGTCAGCCTAAAGCAAGCGGATGGACGATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGCCAGTCCAGTTTCATTCAGTCGTGGTTTGGTTCTTACGGCCTGTGCAATCTACCTCATTAGGCACATCGGCCTGCCAGATACCGGCTCGGGGTGTATTTCCGCTTCCACG > NC_000913/4510298‑4510750 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |