Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,968,222 | Δ1 bp | coding (307/1104 nt) | wecA → | UDP‑GlcNAc:undecaprenylphosphate GlcNAc‑1‑phosphate transferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,968,222 | 0 | A | . | 100.0% | 954.5 / NA | 196 | coding (307/1104 nt) | wecA | UDP‑GlcNAc:undecaprenylphosphate GlcNAc‑1‑phosphate transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base . (102/94); total (102/94) |
Only 100 of 196 total aligned reads displayed.
GTAAGGTGGCAAAAAAAGTCGGTTTAGTGGATAAACCAAACTTCCGCAAACGTCACCAGGGATTGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACCATACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGATGGCATTGATGGCTTGCTGGGCGGGTTGTCCTGCGTCTCGTTTGCAGCAATCGGTATGATTTTGTGGTTCG > NC_000913/3967989‑3968453 | aaGGTGGCAAAAAAAGTCGGTTTAGTGGATAAACCAAACTTCCGCAAACGTCACCAGGGATTGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGcc < 1:1132402/239‑1 (MQ=255) cAAAAAAAGTCGGTTTAGTGGATAAACCAAACTTCCGCAAACGTCACCAGGGATTGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTg > 1:763601/1‑239 (MQ=255) tCGGTTTAGTGGATAAACCAAACTTCCGCAAACGTCACCAGGGATTGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTa > 1:153516/1‑239 (MQ=255) cGGTTTAGTGGATAAACCAAACTTCCGCAAACGTCACCAGGGATTGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTg < 1:532229/235‑1 (MQ=255) tttAGTGGATAAACCAAACTTCCGCAAACGTCACCAGGGATTGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTatgat > 2:2039890/1‑239 (MQ=255) tttAGTGGATAAACCAAACTTCCGCAAACGTCACCAGGGATTGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTatga < 1:1849066/238‑1 (MQ=255) aaaCCAAACTTCCGCAAACGTCACCAGGGATTGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGc > 1:1490160/1‑239 (MQ=255) aaCCAAACTTCCGCAAACGTCACCAGGGATTGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCa < 1:1922572/239‑1 (MQ=255) aCTTCTGCAAACGTCACCAGGGATTGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCttt > 2:131754/1‑239 (MQ=255) aCTTCCGCAAACGTCACCAGGGATTGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCttt > 1:1500688/1‑239 (MQ=255) aCTTCCGCAAACGTCACCAGGGATTGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCttt > 2:1752475/1‑239 (MQ=255) cTTCCGCATACCTCACCAGGGATTTATACCTCTCGTTGGGGGTATTTCGGTTTACGCGAGGATTTGCTTCACGTTCGGTATTGTCGATTATTAGATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGGGCCGGTGTGCTTGCTTTCATTGGCGCGCTGGATGTCCGTTCTGATAACAGAGGAAAAAACCGCGGCACC‑TACACGCGGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCCGCAAGCTTTa < 2:134773/239‑1 (MQ=255) ttCCGCAAACGTCACCAGGGATTGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTAt < 1:1752475/239‑1 (MQ=255) cGTCACCAGGGATTGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGc < 1:865466/239‑1 (MQ=255) cGTCACCAGGGATTGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGc < 1:795101/239‑1 (MQ=255) gTCACCAGGGATTGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCa > 2:1806452/1‑221 (MQ=255) gTCACCAGGGATTGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCa < 1:1806452/221‑1 (MQ=255) gTCACCAGGGATTGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGcc < 1:1978724/239‑1 (MQ=255) gTCACCAGGGATTGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGcc < 1:1319775/239‑1 (MQ=255) tCACCAGGGATTGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCAt > 2:916603/1‑200 (MQ=255) gATTGATGCCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCCGGGATTTTCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTTTCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGtt < 1:1847098/236‑1 (MQ=255) gATTGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGGTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGtt < 1:250118/236‑1 (MQ=255) tGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGc < 1:927918/180‑1 (MQ=255) aTACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCttt > 1:1436279/1‑239 (MQ=255) aCCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTgg < 2:1374437/239‑1 (MQ=255) aCCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTgg < 1:1266365/239‑1 (MQ=255) ctctCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATc > 1:264698/1‑232 (MQ=255) tctcGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCt > 1:2107942/1‑238 (MQ=255) ctcGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGGTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCTTTTTGATATCAGCGTAAAAATTCGTGCCACC‑TACAGGCCGATGTTGGCATTATTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCCCAGTAGCCTGGCGTATATCTTTGGCt > 2:2043954/1‑237 (MQ=255) ctcGTTGGGGGGATTTCGGGTTAAGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTAGATTACTTTATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTATGCCGGTGTGCTTGTTTTTATTGTCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTGCGCCATCTTATGATGGGGTTTGGCCAGCTTTATCTCAGTTGCCTGGGTTCTATGTTTggtt > 2:2085724/1‑235 (MQ=255) gggATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAgg < 2:535602/159‑1 (MQ=255) gATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTgg > 1:2117914/1‑206 (MQ=255) cACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGAc > 2:295982/1‑239 (MQ=255) cACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATACTTTGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACGGTTTGGTTACTTCGTGat > 2:941526/1‑238 (MQ=255) cGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGt > 1:1918982/1‑175 (MQ=255) cGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGt < 2:1918982/175‑1 (MQ=255) cGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACtt > 2:1038108/1‑231 (MQ=255) cGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACtt > 1:632397/1‑231 (MQ=255) tCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGc < 2:1498438/126‑1 (MQ=255) tGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGt < 2:761260/239‑1 (MQ=255) tCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTAt > 2:89524/1‑157 (MQ=255) tCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTAttt > 1:186304/1‑232 (MQ=255) ttACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGggc < 1:1290622/239‑1 (MQ=255) tACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGggcg > 1:1401554/1‑239 (MQ=255) tCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGggc < 2:1509876/230‑1 (MQ=255) cGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCAt < 1:809517/114‑1 (MQ=255) catgcatCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCAt < 1:1331000/112‑1 (MQ=255) catgcatCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCAt > 1:1309088/1‑112 (MQ=255) catgcatCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGAt > 1:318663/1‑178 (MQ=255) catgcatCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCg > 1:1714390/1‑239 (MQ=255) atgcatCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGt < 2:981751/145‑1 (MQ=255) gcatCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGtt < 1:1349227/238‑1 (MQ=255) tgccttgttcGCTTGTGCCGGTTTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGGTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGGTCGGCAAGCTTTATCTCAGTTGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGTAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGTCGGCCATTAATGCGTTCAAc < 2:1821895/229‑1 (MQ=255) tctctATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGc > 2:1330499/1‑92 (MQ=255) tctctATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCAt > 2:1706487/1‑104 (MQ=255) tctctATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCAt < 1:1706487/104‑1 (MQ=255) aTCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTa > 1:1393185/1‑126 (MQ=255) aTCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTa < 2:1393185/126‑1 (MQ=255) ctcGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCAt > 2:1883999/1‑97 (MQ=255) ctcGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTTAACATGGTTGAt > 1:493262/1‑239 (MQ=255) tcGCTTTTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGATg < 1:1888576/239‑1 (MQ=255) tcGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGATg < 2:1401554/239‑1 (MQ=255) cGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGc > 2:647739/1‑118 (MQ=255) cGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGc < 1:647739/118‑1 (MQ=255) cTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGc > 2:1288791/1‑130 (MQ=255) cTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCttt < 1:1568046/145‑1 (MQ=255) cTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGAt > 2:411113/1‑235 (MQ=255) cTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGAt < 1:411113/235‑1 (MQ=255) cTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGATGGCa > 1:2190374/1‑239 (MQ=255) cTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGATGGCa > 1:986089/1‑239 (MQ=255) ttGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCa > 1:802803/1‑91 (MQ=255) ttGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGcc < 1:337020/130‑1 (MQ=255) ttGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGcc > 2:337020/1‑130 (MQ=255) ttGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGATGGCa < 2:1714390/238‑1 (MQ=255) gtgtGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGcc < 2:808391/122‑1 (MQ=255) gtgCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTc < 2:831293/139‑1 (MQ=255) cTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGt > 1:437556/1‑82 (MQ=255) cTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGt < 2:437556/82‑1 (MQ=255) cgcgcTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGt > 2:2175245/1‑59 (MQ=255) cgcgcTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGc > 1:380310/1‑102 (MQ=255) cgcgcTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGc < 2:380310/102‑1 (MQ=255) cgcgcTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTtat > 1:1221699/1‑111 (MQ=255) cgcgcTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTtat < 2:1221699/111‑1 (MQ=255) gcTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGATGGCATTGATGGCTTGCTGGGCGGGTTGTCCTGCGt < 1:956565/239‑1 (MQ=255) aCCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGATGGCATTGATGGCTTGCTGGGCGGGTTGTCCTGCGTCTCGTTTg < 2:581735/239‑1 (MQ=255) cGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGcc > 2:211638/1‑90 (MQ=255) ttttGATATCAGCGAAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCCTTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGATGGCATTGATGGCTTGCTGGGCGGGTTGTCCTGCGTATCGTTTgcaca > 2:1610711/1‑237 (MQ=255) tttGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGATGGCATTGATGGCTTGCTGGGCGGGTTGTCCTGCGTCTCGTTTgcagca < 2:1639125/239‑1 (MQ=255) ttGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGc > 2:2253689/1‑71 (MQ=255) ttGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTa < 1:585107/135‑1 (MQ=255) ttGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGATGGCATTGATGGCTTGCTGGGCGGGTTGTCCTGCGTCTCGTTTGCAGCaa > 1:1626574/1‑239 (MQ=255) tGATGTCAGCGTAAGAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGATGGCATTGATGGCTTGCTGGGCGGGTTGTCCTGCGTCTCGTTTGCAGCAAt < 2:259982/239‑1 (MQ=255) tGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGATGGCATTGATGGCTTGCTGGGCGGGTTGTCCTGCGTCTCGTTTGCAGCAAt < 2:632397/239‑1 (MQ=255) aGCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGATGGCATTGATGGCTTGCTGGGCGGGTTGTCCTGCGTCTCGTTTGCAGCAATCGGTATg > 1:537469/1‑239 (MQ=255) gCGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGATGGCATTGATGGCTTGCTGGGCGGGTTGTCCTGCGTCTCGTTTGCAGCAATCGGTATGa > 2:684281/1‑239 (MQ=255) cGTAAAAATCCGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTCCGGCAAGCTTTATCTTAGTAGcc > 2:483484/1‑76 (MQ=255) cGTGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTG‑TGGCATTGATGGCTTGCTGGGCGGGTTGTCCTGCGTCTCGTTTGCAGCAATCGGTATGATTTTGTGGTTCg > 1:374950/1‑239 (MQ=255) tGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCg > 2:901123/1‑153 (MQ=255) tGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCg < 1:901123/153‑1 (MQ=255) tGCCACC‑TACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCCCa > 2:1296007/1‑58 (MQ=255) | GTAAGGTGGCAAAAAAAGTCGGTTTAGTGGATAAACCAAACTTCCGCAAACGTCACCAGGGATTGATACCTCTCGTTGGGGGGATTTCGGTTTACGCAGGGATTTGCTTCACGTTCGGAATTGTCGATTACTATATTCCGCATGCATCTCTCTATCTCGCTTGTGCCGGTGTGCTTGTTTTCATTGGCGCGCTGGATGACCGTTTTGATATCAGCGTAAAAATCCGTGCCACCATACAGGCCGCTGTTGGCATTGTTATGATGGTGTTCGGCAAGCTTTATCTCAGTAGCCTGGGTTATATCTTTGGCTCCTGGGAGATGGTGCTCGGACCGTTTGGTTACTTCCTGACGCTATTTGCCGTCTGGGCGGCCATTAATGCGTTCAACATGGTTGATGGCATTGATGGCTTGCTGGGCGGGTTGTCCTGCGTCTCGTTTGCAGCAATCGGTATGATTTTGTGGTTCG > NC_000913/3967989‑3968453 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |