| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 619,892 | G→A | A103V (GCG→GTG) | fepC ← | ferrienterobactin ABC transporter ATPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 619,892 | 0 | G | A | 97.5% | 256.8 / ‑4.2 | 79 | A103V (GCG→GTG) | fepC | ferrienterobactin ABC transporter ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base A (34/43); total (34/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.03e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGAGTTATTCCCGTGGCCTGCATTGCTTTCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCGCCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAACCTCTTTACTGGCGTAATGTTG > NC_000913/619796‑619986 | tGAGTTATTCCCGTGGCCTGCATTGCTTTCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCAcca > 1:1454659/1‑100 (MQ=255) gAGTTATTCCCGTGGCCTGCATTGCTTTCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGcaccac > 1:193379/1‑100 (MQ=255) gTTATTCCCGTGGCCTGCATTGCTTTCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCAccacca < 2:1993458/100‑1 (MQ=255) aTTCCCGTGGCCTGCATTGCTTTCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCt > 1:2217201/1‑100 (MQ=255) tCCCGTGGCCTGCATTGCTTTCGTTCCCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTcc < 2:1772525/100‑1 (MQ=255) cccGTGGCCTGCATTGCTTTCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCt > 2:1146634/1‑100 (MQ=255) cccGTGGCCTGCATTGCTTTCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCt > 2:2463846/1‑100 (MQ=255) cccGTGGCCTGCATTGCTTTCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCt > 1:2234316/1‑100 (MQ=255) cccGTGGCCTGCATTGCTTTCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGCTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCt > 2:1903000/1‑100 (MQ=255) ccGTGGCCTGCATTGCTTTCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTg < 2:1278353/100‑1 (MQ=255) ccGTGGCCTGCATTGCTTTCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTg > 1:15178/1‑100 (MQ=255) ccGTGGCCTGCATTGCTTTCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTg < 2:1773874/100‑1 (MQ=255) ccGTGGCCTGCATTGCTTTCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTg < 1:964862/100‑1 (MQ=255) cGTGGCCTGCATTGCTTTCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGc > 1:1895458/1‑100 (MQ=255) gTGGCCTGCATTGCTTTCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCa < 2:1554757/100‑1 (MQ=255) gCCTGCATTGCTTTCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACgg < 2:551624/100‑1 (MQ=255) ccTGCATTGCTTTCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGt < 1:1723557/100‑1 (MQ=255) cTGCATTGCTTTCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTg < 1:646532/100‑1 (MQ=255) cTGCATTGCTTTCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTg > 1:1654263/1‑100 (MQ=255) gCTTTCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGc > 2:1090026/1‑100 (MQ=255) tCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCgg < 2:2396675/100‑1 (MQ=255) tCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCgg > 1:2231995/1‑100 (MQ=255) tCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCgg < 1:2374047/100‑1 (MQ=255) tCGTTACCGCGTCTTCATCCTCTTGGCGCCGGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATAGCGCCCgg < 2:950092/100‑1 (MQ=255) gTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCg > 2:799280/1‑100 (MQ=255) ccGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGt < 2:1676321/100‑1 (MQ=255) ccGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGt < 1:1803395/100‑1 (MQ=255) ccGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGt > 2:1374261/1‑100 (MQ=255) ccGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGt > 2:1334716/1‑100 (MQ=255) ccGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGt > 1:1593496/1‑100 (MQ=255) cGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTa > 1:1621263/1‑100 (MQ=255) gCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAg < 1:2066403/100‑1 (MQ=255) tcttcATCATCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCAt > 1:614597/1‑100 (MQ=255) ttcATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCAttt > 1:2152983/1‑100 (MQ=255) aTCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTgc < 1:1303062/100‑1 (MQ=255) aTCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTgc < 2:2044316/100‑1 (MQ=255) aTCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACAGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTgc < 2:1805390/100‑1 (MQ=255) tCCTCTTTGCGCCAGTGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTgcg < 1:141300/100‑1 (MQ=255) tCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTgcg > 2:1369481/1‑100 (MQ=255) ccTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTgcgc > 1:1469604/1‑100 (MQ=255) tctTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCa < 2:1449245/100‑1 (MQ=255) tctTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCa > 1:987780/1‑100 (MQ=255) tttGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAAc < 2:1813962/100‑1 (MQ=255) tttGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAAc < 1:1353994/100‑1 (MQ=255) ttGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCGCCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACa < 1:2140226/100‑1 (MQ=255) tGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAg < 2:2136047/100‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGa > 1:989184/1‑100 (MQ=255) gcgcCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGa < 2:1434456/100‑1 (MQ=255) cgcCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGAc < 1:2635531/100‑1 (MQ=255) cgcCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGAc < 1:1084110/100‑1 (MQ=255) cgcCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGAc > 2:1531611/1‑100 (MQ=255) cgcCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGAc < 2:1612965/100‑1 (MQ=255) gcCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGAcc > 2:1778461/1‑100 (MQ=255) gcCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGAcc < 1:62895/100‑1 (MQ=255) tAATCAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCATCACAAGCTACTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCAGCg < 2:858170/100‑1 (MQ=255) aaCAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTg < 2:872961/100‑1 (MQ=255) cAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCa > 1:2081893/1‑100 (MQ=255) gCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAGCGGACCAATCCGGCGTGCAAc < 1:2256844/100‑1 (MQ=255) gCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAAc < 2:2206674/100‑1 (MQ=255) gCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAAc > 1:64988/1‑100 (MQ=255) gCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAAc < 1:2288648/100‑1 (MQ=255) cGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAAcc > 1:698322/1‑100 (MQ=255) gTTGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAACctc < 2:732807/100‑1 (MQ=255) ttGATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAACctct < 2:356617/100‑1 (MQ=255) gATGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAACCTCttt < 2:466117/100‑1 (MQ=255) ntGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAACCTCTGTa > 1:2113539/2‑100 (MQ=255) tGCGGATAACGTCCACGCGCCGCCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAACCTCTTTAc < 1:311282/100‑1 (MQ=255) tGCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGGAGCATCTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAACCTCTTTAc > 2:164691/1‑100 (MQ=255) gCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCCATCCGGCGTGCAACCTCTTTACt > 2:1669422/1‑100 (MQ=255) gCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAACCTCTTTACt < 2:1654904/100‑1 (MQ=255) gCGGATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAACCTCTTTACt < 1:2187772/100‑1 (MQ=255) ggATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAACCTCTTTACTgg < 2:1817429/100‑1 (MQ=255) ggATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAACCTCTTTACTgg > 1:355913/1‑100 (MQ=255) gATAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAACCTCTTTACTGGc < 1:2334771/100‑1 (MQ=255) aTAACGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAACCTCTTTACTGGCg < 1:2379519/100‑1 (MQ=255) aaCGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAACCTCTTTACTGGCGTa < 2:1216551/100‑1 (MQ=255) cGTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAACCTCTTTACTGGCGTAAt > 1:1923359/1‑100 (MQ=255) gTCCACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAACCTCTTTACTGGCGTAATg < 1:1927229/100‑1 (MQ=255) cACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAACCTCTTTACTGGCGTAATGTTg > 1:1809168/1‑100 (MQ=255) cACGCACCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAACCTCTTTACTGGCGTAATGTTg > 2:1727774/1‑100 (MQ=255) | TGAGTTATTCCCGTGGCCTGCATTGCTTTCGTTACCGCTTCTTCATCCTCTTTGCGCCAGCGGGTAAACAGCGGTTGATGCGGATAACGTCCACGCGCCACCAGCTCCTGCACGGTGATATCGCCCGGCGTGGTAGCATTTTGCGCCAACAGACCAATCCGGCGTGCAACCTCTTTACTGGCGTAATGTTG > NC_000913/619796‑619986 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |