| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,174,146 | C→T | V417V (GTG→GTA) | parE ← | DNA topoisomerase IV, subunit B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,174,146 | 0 | C | T | 98.4% | 422.1 / ‑2.5 | 126 | V417V (GTG→GTA) | parE | DNA topoisomerase IV, subunit B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base T (66/56); total (68/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.01e-01 | |||||||||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
CTTCCCAGGTGTTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCCACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTACGCACC > NC_000913/3174049‑3174239 | ttCCCAGGTGTTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGTGGAGTCACCTTCtaca < 2:2517318/100‑1 (MQ=255) tCCCAGGTGTTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACaa > 1:2565881/1‑100 (MQ=255) cccAGGTGTTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAg > 1:625580/1‑100 (MQ=255) cccAGGTGTTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAg < 1:1483567/100‑1 (MQ=255) ccAGGTGTTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAgg < 2:1065253/100‑1 (MQ=255) cAGGTGTTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGa < 2:62417/100‑1 (MQ=255) cAGGTGTTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGa < 2:1368619/100‑1 (MQ=255) gggtttAATGCTCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGCTCGCCCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACACGGAAc < 2:306625/96‑1 (MQ=255) ggTGTTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAAGAAc < 2:1766220/100‑1 (MQ=255) gtgtTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACACGGcaca > 2:1187788/1‑100 (MQ=255) gtgtTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACa > 2:914427/1‑100 (MQ=255) tgtTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAg > 1:158635/1‑100 (MQ=255) tAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTc > 1:1622699/1‑100 (MQ=255) aaGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCg > 2:29667/1‑100 (MQ=255) aaGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCg > 1:1834913/1‑100 (MQ=255) ggATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGt > 1:1289858/1‑100 (MQ=255) aTCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTAc < 1:1603631/100‑1 (MQ=255) cTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACgg > 1:844727/1‑100 (MQ=255) ttACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGt < 2:742318/100‑1 (MQ=255) tACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGtt > 2:160260/1‑100 (MQ=255) tACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATACGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGtt < 2:1706419/100‑1 (MQ=255) ccTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTaa > 1:2634500/1‑100 (MQ=255) ccTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTaa > 1:4201/1‑100 (MQ=255) ccTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTaa > 1:1195978/1‑100 (MQ=255) ccTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTaa > 1:2380200/1‑100 (MQ=255) tttCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAgg > 2:1944499/1‑100 (MQ=255) tttCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAgg > 1:207665/1‑100 (MQ=255) tttCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAgg < 2:2224075/100‑1 (MQ=255) tttCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCCCTCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGGACAGCTCGGTCCGGTTAAgg > 2:1649050/1‑100 (MQ=255) tCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTc < 2:754936/100‑1 (MQ=255) cAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTcc < 2:1174142/100‑1 (MQ=255) aGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCt < 1:693523/100‑1 (MQ=255) gTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTg > 2:2565006/1‑100 (MQ=255) ggCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGGCTGGGGAGTCACCTTCGACAAGGAACAGCTCGGTACGGCTAGGGTCCTgcg > 1:1727930/1‑100 (MQ=255) ggCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTgcg < 2:1686091/100‑1 (MQ=255) gCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTgcgc < 1:847079/100‑1 (MQ=255) gCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTgcgc > 1:656011/1‑100 (MQ=255) gCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTgcgc < 1:165348/100‑1 (MQ=255) cATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGcgcg > 1:1402766/1‑100 (MQ=255) aTGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCgg < 2:958135/100‑1 (MQ=255) aTGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCgg < 1:1540455/100‑1 (MQ=255) tGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGt < 1:1032673/100‑1 (MQ=255) tGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGt < 1:131725/100‑1 (MQ=255) tGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGt < 1:155880/100‑1 (MQ=255) tGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGt < 1:1791903/100‑1 (MQ=255) tGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGt < 1:1983921/100‑1 (MQ=255) tGATCGCCTGATATTCGCGACCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGt > 1:2060074/1‑100 (MQ=255) gATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACCAGGACCCGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTa > 1:373659/1‑100 (MQ=255) gATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTa < 2:1569447/100‑1 (MQ=255) aTCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTAc < 2:1676477/100‑1 (MQ=255) ccTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATc < 1:1484916/100‑1 (MQ=255) tGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAg < 1:2579436/100‑1 (MQ=255) tGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAg > 1:2154595/1‑100 (MQ=255) tGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAg > 1:442869/1‑100 (MQ=255) atatTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGcc < 1:933744/100‑1 (MQ=255) tatTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCa > 1:2261204/1‑100 (MQ=255) tatTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCa > 1:2323810/1‑100 (MQ=255) atTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAg > 2:2574803/1‑100 (MQ=255) atTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAg > 1:1489775/1‑100 (MQ=255) ttCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGt > 1:1047250/1‑100 (MQ=255) tCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGtt < 1:2268726/100‑1 (MQ=255) tCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGtt > 1:2231599/1‑100 (MQ=255) tCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGtt > 2:2582/1‑100 (MQ=255) cgATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGc > 2:1939813/1‑100 (MQ=255) cgATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGc > 1:776608/1‑100 (MQ=255) gATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGcc > 2:2430371/1‑100 (MQ=255) tCGCGTGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAg < 2:733445/100‑1 (MQ=255) cgcgcCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCa < 2:1754109/100‑1 (MQ=255) cTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGcc < 1:35170/100‑1 (MQ=255) cTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCggg > 1:790109/1‑100 (MQ=255) cTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCggg < 2:1040481/100‑1 (MQ=255) tGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGcc < 2:1885365/100‑1 (MQ=255) tGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGcc < 1:849355/100‑1 (MQ=255) ggCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCg > 1:1734416/1‑100 (MQ=255) gCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGc > 2:1863488/1‑100 (MQ=255) cAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCt < 1:1770463/100‑1 (MQ=255) cAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCt > 2:1359066/1‑100 (MQ=255) gATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTgg < 1:547757/100‑1 (MQ=255) gATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTgg > 2:517763/1‑100 (MQ=255) gATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTgg > 2:1594361/1‑100 (MQ=255) gATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTgg < 1:108102/100‑1 (MQ=255) tCCGCCTGCGGAGTCACCTTCAACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGTTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCACCGCCGGGCCGCTGGTc < 2:1216006/100‑1 (MQ=255) cGCCTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAg > 2:378238/1‑100 (MQ=255) cTGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCtt > 1:1859030/1‑100 (MQ=255) tGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCttt > 1:948083/1‑100 (MQ=255) tGCGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCttt > 1:284135/1‑100 (MQ=255) cGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCCGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCttttt > 2:1746982/1‑100 (MQ=255) cGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCttttt < 1:1724834/100‑1 (MQ=255) cGGAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCttttt < 1:157874/100‑1 (MQ=255) cGGAGTCACCTTCCACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCttttt < 2:1398719/100‑1 (MQ=255) gAGTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTAc < 1:2488906/100‑1 (MQ=255) gTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTACGc > 1:2453996/1‑100 (MQ=255) gTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTACGc < 2:2266972/100‑1 (MQ=255) gTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTACGc < 1:336844/100‑1 (MQ=255) gTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTACGc > 1:845975/1‑100 (MQ=255) gTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTACGc < 1:162651/100‑1 (MQ=255) gTCACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGATACAATCAGCCAGTTAGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTACGc > 2:578299/1‑100 (MQ=255) cACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTACGcac < 1:584761/100‑1 (MQ=255) cACCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTACGcac > 2:908312/1‑100 (MQ=255) aCCTTCTACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTACGcacc > 2:302997/1‑100 (MQ=255) | CTTCCCAGGTGTTAAGGATCTTACCTTTCAGTGGCATGATCGCCTGATATTCGCGATCGCGCGCCTGCTTGGCAGATCCGCCTGCGGAGTCACCTTCCACAAGGAACAGCTCGGTACGGTTAAGGTCCTGCGCGGTACAATCAGCCAGTTTGCCAGGCAACGCCGGGCCGCTGGTCAGCTTTTTACGCACC > NC_000913/3174049‑3174239 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |