Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,293,036 | IS2 (+) +5 bp | intergenic (‑114/‑487) | hns ← / → tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1293036 = | 0 (0.000) | 152 (0.760) | 80/198 | 1.9 | 100% | intergenic (‑114/‑491) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region | |||||
* | ? | NC_000913 | = 1293040 | 0 (0.000) | 166 (0.830) | 92/198 | 1.0 | 100% | intergenic (‑118/‑487) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
TATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1292942‑1293040 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGA < NC_000913/1469240‑1469142 ATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGTCTTAAAGTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTA < 2:4414109/100‑1 GGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCC > 1:3776207/1‑100 GGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAGTTTGTGCCGCTAGACTGGCC < 1:4023200/100‑1 GTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCC < 1:4039050/100‑1 GTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCC > 2:111845/1‑100 TTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCC < 1:4160785/100‑1 GTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTG > 1:4350645/1‑100 GTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTG < 1:3234458/100‑1 TGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAA > 1:2097572/1‑100 TGAGGTAATAATAGAGCCTTAAAGTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTGTTTTGGGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAA < 2:3819866/100‑1 AGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATC > 1:5041448/1‑100 GGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCT > 1:2499050/1‑100 TAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCC < 2:4624601/100‑1 AATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCn < 2:4295230/100‑2 TAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGA < 1:2581711/100‑1 ATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACA > 2:1274561/1‑100 ATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAAAGTAAGGAATTCAAAATTATTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACA > 2:4764365/1‑100 AGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAAC < 2:2622177/100‑1 GAGCCTTAGATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACC < 2:2533996/100‑1 GCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAA > 1:3720174/1‑100 GCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAA > 1:3874282/1‑100 CCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAAT > 2:3292479/1‑100 CTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATA < 1:3957159/100‑1 CTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATA > 1:2723184/1‑100 TTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATAT > 2:2334345/1‑100 TTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCACCCTGAATCTCCAGACAACCAATAT > 2:3336636/1‑100 TTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCAGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATAT > 2:1239153/1‑100 ATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACT < 1:4406119/100‑1 ATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACT < 1:1971635/100‑1 TTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTT < 2:2005699/100‑1 TCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTA < 2:1885331/100‑1 CAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAA > 1:1061311/1‑100 GTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAAT < 2:514728/100‑1 GTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAAT < 2:2692437/100‑1 GTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAAT > 2:4208065/1‑100 GTTGTGCAAAAGCCAGGAATGTAAGGACTTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCAGAATCTCAAGACAACCAATATCACTTAAAT > 2:3509216/1‑100 TTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATACCACTTAAATA < 1:3532641/100‑1 TGCAATAGCCAGGAATGTAATGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTTGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGT < 1:1276582/100‑1 TGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGT > 1:3246543/1‑100 TGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGT > 1:3330050/1‑100 TGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGT < 1:2124607/100‑1 GCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTATTTAAGTGATAttg < 1:2899037/100‑4 GCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTC > 1:1529532/1‑100 CCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCT > 2:2435056/1‑100 CAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTT < 1:1295109/100‑1 CAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTT < 2:3062126/100‑1 CAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTT > 2:1806182/1‑100 AGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTA < 1:2904697/100‑1 AGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTA < 2:1507768/100‑1 GGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAA < 2:4103475/100‑1 GGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAA < 2:2683725/100‑1 GGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAA > 1:776651/1‑100 GGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAA > 1:848530/1‑100 GAATGTAAGGCATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTATACTGGCCCCCTGCATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAAT < 2:4875188/100‑1 GAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAAT < 1:302530/100‑1 AATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATA < 2:680168/100‑1 ATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATAC < 2:858986/100‑1 TGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGACACTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACT < 2:1283316/100‑1 GTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTA > 1:2419324/1‑100 TAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAG > 1:3912552/1‑100 TAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAG < 1:1829882/100‑1 TAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAACCTCCAGACAACCAATATCACTCAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAG < 1:4609454/100‑1 TAAGGAATTCAAAAGTGTTCTTTATGTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAG < 2:1331219/100‑1 AAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGT > 2:5044581/1‑100 AAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGT > 2:2184066/1‑100 AGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTT > 1:243274/1‑100 GGAACTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTT > 1:681344/1‑100 AATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTT < 2:4611431/100‑1 AATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTT < 2:1080724/100‑1 ATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTA > 1:93240/1‑100 ATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTA > 1:287828/1‑100 ATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTA < 2:1217875/100‑1 ATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTA > 1:605510/1‑100 TTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAG < 2:2882872/100‑1 TTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAG < 2:1585401/100‑1 TTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAG > 1:1453917/1‑100 CAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGAC > 2:4549939/1‑100 CAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGAC < 1:4280584/100‑1 AAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACT < 2:2653737/100‑1 AAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACT < 2:3537617/100‑1 AAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTCAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTGAATACTAGTTTTTAGACTA > 1:4578865/1‑100 AATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAG < 1:3064478/100‑1 GTTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCAT > 1:1489067/1‑100 TTCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATT < 1:2594115/100‑1 TCTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCTTTG > 2:1668146/1‑100 CTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGG < 1:4865093/100‑1 CTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGG > 2:1718494/1‑100 CTTTATTTTGTGCCGCTAGACTGGCACCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACGTAAAGAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGG < 2:4367398/100‑1 TATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGA > 1:2204610/1‑100 TATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGAGAGTCTTAATAATAGATTTTAGACTAGTCATTGGAGA > 2:4816091/1‑100 ATTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAA > 1:3104580/1‑100 TTTTGTGCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAAC < 1:4779712/100‑1 aCCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGA > 1:2022939/2‑100 CCGCTCGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGAT > 2:1624635/1‑100 CCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGAT < 2:2941282/100‑1 CCGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGAT < 2:2458583/100‑1 CGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATT > 1:1682758/1‑100 GCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAGTACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTG > 1:1087096/1‑100 CTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGA > 2:3774799/1‑100 CTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGA > 2:2387097/1‑100 TATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1292942‑1293040 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGA < NC_000913/1469240‑1469142 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |