| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2304648 | 76 (0.380) | 50 (0.250) | 24/194 | 12.7 | 21.2% | noncoding (232/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 2305013 | 297 (1.510) | noncoding (597/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
TCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2304548‑2304648‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCAACCTACGGGGTGGAGCACTTCACAGCGGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCAACCGGC < NC_000913/2305013‑2304916 TCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGG < 2:674759/100‑1TCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGG < 2:647651/100‑1TCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGG < 1:5141614/100‑1 ACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTT < 2:3912737/100‑1 ACGCCGCATCCCACATCGATCGCCCCAGTCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTT < 2:973395/100‑1 GCCGCGTCCGACATCTAACGCCCGGGCCGGTTGCATGATGGGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGG < 2:3579238/100‑1 GCCGCATCCGACATCGAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGG < 2:2520955/100‑1 GCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCCCTCCCCCGCTGCGGAGTACCCCACCGCGTAGGgcgg > 2:2558773/1‑96 GCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCATGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGG < 2:3578936/100‑1 CGCATCCGACATCCAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGAT < 2:3604925/100‑1 CGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATGCGGCG > 1:1471372/1‑100 CATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAA > 1:2539141/1‑100 CGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAACCGCCTT > 2:708030/1‑100 GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTA < 2:2509951/100‑1 ccaAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATC < 1:3519263/97‑1 ccaAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGTAACCGCCTTATC < 1:1013607/97‑1 CCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATGCGGCGTAACCGCCTTATC < 2:2450878/100‑1 caAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCC < 2:66066/98‑1 caAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCC < 1:3882391/98‑1 CGAGCCGTTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCC < 2:927860/100‑1 CGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTATGTCGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCC < 2:2882622/100‑1 CGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCC < 2:935003/100‑1 CGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCC < 2:1449962/100‑1 CGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCC < 2:40796/100‑1 AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCAA < 1:719082/100‑1 AGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCga < 1:3413711/100‑3 AGCCGGTTGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCAA < 2:2688767/100‑1 GCCGTTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTCAAGTGCTCCCCCCCGTATGTTGCATGCGTCGTAACCACCTTATCCAAC < 2:103053/100‑1 GCCGGTTGCCTGCTGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCGAC < 2:1828582/100‑1 GCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCAAC < 1:3167801/100‑1 GCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCAAC < 1:2872721/100‑1 CCGGTTGCCTGATGGGTCGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCGACC < 2:2601076/100‑1 CCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCGACC < 2:2892773/100‑1 CCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTACCCGCCTTATCCAACC < 1:1012449/100‑1 CCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCAACC < 1:1267031/100‑1 CCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCAACC < 1:4008866/100‑1 CGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCAACCT < 1:3404635/100‑1 CGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCGACCT < 2:706343/100‑1 GTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCGACCTAC < 1:2770906/100‑1 GTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCAACCTAC < 2:3931056/100‑1 GTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCAACCTAC < 2:3319131/100‑1 GCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCAACCTACGGG < 2:22335/100‑1 CCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCAACCTACGGGG < 1:3589325/100‑1 CCTGATGCGACGCTGGCGCGTCGTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCAACCTACGGGG < 2:3530878/100‑1 TGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCAACCTACGGGGTG > 1:957280/1‑100 TGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCGACCTACGGGGTG < 1:1167615/100‑1 ATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCAACCTACGGGGTGGA < 1:4074866/100‑1 GCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTATGTCGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCGACCTACGGGGTGGAGC < 1:1551238/100‑1 GCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCGACCTACGGGGTGGAGC < 1:3415330/100‑1 CGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCAACCTACGGGGTGGAGCACTTCACAGCGG < 1:4847283/100‑1 CAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCAACCTACGGGGTGGAGCACTTCACAGCGGTGTAGGCC < 2:942095/100‑1 GGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCAACCTACGGGGTGGAGCACTTCACAGCGGTGTAGGCCTG > 1:3448624/1‑100 CTAGACCGCGGTGAAGTGCGCCACCCCGTAGGTGGGATGCGGCGTAACCTCCTTATCCGACCTACGGGGTGGAGCACTTCACAGCGGTGTAGGCCCGATA < 2:5006066/100‑1 CTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCAACCTACGGGGTGGAGCACTTCACAGCGGTGTAGGCCTGATAAGACGCGC < 1:2187769/100‑1 GTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCAACCTACGGGGTGGAGCACTTCACAGCGGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCAACCGGC > 1:5113628/1‑100 GTTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCAACCTACGGGGTGGAGCACTTCACAGCGGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCAACCGGC < 2:128577/100‑1 TCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2304548‑2304648‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtTGGATGCGGCGTAACCGCCTTATCCAACCTACGGGGTGGAGCACTTCACAGCGGTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCAACCGGC < NC_000913/2305013‑2304916 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |