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                        ggTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGCCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCACCTATCCTACACAt   >  2:646712/1‑100 (MQ=18)
                         gTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCACCTATCCTACACATc  <  1:3455714/100‑1 (MQ=34)
                         |                                                                                                   
ACACTGTCCGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCACCTATCCTACACATC  >  NC_000913/3424553‑3424677

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑