Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,304,838 | A→G | intergenic (+445/+270) | eco → / ← mqo | ecotin, a serine protease inhibitor/malate dehydrogenase, FAD/NAD(P)‑binding domain |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,304,838 | 0 | A | G | 98.1% | 426.4 / ‑4.8 | 159 | intergenic (+445/+270) | eco/mqo | ecotin, a serine protease inhibitor/malate dehydrogenase, FAD/NAD(P)‑binding domain |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (3/0); new base G (77/77); total (81/78) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.45e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
GAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCAT > NC_000913/2304741‑2304897 | gAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCggg > 1:1020172/1‑100 (MQ=255) aaGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCTGTTACGCAGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGc < 2:3293126/100‑1 (MQ=255) ggggCTCCCCCCCGAAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGcc < 2:4530645/97‑1 (MQ=14) aGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGcc > 1:2800690/1‑100 (MQ=255) aGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGcc < 2:656797/100‑1 (MQ=255) aGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGcc < 1:5133953/100‑1 (MQ=255) aGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGcc > 2:4770420/1‑100 (MQ=255) aGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGcc < 2:2895933/100‑1 (MQ=255) gTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCt < 2:2931437/100‑1 (MQ=255) ncTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTac > 1:88462/2‑100 (MQ=255) gCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCGACGGCAAAAGCGGCTGGCTGAGGCAACGCGGGCGCGCCTGATCAGGccggc > 2:4118825/1‑97 (MQ=2) gCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTac > 1:1010408/1‑100 (MQ=255) gCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTac < 1:3811621/100‑1 (MQ=255) cTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTaca > 2:4596390/1‑100 (MQ=255) cTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTaca > 2:765635/1‑100 (MQ=255) cTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGCCCTaca > 2:4945609/1‑100 (MQ=255) tCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTacac > 2:3132400/1‑100 (MQ=255) tCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTacac > 1:5125290/1‑100 (MQ=255) ccACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTacacn < 1:4104610/100‑2 (MQ=255) ccACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACAcc > 2:25043/1‑100 (MQ=255) cACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCg < 1:558404/100‑1 (MQ=255) cACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCg > 2:2852832/1‑100 (MQ=255) cACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCg > 1:311714/1‑100 (MQ=255) ccccGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACCCCGCt > 2:2263738/1‑100 (MQ=255) ccccGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCt > 2:2811870/1‑100 (MQ=255) ccccGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCt > 1:3331291/1‑100 (MQ=255) cccGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCtg < 1:2601821/100‑1 (MQ=255) cccGCAGGTTGGACAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCtg < 2:4260204/100‑1 (MQ=14) cGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCtgtg < 1:1728040/100‑1 (MQ=255) cGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCtgtg < 1:4369213/100‑1 (MQ=255) gTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGa < 1:316217/100‑1 (MQ=255) tAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGaa > 1:3264132/1‑100 (MQ=255) aGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAg < 1:2649734/100‑1 (MQ=255) aGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAg < 2:2564104/100‑1 (MQ=255) aGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAg < 1:694081/100‑1 (MQ=255) aGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAg < 1:2013076/100‑1 (MQ=255) ggTTGGATAAGGCGGTTACGTCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGt > 2:5066302/1‑100 (MQ=255) ttGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGc < 2:3949319/100‑1 (MQ=255) tGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTAGACCGCTGTGGAGTGcc > 2:371755/1‑99 (MQ=14) tGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCt < 1:2190806/100‑1 (MQ=255) ngATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGGAGttccc > 1:4122422/2‑96 (MQ=14) ggATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCCCTGTGAAGGGCtg > 2:2726381/1‑99 (MQ=14) aTAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCa < 1:3951495/100‑1 (MQ=255) tAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTCCCCCGCTGTGAAGTGCCCCAc > 2:3154505/1‑100 (MQ=14) tAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAc < 2:2002988/100‑1 (MQ=255) aaGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAcc > 1:4180357/1‑100 (MQ=255) aGGCGGTTACGCCGCTTTCGATAACCCACGGCCGAGCGGGTTGCCTGAGGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc < 2:106991/100‑1 (MQ=11) aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc > 1:1290774/1‑100 (MQ=255) aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc > 2:74530/1‑100 (MQ=255) aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc < 2:2870351/100‑1 (MQ=255) aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc < 1:21903/100‑1 (MQ=255) aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCCCCAccc > 2:3416235/1‑100 (MQ=255) ggCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAcccc > 1:1918347/1‑100 (MQ=255) ggCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAcccc < 2:1284031/100‑1 (MQ=255) ggCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAcccc > 1:705127/1‑100 (MQ=255) ggCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAcccc > 1:253915/1‑100 (MQ=255) cGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTCCACCGCTGTGACGTGCCCCACCCCGt > 2:3257163/1‑100 (MQ=11) cGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGt > 2:1896255/1‑100 (MQ=37) cGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGt < 1:1962054/100‑1 (MQ=255) cGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGt > 2:2101967/1‑100 (MQ=255) cGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGt < 1:1037164/100‑1 (MQ=255) ggTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTa < 2:109629/100‑1 (MQ=255) ggTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTCGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCCGTGAAGTGCTCCACCCCGtc > 2:3649294/1‑99 (MQ=11) ttACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAgg < 1:4983675/100‑1 (MQ=25) cgccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCg < 2:4657475/100‑1 (MQ=21) cgccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGACGTGCTCCACCCCGTAGGTCg > 2:2341147/1‑100 (MQ=18) cgccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTCATCGGGCCTCCACCGCTGCGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCg > 1:1906934/1‑100 (MQ=11) cgccgcATCCGACAGCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGATGCTCGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCCCTGTGAAGTGCTCCCCCCCGTAGGTCg > 1:4524635/1‑100 (MQ=11) gccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCgg > 2:3775732/1‑100 (MQ=21) ccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGa > 1:2079158/1‑100 (MQ=21) ccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGa > 1:2458707/1‑100 (MQ=21) ccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGa < 1:3506340/100‑1 (MQ=18) gcATCCAACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAACGTGCCTACGCCGCTGTGAAGTGCTCCATCCCGTAGGTCGCATa > 2:4842680/1‑100 (MQ=11) aTCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAg < 1:5055766/100‑1 (MQ=18) ccGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc > 1:4774099/1‑100 (MQ=18) ccGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc < 1:469541/100‑1 (MQ=18) ccGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc < 1:4649770/100‑1 (MQ=21) gACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCGTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg < 1:2849676/100‑1 (MQ=255) gACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGTAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg < 1:4141249/100‑1 (MQ=255) gACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg < 1:3517036/100‑1 (MQ=18) gACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg < 1:2626350/100‑1 (MQ=18) cATCCAGCGTCCGAGCCGATTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt > 1:4299734/1‑100 (MQ=11) aTCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTa > 1:1526189/1‑100 (MQ=21) tCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAc < 1:1725533/100‑1 (MQ=18) tCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAc > 1:2829732/1‑100 (MQ=21) tCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGGTAc > 2:2213315/1‑100 (MQ=255) tCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTACTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAc > 2:2391094/1‑100 (MQ=255) tCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCCCTGTGAAGTACACCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAc > 1:1794656/1‑100 (MQ=11) tCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGAAGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTATGTCGGATAAGGCGGTTAc > 1:2352350/1‑100 (MQ=255) ccAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGACGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGACGGTTAcg > 2:2618608/1‑100 (MQ=255) ccAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcg > 1:309526/1‑100 (MQ=18) cAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgc > 2:3608810/1‑100 (MQ=18) cAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgc > 2:991048/1‑100 (MQ=21) aaCGTCCGTGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgcc < 2:1557725/100‑1 (MQ=16) aaCGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgcc < 2:5083732/100‑1 (MQ=16) aaCGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgcc < 1:4352557/100‑1 (MQ=18) aCGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccg < 2:1578983/100‑1 (MQ=18) aCGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccg < 1:4058782/100‑1 (MQ=18) cGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccgc > 2:3313992/1‑100 (MQ=18) tCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCAt < 1:4196971/100‑1 (MQ=14) | GAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCAT > NC_000913/2304741‑2304897 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |