| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 275149 | NA (NA) | 47 (0.330) | 35/198 | 7.0 | 25.8% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 678279 = | 135 (0.940) | coding (865/1428 nt) | djlB | putative HscC co‑chaperone, uncharacterized J domain‑containing protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/275054‑275149‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATTACTGGTGATGATGATTGAAGCGCGTGATCTGGTTAACGATCAGGG > NC_000913/678279‑678370 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGCTCTCATATCAGGGACTTGTTCCCACCTTCCTTAA > 2:2879484/1‑100TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAA < 1:1100324/100‑1TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAA < 1:3092522/100‑1TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAA < 2:28893/100‑1 GTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAT < 2:2985312/100‑1 GTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAT > 1:1617569/1‑100 GTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAT > 1:2988421/1‑100 GTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACAGGATCTCATATCACGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAT > 2:3232747/1‑100 GTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACGCGTGATGAACCCGGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAT < 2:3369652/100‑1 TCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATG < 2:624951/100‑1 GGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTT > 1:2956353/1‑100 GCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTG < 1:3375507/100‑1 AGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGAATTGTTCGCACGTTCCTTAATGTTGAAAT > 2:2870311/1‑100 TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGT > 2:938161/1‑100 TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGT > 2:1362963/1‑100 TTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCG < 1:2543240/100‑1 CTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCAT > 1:2704224/1‑100 CTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCAT > 1:568926/1‑100 TGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGG > 1:806191/1‑100 ATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTC < 2:954751/100‑1 TGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCG < 1:1276261/100‑1 GAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCAGCGGGTCGA > 1:2995125/1‑100 CTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGCTTATT < 2:1032666/100‑1 TCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCC > 2:12510/1‑100 TATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCAT > 1:1214741/1‑100 ATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATT > 1:545142/1‑100 TCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATTACTGG < 2:1573115/100‑1 CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATTACTGGT < 1:1857974/100‑1 CAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATTACTGGTG < 2:2278291/100‑1 AGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATTACTGGTGA < 1:2335312/100‑1 GACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATTACTGGTGATGAT < 1:2819561/100‑1 ACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATTACTGGTGATGATG > 1:3469342/1‑100 CAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATTACTGGTGATGATGA > 1:2074935/1‑100 CAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATTACTGGTGATGATGA > 1:1879327/1‑100 AAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATTACTGGTGATGATGAT < 1:3599143/100‑1 CATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATTACTGGTGATGATGATTGA < 1:2912539/100‑1 CATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGCCGATTATTACCCATTACTGGTGATGCTGATTGA > 2:1775930/1‑100 ATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATTACTGGCGATGATGATTGAAGCG > 1:3295492/1‑100 CTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATTACTGGTGATGATGATTGAAGCGCG > 2:3156009/1‑100 TCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATTACTGGTGATGATGATTGAAGCGCGT < 1:5654/100‑1 ATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATTACTGGTGATGATGATTGAAGCGCGTGA < 1:1385402/100‑1 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATTACTGGTGATGATGATTGAAGCGCGTGATC < 2:2298834/100‑1 ACTTGTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATTACTGGTGATGATGATTGAAGCGCGTGATCTGGTTAA < 2:2667953/100‑1 GTTCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATTACTGGTGATGATGATTGAAGCGCGTGATCTGGTTAACGAT > 2:2834688/1‑100 TCGCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATTACTGGTGATGATGATTGAAGCGCGTGATCTGGTTAACGATCA > 2:992957/1‑100 GCACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATTACTGGTGATGATGATTGAAGCGCGTGATCTGGTTAACGATCAGG < 2:2242805/100‑1 CACCTTCCTTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATTACTGGTGATGATGATTGAAGCGCGTGATCTGGTTAACGATCAGGc > 1:2952275/1‑99 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/275054‑275149‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAATGTTGCAATGGTGCCGTCAGCATCGGGTCGATTATTACCCATTACTGGTGATGATGATTGAAGCGCGTGATCTGGTTAACGATCAGGG > NC_000913/678279‑678370 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |