New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4502104 | 192 (1.230) | 4 (0.030) | 4/542 | 15.0 | 2.2% | noncoding (1412/1426 nt) | IS4 | repeat region |
? | NC_000913 | = 4502108 | 179 (1.190) | noncoding (1408/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CAGAGTGCAATCGTTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4501807‑4502104 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccagtcagttGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACAGTGTATATG < NC_000913/4502108‑4501822 CAGAGTGCAATCGTTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATG < 2:489513/288‑1 aatTGCAATCTTTCATATACACTTTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCA < 2:999324/286‑1 GAGTGCAATCGTTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCA < 2:477954/289‑1 AGTGCAATCGTTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAG > 1:179351/1‑289 AGTGCAATCGTTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAG < 2:705162/289‑1 AGTGCAATCGTTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAG > 1:181988/1‑289 TGCAATCGTTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTC < 2:858656/289‑1 TGCAATCGTTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTC < 1:829393/289‑1 TGCAATCGTTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTC < 1:90580/289‑1 GCAATCGTTCAATTACACTGTCGGTGATGCACTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCGTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGAGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTC < 2:1222813/288‑1 CAATCGTTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCACATTGGTTCTGTAATGACAGGCAG > 2:148329/1‑289 ATCGTTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTT < 2:393758/289‑1 TCGTTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTT > 1:725202/1‑288 TTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTTCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCATGCGGGCATGATAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTTGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGATGAAACGATATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGACAGTgggttaag > 2:152490/1‑280 GTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACTAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGTGAATACTGATCTTTTTTGTCCCCAAGACTGAACGTCAACGCCACAATCTTTGACTTTTTGACATTGTAATtac > 1:85697/1‑286 GGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACAAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGAAGGCCAGCGGAACTAAAGACATTAAATTGCTTTCATCAGCCAGTTGCGTATTTGGTTACGTCCC > 2:725202/1‑289 TCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTA > 1:713239/1‑255 TCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTA < 2:713239/255‑1 gaaCCAGTCAGTTGCTTAGCTCACTGGCATGACATAACCAGGATGCCTATGTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCAGGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGA < 2:1132962/286‑1 gcgaggCAGTTGCTTAACTGACTGGAATTACAGAGCCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACA < 2:1120764/283‑1 GCCAGTCAGTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGGGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACA < 2:405549/289‑1 GCCAGTCAGTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACA < 2:312101/289‑1 GCCAGTCAGTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACA < 1:32823/289‑1 GCCAGTCAGTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACA < 1:251324/289‑1 GCCAGTCAGTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACA < 1:727012/289‑1 GCCAGTCAGTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACA < 1:1236945/289‑1 GCCAGTCAGTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGATTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACA < 2:89116/289‑1 CAGTCAGTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAACATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACAGT < 2:619914/289‑1 GTCAGTTGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACAGTG > 2:138343/1‑288 TGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACAGTGTATATG < 1:751589/288‑1 CAGAGTGCAATCGTTCATATACACTGTCGGTGATGCGCTAAAAAATGCGTTAATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4501807‑4502104 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccagtcagttGCTTAACTGACTGGCATTACAGAACCAAGATGCCTATTTCGTTTCAGCATCAACTGTTAAATTATCTGGTTGCCAACGAGAATACTGAGCTTTTTTGTCCCCAAGACTGACCGTCAACGCCACAATCTTTGACTGTTTGACATTGTCATGCCCGCAGGCCAGCGGATCTAAAGACATTAGACTGCTTGCATCAGCCAGTTGCGTATCTGGCTATGTCCCTTAATTGGTAAGGGTTCGAGGAACTCAACATTAACGCATTTTTTAGCGCATCACCGACAGTGTATATG < NC_000913/4502108‑4501822 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |