| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 3,875,532 | 0 | A | T | 20.0% | 247.0 / 23.7 | 106 | H32L (CAT→CTT) | yidX | putative lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (46/38); new base T (20/1); total (66/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.21e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
GTTCGCGTTTGCCGTGCGTGTAATGTAGTACAAACTTATATTGTTGTACTACAATTTAGATCACAAAAAGAACAATGCATAAAAAAATGACATGCGTCGGGCAGAAATCTGAAAAGGGATATCAGGCGCTAAACAGGAGGGAAAGAAGAGTATGCTTTCAACGGCTTAGCTACTCGTTTAAAGGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAAGGGATTTTTTAAGGCTGCCGGTTTATTCCCACTGGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATACCGCAAAGGGTAGTTCAGGAAAGTATCAATCGCAGTCAGACACCATCACTGGGCTATCGCAGGCAAAAGATAGTAATGGAACAAAAGGCTATGTTTTTGTAGGGGAATCGCTGGATTACCTTATCACTGATGGTGCCGATGACATCGTTAAGATGCTCAATGATCCAGCACTTAACCGGCACAATATTCAGGTTGCCGATGACGCAAGATTTGTTTTAAATGCGGGGAAAAAGAAATTTACCGGCACAATATCGCTTTACTACTACTGGAATAACGAAGAA > NC_000913/3875247‑3875815 | ctttgcgTTTGCCTTGAGTGTAATGTAAGCAAAACTTATATTGTTTTAATATAATTTAAATAAAAAAAAAAACATGGTATAGAAAAATAACATGCGGCGGGAAAAAAACTGAAAGAGAATATAAGGCGATAAACAAGAGGTAAAGAAGATAATGCTTTCAACGGCTTAGCTAGTCGTTTAAAAGATTAATCATGAAGTTGAATTTTAATGGATTTTTTAAGGCTGCCAGTTTATTTCAACTAGCGCTGATGCTTTCAGGCTGTATCTCGTATGCTCTGGTTTCCCATa < 2:561512/284‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |