Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 3,697,854 | A→C | 5.5% | Q466P (CAA→CCA) | bcsE → | cellulose production protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,697,854 | 0 | A | C | 5.5% | 539.5 / 16.9 | 158 | Q466P (CAA→CCA) | bcsE | cellulose production protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (72/76); new base C (8/2); total (80/78) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.85e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
TGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGCGTTGAATCATATTTTCCCATTGCCTACTGGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGCTTGCCCCAGAACAATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAATGCCGAGCACGATGGTCGCCACTGGCGACGAATACCAGAACCCATGCGACTGTTAGATGATGCTGTGGAGCGCTCATCATGATGACCATCAGCGATATCATTGAAATTATTGTCGTTTGCGCACTGATATTTTTCCCGCTGGGCTATCTGGCGCGGCACTCTTTGCGACGCATTCGCGACACCTTACGTTT > NC_000913/3697569‑3698138 | tgtTCTTTAATGCCGTCAACAACCTGGTGAATAACCCTCAATTACCGGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCAGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGCGTTGAATCATATTTTCCCATTGCCTACTGGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAAt < 2:607940/289‑1 (MQ=255) 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |