New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 729682 | 101 (0.520) | 10 (0.050) | 5/324 | 10.9 | 10.0% | coding (100/4194 nt) | rhsC | Rhs protein with putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
? | NC_000913 | = 729841 | 86 (0.470) | coding (259/4194 nt) | rhsC | Rhs protein with putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
ATATATTCATGAAATATATATAAATATTTTCCTAATTGTTCTTATCTGACAGATATCTCACTTAAGGCTTTCTTATAAATCTGTAGGGTTTCGCCTGTCAGCAGACAAATAACCCGATAAAACAAGGATGAGCAGATGAGCGGAAAACCGGCGGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTG‑TCCAGGGTTCAGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGG‑CCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGGGTGAC‑GTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCG‑GTG‑CAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATAC > NC_000913/729448‑729919 | atatatTCATGAAATATATATAAATATTTTCCTAATTGTTCTTATCTGACAGATATCTCACTTAAGGCTTTCTTATAAATCTGTAGGGTTTCGCCTGTCAGCAGACAAATAACCCGATAAAACAAGGATGAGCAGATGAGCGGAAAACCGGCGGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTG‑TCCAGGGTTCAGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGG‑c < 2:749137/239‑1 (MQ=255) ttCATGAAATATATATAAATATTTTCCTAATTGTTCTTATCTGACAGATATCTCACTTAAGGCTTTCTTATAAATCTGTAGGGTTTCGCCTGTCAGCAGACAAATAACCCGATAAAACAAGGATGAGCAGATGAGCGGAAAACCGGCGGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTG‑TCCAGGGTTCAGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGG‑CCTGtt < 1:1136067/239‑1 (MQ=255) aTGAAATATATATAAATATTTTCCTAATTGTTCTTATCTGACAGATATCTCACTTAAGGCTTTCTTATAAATCTGTAGGGTTTCGCCTGTCAGCAGACAAATAACCCGATAAAACAAGGATGAGCAGATGAGCGGAAAACCGGCGGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTG‑TCCAGGGTTCAGCCGGGGTACGCATCGGGGCCCCCACCGGCGTGG‑CCTGTTCgg > 1:2605039/1‑239 (MQ=255) gAAATATATATAAATATTTTCCTAATTGTTCTTATCTGACAGATATCTCACTTAAGGCTTTCTTATAAATCTGTAGGGTTTCGCCTGTCAGCAGACAAATAACCCGATAAAACAAGGATGAGCAGATGAGCGGAAAACCGGCGGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGGATTG‑TCCAGGGGTCAGCCGGGGTACGCATCGGGGCCCCCCCCCGCGGGG‑CCCTTTCGgtg > 1:693899/1‑239 (MQ=17) 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1:1072316/1‑236 (MQ=38) ggTTCAGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGG‑CCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGGGTGAC‑GTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCG‑GTG‑CAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCAtt < 1:982537/156‑1 (MQ=39) ggTTCAGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGG‑CCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGGGTGAC‑GTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCG‑GTG‑CAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCAtt > 2:982537/1‑156 (MQ=39) tCAGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGG‑CCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGGGTGAC‑GTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCG‑GTG‑CAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGatat < 1:1270998/239‑1 (MQ=37) tCAGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGG‑CCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGGGTGAC‑GTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCG‑GTG‑CAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGatat < 1:1653745/239‑1 (MQ=37) 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ccccACCGGCGTGG‑CCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGGGTGAC‑GTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCG‑GTG‑CAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAaca < 1:162591/239‑1 (MQ=33) aCCGGCGTGG‑CCTGTTCGGTGCGCCCCGGCGGGGGGAC‑CTCCCGCCCTCCGGTCAATCCGCTGCTCC‑GGG‑CAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCCGCCCCCTCCCGTTTCATCCCCCCCCCACCCACCGCCGTTACCGGAGACAAACGCCCCCGCCGGTGGCGAGGCGCCGCCCCGGCCGGGAAACGGCTGCGCCTAACCGCCTACACCCGCGCGacacaccc > 2:2726042/1‑230 (MQ=2) cGGCGTGG‑CCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGGGTGAC‑GTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCG‑GTG‑CAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGa < 1:2703548/239‑1 (MQ=33) 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ATATATTCATGAAATATATATAAATATTTTCCTAATTGTTCTTATCTGACAGATATCTCACTTAAGGCTTTCTTATAAATCTGTAGGGTTTCGCCTGTCAGCAGACAAATAACCCGATAAAACAAGGATGAGCAGATGAGCGGAAAACCGGCGGCGCGTCAGGGCGACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTG‑TCCAGGGTTCAGCCGGGGTACGCATCGGTGCCCCCACCGGCGTGG‑CCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGGGTGAC‑GTCCGGCCATCCGGTCAATCCGCTGCTCG‑GTG‑CAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATTCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACACACTGATAC > NC_000913/729448‑729919 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |