New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2077808 = | 317 (1.290) | 8 (0.040) | 7/310 | 12.5 | 2.5% | coding (240/375 nt) | cbtA | CP4‑44 prophage; toxin of the YeeV‑YeeU toxin‑antitoxin system |
? | NC_000913 | 2077982 = | 336 (1.470) | pseudogene (43/168 nt) | yeeW | CP4‑44 prophage; uncharacterized protein;Phage or Prophage Related | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CGTTTTCAGCGGCCTTATTAATCAGTTCAGTGATATTAACACCATCAATGTCAACGACAATGTGCCCCATATCCAGCGCCTGTACGTTAACGCTGTCGGCTTCCAGTGTCATCATTTCGCCTCCGGATACTTACCCAGGGTAATGTTATTTACCGTTCTGTAATTGTCGCGGGTCATCAGGCCGGTCGCCCTGCGAGCCCGGAGGATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTACAGGCGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2078054‑2077808 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtacaggcgctgGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACCACAGAAACAGCACTGTTGTCCTGTATTAAGCAGGCAAGAGAAGA > NC_000913/2077982‑2078214 CGTTTTCAGCGGCCTTATTAATCAGTTCAGTGATATTAACACCATCAATGTCAACGACAATGTGCCCCATATCCAGCGCCTGTACGTTAACGCTGTCGGCTTCCAGTGTCATCATTTCGCCTCCGGATACTTACCCAGGGTAATGTTATTTACCGTTCTGTAATTGTCGCGGGTCATCAGGCCGGTCGCCCTGCGAGCCCGGAGGATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTAC < 1:1384241/239‑1 CGTTTTCAGCGGCCTTATTAATCAGTTCAGTGATATTAACACCATCAATGTCAACGACAATGTGCCCCATATCCAGCGCCTGTACGTTAACGCTGTCGGCTTCCAGTGTCATCATTTCGCCTCCGGATACTTACCCAGGGTAATGTTATTTACCGTTCTGTAATTGTCGCGGGTCATCAGGCCGGTCGCCCTGCGAGCCCGGAGGATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTAC > 2:35006/1‑239 TTTTCAGCGGCCTTATTAATCAGTTCAGTGATATTAACACAATCAATGTCAACGACAATGAGCCCCATATCCAGCGCCTGTACGTTAACGCTGTCGGCTTCCAGTGTCATCATTTCGCCTACGGATACTTACCCAGGGTAATCTTATTTACCGGTCCGTAATTGCCGCGGGTCCTCAGGCCGCACGCCCTGCGAGCTCGGAGGTATTCGATGCAGTTTATTAACACATAGCGGGTACAG > 2:3074319/1‑239 TTCAGCGGCCTTATTAATCAGTTCAGTGATATTAACACCATCAATGTCAACGACAATGTGCCCCATATCCAGCGCCTGTACGTTAACGCTGTCGGCTTCCAGTGTCATCATTTCGCCTCCGGATACTTACCCAGGGTAATGTTATTTACCGTTCTGTAATTGTCGCGGGTCATCAGGCCGGTCGCCCTGCGAGCCCGGAGGATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTACAGGC > 1:3486659/1‑239 TTCAGCGGCCTTATTAATCAGTTCAGTGATATTAACACCATCAATGTCAACGACAATGTGCCCCATATCCAGCGCCTGTACGTTAACGCTGTCGGCTTCCAGTGTCATCATTTCGCCTCCGGATACTTACCCAGGGTAATGTTATTTACCGTTCTGTAATTGTCGCGGGTCATCAGGCCGGTCGCCCTGCGAGCCCGGAGGATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTACAGGC > 2:1467038/1‑239 TCAATGTCAACGACAATGTGCCCCATATCCAGCGCCTGTACGTTAACGCTGTCGGCTTCCAGTGTCATCATTTCGCCTCCGGATACTTACCCAGGGTAATGTTATTTACCGTTCTGTAATTGTCGCGGGTCATCAGGCCGGTCGCCCTGCGAGCCCGGAGGATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTACAGGCGCT > 2:1398205/1‑202 TCAATGTCAACGACAATGTGCCCCATATCCAGCGCCTGTACGTTAACGCTGTCGGCTTCCAGTGTCATCATTTCGCCTCCGGATACTTACCCAGGGTAATGTTATTTACCGTTCTGTAATTGTCGCGGGTCATCAGGCCGGTCGCCCTGCGAGCCCGGAGGATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTACAGGCGCT < 1:1398205/202‑1 AACGCTGTCGGCTTCCAGTGTCATCATTTCGCCTCCGGATACTTACCCAGGGTAATGTTATTTACCGTTCTGTAATTGTCGCGGGTCATCAGGCCGGTCGCCCTGCGAGCCCGGAGGATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTAC < 1:206942/151‑1 AACGCTGTCGGCTTCCAGTGTCATCATTTCGCCTCCGGATACTTACCCAGGGTAATGTTATTTACCGTTCTGTAATTGTCGCGGGTCATCAGGCCGGTCGCCCTGCGAGCCCGGAGGATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTAC > 2:206942/1‑151 ACCCAGGGTAATGTTATTTACCGTTCTGTAATTGTCGCGGGTCATCAGGCCGGTCGCCCTGCGAGCCCGGAGGATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTACAG > 1:3295317/1‑109 ACCCAGGGTAATGTTATTTACCGTTCTGTAATTGTCGCGGGTCATCAGGCCGGTCGCCCTGCGAGCCCGGAGGATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTACAG < 2:3295317/109‑1 CAGGGTAATGTTATTTACCGTTCTGTAATTGTCGCGGGTCATCAGGCCGGTCGCCCTGCGAGCCCGGAGGATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTG > 2:94037/1‑163 CAGGGTAATGTTATTTACCGTTCTGTAATTGTCGCGGGTCATCAGGCCGGTCGCCCTGCGAGCCCGGAGGATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTG < 1:94037/163‑1 TTCTGTAATTGTCGCGGGTCATCAGGCCGGTCGCCCTGCGAGCCCGGAGGATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTACAGGCGC < 2:779347/90‑1 TTCTGTAATTGTCGCGGGTCATCAGGCCGGTCGCCCTGCGAGCCCGGAGGATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTACAGGCGC > 1:779347/1‑90 GTCGCGGGTCATCAGGCCGGTCGCCCTGCGAGCCCGGAGGATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGG > 1:967994/1‑143 GTCGCGGGTCATCAGGCCGGTCGCCCTGCGAGCCCGGAGGATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGG < 2:967994/143‑1 GTCATCAGGCCGGTCGCCCTGCGAGCCCGGAGGATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTACAGGCGC < 2:2300023/73‑1 GTCATCAGGCCGGTCGCCCTGCGAGCCCGGAGGATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTACAGGCGC > 1:2300023/1‑73 GTCGCCCTGCGAGCCCGGAGGATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTACAG < 2:1207346/57‑1 GTCGCCCTGCGAGCCCGGAGGATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTACAG > 1:1207346/1‑57 GATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTAC < 1:600221/35‑1 CTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGt > 2:13441/1‑55 CTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAA > 1:1586644/1‑191 CTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAA < 2:1586644/191‑1 CTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGA < 1:13441/56‑1 GTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTC < 1:1214986/96‑1 TACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTA < 1:1145011/197‑1 TACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTA > 2:1145011/1‑197 CAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACCACAGAAACAGCACTGTTGACCTGTATTAAGCAGGCAAGAGA > 2:404729/1‑239 CAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTG < 2:488750/174‑1 CAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTG > 1:488750/1‑174 CAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCG < 1:2640465/97‑1 CAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCG > 2:2640465/1‑97 CAGGCGCCGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACCACAGAAACAGCACTGTTGTCCTGTATTAAGCAGGCAAGAGA > 1:2592577/1‑239 AGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTG > 1:1582261/1‑59 AGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTG < 2:1582261/59‑1 AGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAA < 2:2449086/56‑1 AGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAA > 1:2449086/1‑56 cgtgGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGGTAATATCACTTAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAACCGGTTAGTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGGGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCGGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACCACAGAAACAGCACTGTTGTCCTGTATTAAGCAGGCAAGAGAAGA < 2:1574554/234‑1 CGCTGGATATGGGGCACATTGTTGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACCACAGAAACAGCACTGTTGTCCTGTATTAAGCAGGCAAGAGAAGA < 1:3351410/238‑1 CGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACCACAGAAACAGCACTGTTGTCCTGTATTAAGCAGGCAAGAGAAGA < 2:1407708/238‑1 CGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACCACAGAAACAGCACTGTTGTCCTGTATTAAGCAGGCAAGAGAAGA < 2:815902/238‑1 CGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACCACAGAAACAGCACTGTTGTCCTGTATTAAGCAGGCAAGAGAAGA < 1:2655991/238‑1 CGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACCACAGAAACAGCACTGTTGTCCTGTATTAAGCAGGCAAGAGAAGA < 2:2909788/238‑1 CGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACCACAGAAACAGCACTGTTGTCCTGTATTAAGCAGGCAAGAGAAGA < 1:1590710/238‑1 CGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACCACAGAAACAGCACTGTTGTCCTGTATTAAGCAGGCAAGAGAAGA < 1:1819156/238‑1 CGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACCACAGAAACAGCACTGTTGTCCTGTATTAAGCAGGCAAGAGAA < 2:145569/236‑1 CGCCGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACCACAGAAACAGCACTGTTGTCCTGTATTAAGCAGGCAAGAGAAGA < 2:2592577/238‑1 GCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACA < 1:177210/174‑1 GCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACA > 2:177210/1‑174 GCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACA > 1:2311276/1‑174 CTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGG > 2:2492986/1‑124 CTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGG < 1:2492986/124‑1 CTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGAT < 2:2720293/99‑1 CTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGAT > 1:2720293/1‑99 CTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGT > 1:2879427/1‑36 CTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGT < 2:2879427/36‑1 GGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATT < 1:140214/80‑1 GGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATT > 2:140214/1‑80 CGTTTTCAGCGGCCTTATTAATCAGTTCAGTGATATTAACACCATCAATGTCAACGACAATGTGCCCCATATCCAGCGCCTGTACGTTAACGCTGTCGGCTTCCAGTGTCATCATTTCGCCTCCGGATACTTACCCAGGGTAATGTTATTTACCGTTCTGTAATTGTCGCGGGTCATCAGGCCGGTCGCCCTGCGAGCCCGGAGGATATCGATGCTGTTTATTAACTGAGAGCGGGTACAGGCGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2078054‑2077808 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtacaggcgctgGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACCACAGAAACAGCACTGTTGTCCTGTATTAAGCAGGCAAGAGAAGA > NC_000913/2077982‑2078214 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |