New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 3563404 = | 228 (0.930) | 14 (0.060) | 12/320 | 10.5 | 5.9% | coding (1392/1506 nt) | glpD | sn‑glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase, aerobic, FAD/NAD(P)‑binding |
? | NC_000913 | 3563422 = | 225 (0.960) | coding (1410/1506 nt) | glpD | sn‑glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase, aerobic, FAD/NAD(P)‑binding | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
GACCGCGACGATTATGCCGCTCGCCTGCGCCGCCGCTATCCGTTCCTGACTGAATCGCTGGCGCGTCATTACGCTCGCACTTACGGCAGCAACAGCGAGCTGCTGCTCGGCAATGCGGGAACGGTAAGCGATCTCGGGGAAGATTTCGGTCATGAGTTCTACGAAGCGGAGCTGAAATACCTGGTGGATCACGAATGGGTCCGCCGCGCCGACGACGCCCTGTGGCGTCG‑CACAAAACAAGGCATGTGGCTAAATGCGGATCAACAATCTCGTGTGAGTCAGTGGCTGGTGGAGTATACGCAGCAGAGGTTATCGCTGGCGTCGTAAATTAACGTAAGGTGA‑TCAGGTCAGATTTCAATCTGGCCTGAGACTGATGACAAACACAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGTTTATGCAATATATTGAATTTGCATGGTCTTGTAGGCCAGATA > NC_000913/3563192‑3563657 | gACCGCGACGATTATGCCGCTCGCCTGCGCCGCCGCTATCCGTTCCTGACTGAATCGCTGGCGCGTCATTACGCTCGCACTTACGGCAGCAACAGCGAGCTGCTGCTCGGCCATGCGGGAACGGTAAGCGATCTCGGGGAAGCTTTCGGTCATGAGTTCTACGAAGCGGAGCTGACATACCCGGTGGATCACGCATGGGTCCGCCGCGGCGACGACTCCCTGTGGCGTCG‑CACAAACCa > 2:64994/1‑239 (MQ=255) gACCGCGACGATTATGCCGCTCGCCTGCGCCGCCGCTATCCGTTCCTGACTGAATCGCTGGCGCGTCATTACGCTCGCACTTACGGCAGCAACAGCGAGCTGCTGCTCGGCAATGCGGGAACGGTAAGCGATCTCGGGGAAGATTTCGGTCATGAGTTCTACGAAGCGGAGCTGAAATACCTGGTGGATCACGAATGGGTCCGCCGCGCCGACGACGCCCTGTGGCGTCG‑CACAAAACa > 1:3150376/1‑239 (MQ=255) aCCGCGACGATTATGCCGCTCGCCTGCGCCGCCGCTATCCGTTCCTGACTGATTCGCTGGCGCGTCATTACGCTCGCACTTACGGCAGCAACCGCGAGCTGATGCTCGGGAATGCGGGAACGGTAAGCGCTCTCGGGGAAGATTTTGGTCATGAGTTCTACGAAGCGGAGCTGAAAAACCGGCAGGACCACGAATGGGTCCGCCGCGCCGAAGACGCCCTGTGGCGACG‑GACAAAACaa > 2:2693014/1‑239 (MQ=255) ccGCGACGATTATGCCGCTCGCCTGCGCCGCCGCTATCCGTTCCTGACTGAATCGCTGGCGCGTCATTACGCTCGCACTTACGGCAGCAACAGCGAGCTGCTGCTCGGCAATGCGGGAACGGTAAGCGATCTCGGGGAAGATTTCGGTCATGAGTTCTACGAAGCGGAGCTGAAATACCTGGTGGACAACGAATGGGTCCCCCGCGCCGACGCCGCCCTGGGGCGTCGCCCCAAAACag > 2:501211/1‑238 (MQ=255) cgacgaTTATGCCGCTCGCCTGCGCCGCCGCTATCCGTTCCTGACTGAATCGCTGGCGCGTCATTACGCTCGCACTTACGGCAGCAACAGCGAGCTGCTGCTCGGCAATGCGGGAACGGTAAGCGATCTCGGGGAAGATTTCGGTCATGAGTTCTACGAAGCGGAGCTGAAATACCTGGTGGATCACGAATGGGTCCGCCGCGCCGACGACGCCCTGTGGCGTCG‑ca > 1:1614303/1‑227 (MQ=255) cgcccgccTGCGCCGCCGCTATCCGTTCCTGACTGAATCGCTGGCGCGTCATTACGCTCGCACTTACGGCAGCAACAGCGAGCTGCTGCTCGGCAATGCGGGAACGGTAAGCGATCTCGGGGAAGATTTCGGTCATGAGTTCTACGAAGCGGAGCTGAAATACCTGGTGGATCACGAATGGGTCCGCCGCGCCGACGACGCCCTGTGGCGTCG‑CACAAAACAAGGCATGTGGCTAAATg < 1:3084047/239‑1 (MQ=255) cGCTCGCGGCCGCCGCCAGTATCCGTTCCTGACTGAAGCGGTGGCGCGTAATTACGCTCGCCCTTACGGCAGCAACATCGAGCTGCTGGTCGGCAATGCGGGAACGGTAATCGATCTCGGGGAAGATTTCGGTAATGAGTTCTACGAAGCGGAGCTGAAATACCTGGTGGATCACGAATGGGTCCGCCGCGCCGACGACGCCCTGTGGCGTCG‑CACAAAACAAGGCATGTGGCTAAATg < 2:3150376/239‑1 (MQ=255) tCGCCTGCGCCGCCGCTATCCGTTCCTGACTGAATCGCTGGCGCGTCATTACGCTCGCACTTACGGCAGCAACAGCGAGCTGCTGCTCGGCAATGCGGGAACGGTAAGCGATCTCGGGGAAGATTTCGGTCATGAGTTCTACGAAGCGGAGCTGAAATACCTGGTGGATCACGAATGGGTCCGCCGCGCCGACGACGCCCTGTGGCGTCG‑CACAAAACAAGGCATGTGGCTAAATGCgg < 1:501211/239‑1 (MQ=255) cGCCTGCGCCGCCGCTATCCGTTCCTGACTGAATCGCTGGCGCGTCATTACGCTCGCACTTACGGCAGCAACAGCGAGCTGCTGCTCGGCAATGCGGGAACGGTAAGCGATCTCGGGGAAGATTTCGGTCCTGAGTTCTACGAAGCGGAGCCGAAATACCTGGTGGATCAAGAATGGGGCCGCCCCGCCGACGACCCCCTGTGGCGTCG‑GACAAAACAAGGAAAGAGGCCAAATggggc > 2:2881522/1‑238 (MQ=255) cGCCTGCGCCGCCGCTATCCGTTCCTGACTGAATCGCTGGCGCGTCATTACGCTCGCACTTACGGCAGCAACAGCGAGCTGCTGCTCGGCAATGCGGGAACGGTAAGCGATCTCGGGGAAGATTTCGGTCATGAGTTCTACGAAGCGGAGCTGAAATACCTGGTGGATCACGAATGGGTCCGCCGCGCCGACGACGCCCTGTGGCGGCG‑CCCAAAACAAGGCATGTGGCGACATGCggc > 2:3120034/1‑238 (MQ=255) 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ttCCTGACTGAATCGCTGGCGCGTCATTACGCTCGCACTTACGGCAGCAACAGCGAGCTGCTGCTCGGCAATGCGGGAACGGTAAGCGATCTCGGGGAAGATTTCGGTCATGAGTTCTACGAAGCGGAGCTGAAATACCTGGTGGATCACGAATGGGTCCGCCGCGCCGACGACGCCCTGTGGCGTCG‑CACAAAACAAGGCATGTGGCTAAATGCGGATCAACAATCTCGTGTGAGTCa < 2:3293495/239‑1 (MQ=255) tCCTGACTGAATCGCTGGCGCGTCATTACGCTCGCACTTACGGCAGCAACAGCGAGCTGCTGCTCGGCAATGCGGGAACGGTAAGCGATCTCGGGGAAGATTTCGGTCATGAGTTCTACGAAGCGGAGCTGAAATACCTGGTGGATCACGAATGGGTCCGCCGCGCCGACGACGCCCTGTGGCGTCG‑CACAAAACAAGGCATGTGGCTAAATGCGGATCAACAATCTCGTGTGAGTCa < 1:2787227/238‑1 (MQ=255) gccTGACTGAAGCGCTTGCGTGTCATTGCGCTCGCACTTACGGCAGCGACAGCGAGCTGCTGCTCGGCAATGCGGGAACGGTAAGCGATCTCGGGGAAGATTTCGGTCATGAGTTCTACGAAGCGGAGCTGAAATGCCTGGTGGATCACGAATGGGTCCGCCGCGCCGACGACGCCCTGTGGCGTCG‑CACAAAACAAGGCATGTGGCTAAATGCGGATCAACAATCTCGTGTGAGTCa < 2:862517/237‑1 (MQ=255) 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tCGCTGGCGCGTCATTACGCTCGCACTTACGGCAGCAACAGCGAGCTGCTGCTCGGCAATGCGGGAACGGTAAGCGATCTCGGGGAAGATTTCGGTCATGAGTTCTACGAAGCGGAGCTGAAATACCTGGTGGATCACGAATGGGTCCGCCGCGCCGACGACGCCCTGTGGCGTCG‑CACAAAACAAGGCATGTGGCTAAATGCGGATCAACAATCTCGTGTGAGTCAGTGGCTGGTGGa < 1:2949562/239‑1 (MQ=255) acTGGCGCGTAATTACGCTCGCACTTACGGCAACAACAGCGAGCTGCTGCGCGGCAATGCGGGAACGGCAAGAGATCTCGGGGAAGATTTCGGTAGTGAGTTCTGCGAAGCGGAGCTGAAATACCTGGTGGATCACGAAGGGGTCCGCCGCGCCGACGACGCCCGGTGGCGTCG‑CGCAAAACAAGGCAGGTGGCTAAATGCGGATCAACAATCTCGTGTGAGTCAGTGGCTGGTGGAGt < 2:1990283/238‑1 (MQ=255) tGGCGCGTCATTACGCTCGCACTTACGGCAGCAACAGCGAGCTGCTGCTCGGCAATGCGGGAACGGTAAGCGATCTCGGGGAAGATTTCGGTCATGAGTTCTACGAAGCGGAGCTGAAATACCTGGTGGATCACGAATGGGTCCGCCGCGCCGACGACGCCCTGTGGCGTCG‑CACAAAACAAGGCATGTGGCTAAATGCgg > 2:176659/1‑201 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |